short Open Reading Frame database: sorfs.org
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| 運用機関名: | Lab of bioinformatics and computational genomics (BIOBIX) |
| 運用機関所在国・地域: | ベルギー |
| 説明: | リボソームプロファイリングを用いて同定された 短いオープンリーディングフレーム(sORF) のデータベースです。リボソームプロファイリングからsORF を同定し、最先端のツールと測定基準を組み込み、結果を公開データベースに保存します。遺伝子の位置、転写範囲、機能、開始コドン、配列などを含んでいます。デフォルトのインターフェースは、sORF の一覧表示とクイック検索が可能であり、BioMart インターフェースは生物種、染色体番号、開始コドンなどによる高度な検索とエクスポートが可能です。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, RNA |
| タグ (データの種類): | 配列, リポジトリ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.x7pwnw |
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類似データベース:
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DoTS NCBI Gene PomBase dbSTS GSS miRBase Komugi GSP Genome - Genome information for rice Bioconductor EBI Genomes Pages |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |