休止
(14日以上)
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fpgp: Flowering Plant Gene Picker
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 顕花植物のゲノムをアノテーションするためのウェブサービスです。Oryza sativa、 Zea mays、 Arabidopsis thaliana、 Solanum lycopersicumなど１０種の顕花植物の報告された完全長 cDNA（FLcDNA）配列に基づいてエクソン－イントロン構造を予測し、また予測転写産物からタンパク質をコード化する領域を見つけます。ユーザーはDNA塩基配列を入力し、単子葉、双子葉の区別とタンパク質データベースを指定することで、予測結果を得られます。また、解析に用いられる10種の顕花植物のゲノムについて、遺伝子予測データをダウンロードすることが可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | cDNA/EST, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Full-Cryptosporidium Porphyra yezoensis (susabinori) EST dataset Dicty_cDB （アーカイブ） AphidBase HUGE TIGR Plant Transcript Assemblies rsoy dbCFC RBFL DB FuLoJa |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2014-11-18 |
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レコード最終更新日:
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2015-04-02 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |