データベースのレコード一覧  (件数: )

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運用機関: Integrative Biomedical Informatics Group (IBI), Research Programme on Biomedical Informatics (GRIB) IMIM-UPF
生物種: Homo sapiens
説明: ヒト疾患に関与する遺伝子および変異体を利用可能な最大級のコレクションを収録した発見のためのプラットフォームです。専門家のキュレーションされたリポジトリ、GWASカタログ、動物モデル... 詳細へ
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運用機関: University of Maryland
生物種: Bacteria
説明: 細菌ドメイン中の転写因子結合部位(TFBS)のデータベースです。カスタマイズ可能なナビゲーションおよびデータ抽出機能、コミュニティに対する意義、保存されたデータの品質と詳細、保存さ... 詳細へ
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運用機関: Ragon Institute, SBMRI, Sanford-Burnham Prebys Medical Discovery Institute, TSRI
生物種: Homo sapiens | Human immunodeficiency virus
説明: 広域中和抗体(bNAb)の発見は、HIVワクチン研究および免疫学全体に大きな刺激を与えています。中和プロファイル、配列、および三次元構造(利用可能な場合)を含む、急速な増加を遂げている... 詳細へ
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運用機関: National Centre for Biotechnolgy (CNB)
生物種: Drosophila melanogaster | Homo sapiens
説明: 文献および他のリソースで報告されたヒトおよびショウジョウバエの中心体遺伝子のコレクションです。本データベースを利用して、中心体の進化、機能および構造を研究することができます。遺... 詳細へ
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運用機関: Laboratory of Andrej Sali, University of California at San Francisco (UCSF)
生物種: All
説明: アノテーションが付されたタンパク質構造比較モデルのデータベースです。モデルは、自動モデリングパイプラインの ModPipe により計算されます。ModPipe は、折り畳み割り当て、配列構造のア... 詳細へ
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運用機関:
生物種:
説明: 解析された機能的ゲノミクス実験のためのオープンなウェブリソースです。本データベースは、注目度の高い公共のデータセットを注意深くかつ透明性高い手法で再解析し、注釈を付けることによ... 詳細へ
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運用機関: Michael Baudis Group, Institute of Molecular Life Sciences, SIB Swiss Institute of Bioinformatics
生物種: Homo sapiens
説明: arrayMap データベースとバイオインフォマティクスのリソースは、ヒト癌の遺伝学的研究を促進します。Progenetix プロジェクトは、利用可能なデータをマイニングするためのデータカスタマイ... 詳細へ
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運用機関: Michael Baudis Group, Institute of Molecular Life Sciences
生物種: Homo sapiens
説明: 比較ゲノムハイブリダイゼーション(CGH)実験から得られた、ヒト癌におけるコピー数異常の概要を提供するデータベースです。1,016 件の出版物に含まれる 30,817 件の症例(2013年10月)を収... 詳細へ
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運用機関: University of Porto
生物種: Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | Homo sapiens | Macaca mulatta | Mus musculus | ...
説明: ミトコンドリアDNA(mtDNA)再編成に関するキュレーションされたデータセットを含む包括的なオンラインリソースです。 詳細へ
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運用機関: University of Missouri
生物種: Glycine max
説明: 大豆翻訳ゲノミクスと分子育種のために開発された総合的かつインクルーシブなウェブリソースです。SoyKBは、遺伝子/タンパク質、miRNA / sRNA、代謝産物、SNP、植物導入(PI系)および形質に... 詳細へ
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運用機関: European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
生物種: All | Anopheles gambiae | Arabidopsis thaliana | Bos indicus | Bos taurus | ...
説明: EBI Metagenomics は 対象範囲変更にあわせて名称をMgnifyに変更しました。こちらはすべてのメタゲノミクス研究者を支援することを目的とした、自由に利用可能なリソースです。メタゲノムデ... 詳細へ
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運用機関: GigaScience/BGI HK Ltd
生物種: All
説明: 主に、GigaScience の記事に関連するデータとツールを提供するリポジトリとして機能しています。ただし、GigaScience の記事に関連付けられていないデータセットのサブセットも含まれていま... 詳細へ
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運用機関: Yale University School of Medicine
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: 本データベースは、脊椎動物の OR 遺伝子およびタンパク質のデータベースとして運用が開始されました。その後、この拡張を続けるファミリーに関する包括的なアーカイブと検索ツールを提供す... 詳細へ
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運用機関: Washington University in St Louis School of Medicine
生物種: Saccharomyces cerevisiae
説明: サッカロミセス(Saccharomyces)種の転写因子に対する位置特異的行列(PWM:position weight matrices)のデータベースです。in vivo データを最もよく予測する各 TF の単一の行列を特定し... 詳細へ
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運用機関: University of Wisconsin-Madison
生物種: All
説明: ゲノム配列データおよび遺伝子発現データを保存、更新、および配布するために開発された、関係データベースおよびウェブインターフェースです。コミュニィの研究者らが、ゲノムに対し、容易... 詳細へ
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運用機関: University of Toronto
生物種: Escherichia coli
説明: 大腸菌に関する知識ベースとして、タンパク質 - タンパク質間の物理的相互作用と機能的相互作用を統合したデータベースです。 詳細へ
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運用機関: University of Tartu
生物種: Fungi
説明: 本データベースは、主として真菌の rDNA 内部転写スペーサー(ITS)配列を扱うデータベースですが、遺伝子および遺伝子マーカーのデータも歓迎しています。専門家によって収集・同定され、公... 詳細へ
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運用機関: University of Nebraska Medical Center
生物種: All
説明: Protein Data Bank(PDB)、Swiss-Prot Protein Knowledgebase、PubMed National Library of Medicine からデータを収集したデータベースです。100 個未満のアミノ酸残基からなる、成熟した... 詳細へ
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運用機関: The National Autonomous University of Mexico at the Center for Genomic Sciences, University of Mexico
生物種: Escherichia coli
説明: RegulonDB は、細胞の転写開始または調節ネットワークを調節する複雑なモデルです。一方で、転写単位、オペロン、シンプルなレギュロンおよび複雑なレギュロンにおける遺伝子の構成のモデル... 詳細へ
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運用機関: University of Leiden
生物種: Anopheles gambiae | Bacillus subtilis | Bombyx mori | Bordetella pertussis | Bos taurus | ...
説明: 科学コミュニティの研究者が検索可能なように設計された RNA シュードノットのコレクションです。 詳細へ
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運用機関: University of Helsinki
生物種: Homo sapiens
説明: 腫瘍サンプルおよびマイクロアレイデータに関する臨床情報のコレクションです。アレイ比較ゲノムハイブリダイゼーション(aCGH:array comparative genomic hybridization)および遺伝子コピ... 詳細へ
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運用機関: Georgetown University, Protein Information Resource Consortium, University of Delaware
生物種: All
説明: アミノ末端、カルボキシル末端およびペプチド鎖のクロスリンク翻訳後修飾を含むタンパク質修飾のためのアノテーションおよび構造の包括的なコレクションです。 詳細へ
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運用機関: University of Cologne
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: ヒトおよびマウスの免疫グロブリン遺伝子座に由来する生殖系列可変遺伝子の統合データベースです。全ての可変遺伝子配列は EMBL-Bank から抽出されたものです。 詳細へ
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運用機関: University of California Los Angeles
生物種: Mus musculus
説明: ノックアウト変異マウスの系統です。KOMP リポジトリは、マウスのゲノム中のすべての遺伝子にヌル突然変異を含むマウス胚性幹(ES)細胞のリソースです。 詳細へ
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運用機関: Institute for Genomics and Bioinformatics, University of California, Irvine, University of California Los Angeles
生物種:
説明: システム生物学における合成ビルディングブロック、プローブとして、そして薬物および他の有用な化合物の発見のためのリードとして使用する上で重要な、約 500 万の商業的に入手可能な小分子... 詳細へ
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運用機関: University of Athens
生物種: All
説明: G タンパク質と その GPCR およびエフェクター分子との相互作用に関する、公的にアクセス可能な、関係データベースです。配列は、広範な文献検索に基づいて、異なるクラス、ファミリーおよび... 詳細へ
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運用機関: Universite de Geneve
生物種: Bacteria | Eukaryota | Vertebrata
説明: 真核生物のオーソロガスなタンパク質コード遺伝子のカタログを提供するリソースです。オーソロジーとは、検討対象の種の最後の共通の祖先を意味します。したがって、OrthoDB は種の系統に沿... 詳細へ
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運用機関: Toronto Hospital for Sick Children
生物種: All
説明: 10 種類の相互作用データベース(BioGRID、BIND、CORUM、DIP、HPRD、INTACT、MINT、MPPI、MPACTおよびOPHID)から得られたタンパク質相互作用データを統合した相互作用参照インデックス(iRe... 詳細へ
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運用機関:
生物種:
説明: さまざまなアスペルギルス属の配列およびアノテーション付けプロジェクトから得られたアノテーション付き遺伝子データを閲覧できるリソースです。 詳細へ
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運用機関:
生物種: All
説明: 毒物ゲノミクスデータの統合公開リポジトリです。研究デザインおよびスケジュール、臨床化学的および組織病理学的所見、ならびにマイクロアレイデータおよびプロテオミクスデータが含まれま... 詳細へ
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運用機関: University of California Los Angeles, University of Missouri, University of North Carolina, The Jackson Laboratory
生物種: Mus musculus
説明: 科学的に価値のある遺伝子改変マウス系統およびマウスES細胞株を、遺伝学研究および生物医学研究コミュニティにとって潜在的価値を有するものとして配布および凍結保存するリソースです。 詳細へ
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運用機関: The Jackson Laboratory
生物種: Mus musculus
説明: JAX Mice は、人間の病気をよりよく理解するための、正確なゲノム解を使用した動物モデル研究の業界標準です。精密な動物健康プログラム(Animal Health Programs)と厳格な遺伝的品質基準か... 詳細へ
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運用機関: Frederick National Laboratory for Cancer Research, University of Arkansas for Medical Sciences
生物種: Homo sapiens
説明: 誰でもアクセス・ダウンロードすることが可能な、癌の医療画像の大規模なアーカイブです。すべての画像は DICOM ファイル形式で保存されています。画像は、一般的な疾患(肺癌など)の患者、... 詳細へ
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運用機関: SIB Swiss Institute of Bioinformatics
生物種: All
説明: 手作業で付されたタンパク質のアノテーションに基づき、タンパク質を同定し、半自動的にアノテーション付けするシステムです。よく保存されたファミリーまたはサブファミリーの一部であるタ... 詳細へ
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運用機関: Thomas lab, University of Southern California
生物種: All
説明: 遺伝子を機能により分類するユニークなリソースです。公開された科学的な実験エビデンスおよび進化的関係を使用して、実験で得られた直接的なエビデンスがない場合にも、遺伝子の機能を予測... 詳細へ
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運用機関: SRI International
生物種: Homo sapiens
説明: ヒトの代謝経路とヒトゲノムを記述するバイオインフォマティクスデータベースです。代謝経路を、ヒトゲノムを系統立てるための枠組みとして提示することにより、ゲノムレベルでユーザーが行... 詳細へ
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運用機関:
生物種: All
説明: あらゆる生物界の生命から得られたペルオキシダーゼ配列へのアクセスを提供するデータベースです。また、これらの配列を分析するのに適した一連のバイオインフォマティクスツールおよびサー... 詳細へ
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運用機関: Structural Bioinformatics and Network Biology Group
生物種: All
説明: 高分解能で三次元構造が解明されているタンパク質におけるドメイン - ドメイン間相互作用のコレクションです。3did は、構造情報を利用し、相互作用がどのように起こるかを理解する上で必要... 詳細へ
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運用機関:
生物種:
説明: Protein Data Bank にアーカイブされたタンパク質、核酸、複雑なアセンブリの三次元形状により補強されたリソースです。学生や研究者がタンパク質合成から健康や疾患に至る生物医学と農業の... 詳細へ
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運用機関: Rutgers, The State University of New Jersey
生物種: All
説明: タンパク質と核酸に結合した小分子に関する情報を見つけるためのデータリソースです。 詳細へ
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運用機関: Royal Society of Chemistry
生物種:
説明: ウェブ全体から収集した、化合物に関する情報を自由に利用することができるコレクションです。化学構造および関連情報を、単一の検索可能なリポジトリエントリーに集約しています。これらの... 詳細へ
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運用機関: PRABI, Rhone-Alpes Bioinformatics Center
生物種: All
説明: PRIAM は英語で、代謝経路予測のための酵素特異的プロファイルを表します。PRIAM は、ENZYME データベースで利用可能なすべての配列に基づき、完全に配列決定されたゲノム内の酵素を自動的に... 詳細へ
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運用機関: Georgetown University Medical Center, PIR, University of Delaware, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
生物種: All
説明: PIR SuperFamily のコンセプトを使用して、UniProtKB 配列を包括的かつ非重複的にクラスタリングし、進化の関係を表す階層的順序として提供するデータベースです。 詳細へ
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運用機関: Princeton University, Samuel Lunenfeld Research Institute, Mount Sinai Hospital, University of Edinburgh, University of Montreal
生物種: Arabidopsis thaliana | Drosophila melanogaster | Saccharomyces cerevisiae | Schizosaccharomyces pombe
説明: 包括的なキュレーションの取り組みによって収集されたデータを収録した、生物学的な相互作用のリポジトリです。BioGRID は現在、98万件を超える相互作用を収録しています。これらは、5万5,00... 詳細へ
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運用機関: NINDS NIH
生物種: Homo sapiens
説明: 臨床研究データをウェブベースで入力できるようにすることで、パーキンソン病(PD)研究コミュニティ全体にわたる広いデータ共有(イメージング、臨床、遺伝的、生物特異的分析)を可能とし... 詳細へ
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運用機関: US National Institute of Mental Health (NIMH)
生物種: Homo sapiens
説明: 自閉スペクトラム障害関連データのための拡張可能でスケーラブルな情報科学プラットフォームです(テキスト、数値、画像、時系列など)。すべてのレベルの生物学的および行動的組織(分子、... 詳細へ
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運用機関: Churchill Group, The Jackson Laboratory
生物種: Mus musculus
説明: げっ歯類近交系の交配を用いた様々なQTL(量的形質遺伝子座)研究からの生データへのアクセスを提供するアーカイブです。データは、R/qtl および疑似マーカープログラムで使用可能な csv 形... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Homo sapiens
説明: 本ウェブサイトは、完了した治験の結果得られたデータを研究者および一般市民に普及させ、新規研究を促し、さらなる分析を奨励するとともに、コミュニティに情報を発信することができる電子... 詳細へ
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運用機関: ICPSR, Institute for Social Research
生物種: Homo sapiens | Human immunodeficiency virus
説明: 麻薬中毒やHIV研究に関連するデータを取得、保存、発信することができるツールです。広範な合法・違法薬物(アルコール、タバコ、マリファナ、コカイン、合成薬など)をカバーし、薬物使用の... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Homo sapiens
説明: Neuroimaging Informatics Tools and Resources Collaboratory (NITRC) は機能的および構造的なニューロイメージング解析のためのイメージングリソース(人気のツールの他、研究室やサイバー... 詳細へ