データベースのレコード一覧  (件数: )

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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種: Mus musculus
説明: CAGE法によって集められたRNAライブラリやCAGEライブラリなどのデータを検索、閲覧するシステムです。CAGE(Cap Analysis Gene Expression)法とは、遺伝子プロモーター領域を効率よく同定でき... 詳細へ
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運用終了
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運用機関: Fred Hutchinson Cancer Research Center
生物種: Homo sapiens
説明: 類似タンパク質のアミノ酸配列のマルチプルアライメントから自動的に抽出したモチーフのデータベースです。 詳細へ
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運用機関: SRI International
生物種: Agrobacterium tumefaciens | Bacillus subtilis | Caulobacter vibrioides | Chlamydia trachomatis | Escherichia coli O157:H7 | ...
説明: 各種生物の代謝マップが納められたパスウェイデータベースです。 詳細へ
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運用終了
Bio-Resourse Network
運用機関: 独立行政法人科学技術振興機構
生物種:
説明: Bio-Resourse Networkの各種システムは、微生物株の分類同定を支援し、ユーザの研究資材データベース作成を支援します。 詳細へ
運用機関: 研究用植物データベース作成グループ
生物種: Embryophyta
説明: 施設に保存されている研究用植物のデータベース。日本全国の植物園などの施設に系統保存されている植物データの登録・公開を行っています。 詳細へ
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運用機関: The Consortium for the Barcode of Life (CBOL)
生物種:
説明: DNAバーコード (生物種を特徴付ける短いDNA配列)のデータベースです。 以下の4つのデータベースで構成されています。 (1)「Public Data Portal」 公開されたバーコード情報を収録したデ... 詳細へ
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運用機関: Bird Studies Canada
生物種: Aves
説明: 全世界に生息する鳥に関するデータベース。鳥の分布、分類、同義語、各言語での名称表記法(日本語もある)等を見ることができ、分布は世界地図(画像)で見ることができます。鳥の調査のた... 詳細へ
運用機関: The National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
生物種: Anopheles gambiae | Aedes aegypti
説明: ガンビエハマダラカ、ネッタイシマカなどのマラリアを媒介する蚊の種名情報やゲノム情報のデータベースです。 詳細へ
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運用機関: American Museum of Natural History
生物種: Amphibia
説明: 世界に生息する両性類の種のデータベース。階層化された両生類の生物学上の分類が表示され、各分類(網:class、目:order、科:family、亜科:subfamily、属:genus、種:species)ついて同義語、... 詳細へ
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運用機関: Johns Hopkins University
生物種: Homo sapiens
説明: ヒト血漿タンパク質とそのisoformの包括的リソースです。Isoform特異的発現、関連する疾患、局在、翻訳後修飾、一塩基多型の情報が収集されています。このデータベースで提供される情報は、... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種: Homo sapiens | Canis lupus familiaris | Macaca mulatta | Pan troglodytes | Mus musculus | ...
説明: 大規模なゲノム構造変異(挿入、欠失、転座、逆位など)に関する情報を収録しています。 詳細へ
運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: クロマチン修飾(ヒストン修飾、DNAメチル化、DNA分解酵素フットプリント法)のゲノム網羅的研究結果を収録しています。一研究につき、サンプル情報、アッセイの種類、データソース、文献情... 詳細へ
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運用機関: Weizmann Institute of Science
生物種: Homo sapiens
説明: オーソロジー、疾患関連、SNPs、遺伝子発現、遺伝子機能はもちろん、広範囲に存在するゲノミクス、プロテオミクス、トランスクリプトミクス情報を効率よく検索できるようにしたヒトゲノム情... 詳細へ
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運用機関: Swiss Institute of Bioinformatics
生物種:
説明: タンパク質のファミリーやドメインに関するデータベースで、主にUniProtKB/Swiss-Protエントリーのドメイン機能のアノテーションに使用されています。現在、1,000以上のファミリーやドメイン... 詳細へ
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運用機関: 東北大学 加齢医学研究所
生物種: Mus musculus | Rattus norvegicus | Cavia porcellus | Canis lupus familiaris | Oryctolagus cuniculus | ...
説明: この一覧表は、全国の研究者にアンケートを送って移植腫瘍の情報を収集し、まとめたものです。1,002株の情報が収められています。 詳細へ
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運用機関: 富山大学 和漢医薬学総合研究所
生物種:
説明: 民族薬物データベースには、民族薬物資料館に保管されている生薬の標本情報及び学術情報が収録されています。その内、和漢薬4,800点(英語3,500点)、ユナニー生薬177点、タイ生薬668点、ア... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 作物研究所
生物種: Glycine max
説明: 二次元電気泳動および電気泳動を介さない方法によるダイズのプロテオーム解析の結果を主に収録しているデータベースです。ダイズの各器官に存在するタンパク質や細胞内局在性を示すタンパク... 詳細へ
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運用機関: 九州大学 大学院農学研究院
生物種: Apoidea
説明: 熱帯アジア産ハナバチ類文献データベース(TABR)は、熱帯・亜熱帯アジア産ハナバチ類に関する主要な文献について、掲載された各文献中のハナバチの分類単位(種、属、科等の学名)を一つのレコ... 詳細へ
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運用機関: 京都工芸繊維大学 ショウジョウバエ遺伝資源センター
生物種: Drosophila melanogaster
説明: ショウジョウバエにおいてGal4-UAS法に基づくエンハンサートラップ系統をNPコンソーシアムとして約4600の挿入系統を作成し、それらのすべてについてエンハンサー活性を胚および幼虫にお... 詳細へ
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運用機関: 東京薬科大学 薬学部
生物種:
説明: 3次元医薬品構造データベース(3DPSD)は医療用医薬品の3次元構造を格納したデータベースで、全ての構造データを公開しています。3DPSDは医薬品の一般名(英名)をアルファベット順に収納し... 詳細へ
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運用終了
AgriTOGO:  農林水産生物ゲノム情報統合データベース
運用機関: 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
説明: 農林水産生物ゲノム情報統合データベースは、農林水産省の研究の成果として公開している情報を統合し、より価値の高い情報を発信することを目的としています。統合検索システム、統合データ... 詳細へ
運用機関: 新潟大学 脳研究所 基礎神経科学部門 分子神経生物学分野
生物種: Homo sapiens
説明: 高感度の放射活性を利用したDNAアレイを利用して、統合失調症の脳3領域における病態遺伝子プロファイルを取得し、約2-3000個の主要な既知遺伝子mRNAの発現変化率とその個人差を解析した結果... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種: Embryophyta
説明: 平成8年度より植物細胞開発銀行が提供をおこなっていた植物培養細胞のカタログです。植物細胞開発銀行の業務は2001年4月より理化学研究所バイオリソースセンターに移管しており、現在では実... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種: Embryophyta
説明: 平成8年度より植物細胞開発銀行より提供をおこなっていた遺伝子材料について引き続き実験植物開発室より提供を行なっています。 詳細へ
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運用機関: 法政大学
生物種: Mastigophora | Sarcodia | Ciliophora | Stramenopiles | Chlorophyta | ...
説明: 原生生物とその他の微生物の画像(静止画 81037枚、内訳:総計765属、3203種、15434サンプル、および、動画 2261クリップ、淡水産が主)と関連情報を提供しています。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa Japonica Group
説明: 農業生物資源研究所遺伝子機能研究チームは、イネの遺伝子破壊系統を内在性トランスポゾン(Tos17)を転移させて作成しています。このデータベースではトランスポゾンに隣接する塩基配列を検索... 詳細へ
運用機関: 東京大学 大学院農学生命科学研究科
生物種: Bombyx mori
説明: カイコの完全長cDNAデータベースです。カイコ完全長cDNA末端塩基配列データベース、カイコEST塩基配列データベース(SilkBase: http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00203 ) を対象にし... 詳細へ
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運用機関: 大阪市立大学 大学院理学研究科
生物種: Saccharomyces | Schizosaccharomyces pombe
説明: 分裂、出芽酵母株の菌株、プラスミド、ライブラリ、完全長cDNAなどのリソースの検索が可能です。また、それらの分与申し込みも可能です。 詳細へ
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運用機関: 広島大学 大学院理学研究科附属両生類研究施設
生物種: Xenopus tropicalis
説明: NBRPネッタイツメガエルのプロジェクトは平成24年3月に終了し、同6月に新規事業として再スタートしました。過去に収集されたネッタイツメガエルの近交化、標準系統の樹立、および、その保存... 詳細へ
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運用機関: 自然科学研究機構 基礎生物学研究所
生物種: Xenopus laevis
説明: アフリカツメガエル(Xenopus laevis)のEST、そのアセンブリ、WISH画像が登録されています。アセンブリは、NCBI-NR, UniGene(X.laevis), TIGR-XGI, Xenopus protein databse (NIH) を対象にし... 詳細へ
運用機関: 東京工業大学 大学院生命理工学研究科
生物種: Vibrio parahaemolyticus
説明: 腸炎ビブリオ菌の全ゲノム配列およびアノテーションを掲載したデータベースです。ゲノムビューワやrRNAおよびtRNAの表、ORF検索、遺伝子検索、ブラスト検索などが利用できます。データ全体の... 詳細へ
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運用機関: 東京大学 大学院新領域創成科学研究科
生物種: Oryzias latipes
説明: UTGB (University of Tokyo Genome Browser) を利用したメダカに関するゲノムブラウザです。予測遺伝子、EST、GC含有量、繰り返しと比較ゲノミクスなど基本的な情報をブラウズできます。また... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: 遺伝子型決定や遺伝子発現解析、SNP解析、ゲノムマッピング、遺伝子サイレンシングなどの研究に用いられる核酸プローブ情報を登録するデータベースです。各プローブにつき、配列、文献、実験... 詳細へ
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運用機関: UniProt Consortium
生物種:
説明: アミノ酸配列とその機能情報を掲載している代表的なデータベースです。「UniProtKB」、「UniRef」、「UniParc」の3種類のデータベースから構成されています。 UniProtKB: 文献情報などを元に... 詳細へ
運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種: All
説明: 転写産物の非冗長配列セット(クラスター)を自動的に生成し、収録しています。各クラスターは別々の遺伝子、あるいは発現偽遺伝子を表し、クラスタごとに相同タンパク、遺伝子発現、ゲノム... 詳細へ
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運用機関: University of California, Santa Cruz
生物種: Mammalia | Vertebrata | Deuterostomia | Hexapoda | Nematoda | ...
説明: ゲノム解読がなされている真核生物を対象として自動アノテーションを行い、その結果をゲノムブラウザ/データベースとして公開しているプロジェクトです。ゲノム上にマッピングされた様々な分... 詳細へ
運用機関: 九州工業大学
生物種:
説明: 遺伝子発現は転写だけでなく、翻訳のレベルでも制御されています。そこで、mRNAの翻訳レベルでのシグナル配列と機能活性データを集めたデータベースを構築しました。現在、18種類のウィルス... 詳細へ
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運用終了
TraP:  Transcription Product Database
運用機関: 独立行政法人産業技術総合研究所
生物種: Aeropyrum pernix | Archaeoglobus fulgidus | Methanobacterium thermoautotrophicum | Methanococcus jannaschii | Pyrococcus abyssi | ...
説明: 古細菌7種の間で、代謝経路(解糖系、TCA回路、電子伝達系、アミノ酸生合成、核酸生合成)を比較したデータベースです。種による差分のハイライト表示が可能です。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種: Arabidopsis thaliana
説明: 理研ゲノム科学総合研究センター植物ゲノム機能情報研究グループ植物変異開発研究チームより寄託を受けたトランスポゾンタグライン(第1および第5染色体上に存在するDs因子の転移により挿... 詳細へ
運用機関: Tel Aviv University
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Gallus gallus | Danio rerio | Drosophila melanogaster | ...
説明: 7生物種のタンパク質コード領域に存在する可動性遺伝因子Transposed Elements (TEs) のデータベースです。TEsの種類やファミリー、ホスト遺伝子に関する情報が収録されています。 詳細へ
運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学
生物種: Escherichia coli
説明: 大腸菌2成分制御系の欠失変異株における遺伝子発現プロファイルのマイクロアレイ解析データを公開しています。2成分制御系により影響を受ける遺伝子情報や細胞機能の解析が可能です。 ※2012... 詳細へ
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運用機関: 東京大学 大学院薬学系研究科
生物種: Homo sapiens |
Rattus
| Mus |
Cercopithecidaes
説明: 薬物体内動態を規定する重要な役割を果たしていることが想定される薬物トランスポーターに関する情報を収集したデータベースです。情報は文献から抽出されたものです。 このデータベースは以... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種: Nicotiana tabacum
説明: 理研植物科学研究センター(PSC)より寄託を受けたタバコBY-2培養細胞ESTクローンのキーワード検索ができます。キーワードには、リソース番号(BRC)、BY-2 EST clone name、DDBJ accession nu... 詳細へ
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運用機関: 地方国立研究開発法人東京都健康長寿医療センター
生物種: Homo sapiens
説明: 老化の指標となるタンパク質についての二次元電気泳動実験結果を掲載したデータベースです。 詳細へ
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運用機関: 京都大学 大学院医学研究科 附属動物実験施設
生物種: Rattus norvegicus
説明: ラットの系統、特性、研究対象分野の検索、分与申し込みのサービスを提供しているサイトです。ラット資源の保存情報、世代数、特性や繁殖方法、参考文献などの情報が提供されています。 詳細へ
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運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科
生物種: Mus musculus
説明: マウスES細胞に対して新規の遺伝子トラップ法(UPATrap)を用い、ランダムな遺伝子破壊変異株を作成しました。トラップされた遺伝子の配列と、さらにはその配列に基づいて作成したDNAマイクロ... 詳細へ
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運用機関: University of Reading
生物種:
説明: Species 2000は、生物多様性研究の基本となるデータセットとして、現在知られている地球上の生物(動物、植物、菌類、微生物)の種を全て列挙し、地球生物種カタログの作成を目指しているプ... 詳細へ
運用機関: 九州大学 大学院生物資源環境科学府
生物種:
説明: 遺伝子発現や細胞増殖を制御する膨大なシグナル伝達パスウェイ情報を整理し、可視化したデータベースです。SPADでは、細胞内シグナルパスウエイの引き金となる細胞外シグナル分子に基づき、... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: 1~数塩基の置換、挿入/欠失、反復等の多型情報からなるデータベースです。各SNPについて、集団間での多型頻度の違いを視覚的に比較することもできます。 詳細へ
運用機関: 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種: Homo sapiens | Pan troglodytes | Pan paniscus | Gorilla gorilla | Pongo pygmaeus | ...
説明: チンパンジーおよびゴリラの塩基配列、ヒトと類人猿の塩基配列の比較結果、類人猿ゲノム計画(Silver)で決定した塩基配列を基にした比較結果を掲載している。 詳細へ