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ASSETs: Alternative Splicing Sequence Enriched Tags
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 二つのマウス細胞株（メラノサイト、メラノーマ）由来の完全長cDNA ライブラリから選択的スプライシングライブラリ(Alternative Splicing Library: ASL)を構築し、そこから濃縮した選択的スプライシングクローン（Alternative Splicing Sequence TagS: ASSETS）の配列データを得ました。ASSETS の配列はスプライシングの上流と下流の配列を含んでいるためにマウスゲノムと配列と比較することで選択的スプライシングのパターンを知ることが可能となります。Watanuki et. al., Nature Methods (2004) のsupplementary informationです。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | cDNA/EST |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://genome.gsc.riken.jp/splicing/DLASSETs.htm |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://genome.gsc.riken.jp/splicing/DLASSETs.htm |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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TassDB2 DaphniaBASE ミヤコグサEST・完全長配列 TAB project LeEST ASTRA （アーカイブ） QFBASE PcsEST Budding yeast cDNA sequencing project BED |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2015-04-02 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |