SSBD:database: Systems Science of Biological Dynamics database
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| 運用機関名: | 特定国立研究開発法人理化学研究所 生命システム研究センター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | SSBDは生命動態の定量データとその取得に利用した動画像を再利用が容易なかたちで包括的に管理することを目的に構築されたデータベースです。単一分子、細胞、細胞核などのスケールにおける様々な手法により取得された様々な生物種のデータを収集しています。手法としては実験解析およびコンピュータシミュレーションともに対象としています。 定量データについては、新規に開発されたBiological Dynamics Markup Language (BDML)というデータフォーマットに従って表現されています。また動画像については、OMEROという世界標準になりつつある生命科学分野の動画像の管理システムを利用して管理されています。 本データベースに収録されているデータセットはダウンロード可能であり、各々の利用許諾にもとづいて利用することができます。 ユーザがデータを登録するSSBD:repositoryも紐づけられています。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | 細胞/オルガネラ |
| タグ (データの種類): | 画像/動画, リポジトリ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://ssbd.riken.jp/database/copyright/ |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://ssbd.riken.jp/database/contact/ |
| API / SPARQL endpoint: | http://ssbd.qbic.riken.jp/restfulapi/ |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/ssbd/desc.html |
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-000786 |
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類似データベース:
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Liverpool CCI OMERO OpenTein brainlife The Cell: An Image Library SICAS Medical Image Repository PODB3 OMERO Image Data Archive SCMD2 G-Node Data Infrastructure Services |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2013-10-23 |
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レコード最終更新日:
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2022-05-29 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |