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TriFLDB: Triticeae Full-Length CDS Database
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | コムギ連作物であるコムギとオオムギの全長コード配列とアノテーション情報を提供しています（コムギ8,530件、オオムギ7,341件）。各全長コード配列につき、様々な配列データベースに対するブラストの結果や、シロイヌナズナ、イネおよびソルガムの相同配列による階層的クラスタ結果、InterProScanによるドメインの予測結果、ESTアライメントが視覚的に表示されます。 遺伝子機能やオントロジー(GO)タームによるキーワード検索や、ユーザの配列とコムギ、オオムギ、シロイヌナズナ、イネ、ソルガムとの相同性検索が行えます。 |
| 生物種: | , , , , |
| タグ （対象）: | cDNA/EST |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://trifldb.psc.riken.jp/download.pl |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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RBFL DB HarvEST TriMEDB Arabidopsis thaliana EST Index YOKOBAI (NC: green rice leafhopper) EST UNKA (BPH) EST bex-db RAFL cDNAs PMPj-Blast RIKEN BRC PLANT DATABASE SERCH - BLAST Search |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2015-05-15 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |