運用終了
GlycomeDB: The carbohydrate structures metadatabase
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | |
| URL: | |
| 運用機関名: | German Cancer Research Center |
| 運用機関所在国・地域: | ドイツ |
| 説明: | 糖鎖配列の構造情報を蓄積するためのXMLベースの配列記述フォーマット(GlycoCT)を定義し、公共データベース(CFG, KEGG, KEGG, GLYCOSCIENCES.de, BCSDB and Carbbank)の全糖鎖配列をGlycoCTに変換し、アノテーションとともにデータベースに収容しました。 構造の記述方法を統一したことによって異なるデータベース間のクロスリンクが可能となり、ユーザはこのデータベースを使用することで、5つの糖鎖構造データベースの構造情報を得ることができます。 検索したい構造を画面上で簡単に作成、入力できる構造検索、部分構造検索、類似構造検索、その他、生物種別の検索ができます。 2016年にGlyTouCanデータベース（http://glytoucan.org/ ）へのデータの移行に伴って、運用は終了しました。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | 糖質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 化学構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://www.glycome-db.org/showMenu.action?major=downloads |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
https://fairsharing.org/biodbcore-000353 |
|
類似データベース:
|
KCaM Search 糖鎖構造検索インターフェース（CFG単糖シンボルによる検索） UniCarbKB JMSDB GlycosideDB GlycoChemExplorer GlycoSuite GALAXY Glycan Structure 詳細ページ EROP-Moscow |
|
レコード管理者:
|
Integbio Database Catalog |
|
レコードの由来:
|
|
|
レコード公開日:
|
2011-12-08 |
|
レコード最終更新日:
|
2017-05-07 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons CC0 license |