ID: | NBDC00050 |
名称: | DOGAN |
別称: | a genome database of microorganisms sequenced at NITE |
URL: | http://www.bio.nite.go.jp/dogan/top |
運用機関名: | 独立行政法人製品評価技術基盤機構 (J-Globalへのリンク) |
運用機関所在国・地域: | 日本 |
説明: | NITEでゲノム解析した微生物のゲノムデータベースです。テキストと写真による詳細な菌株情報、塩基配列データ、ORFなどの遺伝子情報、遺伝子地図、プロテオーム解析結果を公開しています。これらの情報は、アノテーターによって確認されたものであり、時間の経過に即して再アノテーションも行っています。Blastを用いた相同性検索も行えます。 |
生物種: | Aeropyrum pernix K1 (272557), Anaerolinea thermophila UNI-1 (926569), Arthrospira platensis NIES-39 (696747), Aspergillus oryzae RIB40 (510516), Brevibacillus brevis NBRC 100599 (358681), Caldisericum exile AZM16c01 (511051), Corynebacterium efficiens YS-314 (196164), Deferribacter desulfuricans SSM1 (639282), Desulfovibrio magneticus RS-1 (573370), Gemmatimonas aurantiaca T-27 (379066), Kitasatospora setae (2066), Kocuria rhizophila DC2201 (378753), Methanocella paludicola SANAE (304371), Microlunatus phosphovorus NM-1 (1032480), Oscillibacter valericigenes Sjm18-20 (693746), Pyrococcus horikoshii OT3 (70601), Rhodococcus erythropolis PR4 (234621), Rhodococcus opacus B4 (632772), Saccharomyces cerevisiae Kyokai no. 7 (721032), Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 (718274), Sphingobium japonicum UT26S (452662), Sphingobium sp. SYK-6 (627192), Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2 (196620), Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 (158879), Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 (279808), Streptomyces avermitilis MA-4680 (227882), Sulfolobus tokodaii str. 7 (273063) |
タグ (対象): | ゲノム/遺伝子, タンパク質, 個体/種 |
タグ (データの種類): | バイオリソース, 手法, 配列, 画像/動画, 書誌/ドキュメント |
論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
言語: | 英語 |
稼動状況: | 運用終了 |
一括ダウンロードデータへのリンク: | http://www.bio.nite.go.jp/dogan/data_download/view |
一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
データベースの利用許諾へのリンク: | http://www.bio.nite.go.jp/dogan/top |
データベースの使い方 | ― |
データベースの連絡先: | ― |
API / SPARQL endpoint: | ― |