運用終了
Plant Repeat Databases
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| 名称: | |
| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | Michigan State University |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 12種類の植物の反復配列データベースを提供しているサイトです。各配列に含まれている反復配列は配列や構造の類似性を基にsuper-class, class, subclassに分類されています。主に塩基配列をBLASTにかけることで検索することができます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | DNA |
| タグ (データの種類): | 配列, 化学構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://plantrepeats.plantbiology.msu.edu/downloads.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://plantrepeats.plantbiology.msu.edu/composition.html |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Transmembrane Helices in Genome Sequences Dfam UniVec GeneAnnot HUMHOT VectorDB TranspoGene GISSD GIB-IS DPInteract |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2021-05-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |