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PCDq: Protein Complex Database with complex quality index
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| 運用機関名: | 産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 予測複合体を含めたヒト蛋白質複合体、それらの相互作用、さらにヒト蛋白質間相互作用情報のデータベースです。6つの既存の蛋白質間相互作用 （PPI）データベース (BIND、DIP、MINT、HPRD、IntActおよびGNP_Y2H)を整理統合し、それらのPPIネットワークの密な領域から蛋白質複合体を予測しました。さらに、それらを文献をもとに既知の複合体情報と照合し情報の付加や修正などの人手によるアノテーション (注釈づけ)を行いました。アノテーションの際には独自の蛋白質複合体の信頼性指標として品質管理指数 （complex quality index: CQI）を各複合体に付与しています。また複雑なネットワークを簡素に示す図を表示・編集できる機能PPI-Mapを提供しています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://www.h-invitational.jp/hinv/dataset/download.cgi |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/pcdq/desc.html |
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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http://medals.jp/list/detail/186.html |
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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PINT Interologous Interaction Database PPI view HINT HitPredict Agile Protein Interactomes Dataserver Molecular INTeraction Database Interaction Reference Index Web Interface VirusMentha INstruct |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2012-10-22 |
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レコード最終更新日:
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2022-01-20 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |