ID: | NBDC00783 |
名称: | MassBase |
別称: | A comprehensive mass spectral tags archive for plant metabolomics |
URL: | http://webs2.kazusa.or.jp/massbase/index.php/ |
運用機関名: | 公益財団法人 かずさDNA研究所 (J-Globalへのリンク) |
運用機関所在国・地域: | 日本 |
説明: | MassBaseは代謝産物(メタボライト)に関するマススペクトラルタグ(MST)のアーカイブです。主に植物の生体サンプルやその代謝産物から得られた生のクロマトグラムデータおよびクロマトグラムデータを解析したテキストデータを収録しています。MassBankやKNApSAcKのような他のデータベースと組み合わせて興味のある代謝を理解するだけでなく、代謝物質ピークを抽出し、代謝物質をアノテイトするパイプライン・ソフトウェアを開発するためにも活用できます。全てのデータセットがダウンロード可能です。 |
生物種: | Acacia mangium (224085), Arabidopsis thaliana (3702), Cosmos bipinnatus (51277), Dicksonia antarctica (3271), Escherichia coli (562), Glycine max (3847), Hevea brasiliensis (3981), Jatropha curcas (180498), Lotus japonicus (34305), Medicago sativa (3879), Medicago truncatula (3880), Mus musculus (10090), Nicotiana tabacum (4097), Saccharomyces cerevisiae (4932), Solanum lycopersicum (4081), Solanum pimpinellifolium (4084), Thellungiella halophila (98038) |
タグ (対象): | 代謝物 |
タグ (データの種類): | 手法 |
論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
言語: | 英語 |
稼動状況: | 稼動中 |
一括ダウンロードデータへのリンク: | http://webs2.kazusa.or.jp/massbase/index.php?action=Massbase_ShowDownload |
一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://webs2.kazusa.or.jp/massbase/index.php?action=Massbase_DownloadAll&filename=README.txt&instrument_id=1&kind=readme |
データベースの利用許諾へのリンク: | http://webs2.kazusa.or.jp/massbase/index.php?action=Massbase_DownloadAll&filename=README.txt&instrument_id=1&kind=readme |
データベースの使い方 | ― |
データベースの連絡先: | ― |
API / SPARQL endpoint: | ― |