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Q-TARO: QTL Annotation Rice Online database
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 文献から集めたイネのQTL情報のデータベースです。 種々の文献検索サイトよりイネのQTL研究に関した文献情報を抽出し、最終的には1214件の論文から5096件のイネQTL情報を得ました。その上で、統計上検出された遺伝子座間相互作用あるいは遺伝子×環境間相互作用のQTLは排除しました。さらに染色体上の同一カ所に検出されたQTLを整理し、QTL物理位置の同じ形質名を持ち同じインターバルに検出されたQTLを統一することによって、冗長性の少ない代表的QTL情報を得ました。代表的QTLは、463件の論文に由来する1051件のQTL情報から構成されています（2008年3月31日現在）。これらの代表的QTL情報はSQL言語を用いて構造化され、表およびゲノムブラウザから関連情報を得ることができるQ-TARO (QTL Annotation Rice Online)データベースとして整理されました。2012年現在、新たなQTL情報の追加は行っていません。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性 |
| タグ (データの種類): | ― |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://qtaro.abr.affrc.go.jp/download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://qtaro.abr.affrc.go.jp/downloads/PDFmanual.pdf |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/qtaro/desc.html |
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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BGD Quantitative Trait Loci Archive OGRO THE CANDIDA ALBICANS PHYSICAL MAP WEBSITE Brown planthopper Maps & Markers Database VegMarks iDog DBcherry G-compass Brassica Genome |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2012-12-10 |
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レコード最終更新日:
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2022-01-20 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |