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データベースのレコード一覧 (件数:
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MutationView
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトの疾患の原因遺伝子に関するデータベースです。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検索、表示ができます。例えば目の病気...
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運用終了
MusBanks: A portal to worldwide mutant databases
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
マウスの変異に関して、MEDLINE等の文献と世界のマウス変異データベースから情報を収集したデータベースです。キーワード検索が可能です。
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MTB Database: Mouse Tumor Biology Database
運用機関:
The Jackson Laboratory
生物種:
Mus musculus
説明:
様々な要因で発生したマウスの腫瘍に関する情報を提供しています。腫瘍発生頻度、潜伏期間、系統、臓器などの様々なキーワードで検索することが可能です。病理学データも含まれており、病理...
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一括ダウンロード可
Mouse Genome Databases
運用機関:
Neurogenetics at University of Tennessee Health Science Center
生物種:
Mus musculus
説明:
2000-2001年マウス染色体委員会の報告書、1997年のMITマイクロサテライトマップRelease15、遺伝子組み換え近交系マウスデータベース、染色体マップのテキスト情報をもとに、データを提供して...
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Mouse DNA Microarray
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
129X1/SvJとC57BL/6Jマウスの系統間で、新生児脳、成体脾臓、成体肝臓における遺伝子発現の差をマイクロアレイで調べた結果を掲載しているデータベースです。
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一括ダウンロード可
Mouse Basement Membrane Bodymap
運用機関:
大阪大学 蛋白質研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
マウス胎仔における基底膜蛋白質42種(既知の基底膜蛋白質の約90%)の発現部位を免疫組織化学的手法を用いて網羅的に解析し、得られた染色標本のデジタル画像を収録した画像データベースで...
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MolMovDB: The database of molecular motions
運用機関:
Yale University
生物種:
説明:
PDBファイル間の動きをモーフィングしたデータベースです。その多くはユーザの投稿データによって構成されています。また、解析ツールとして、化学的に2つの構造の補間構造を生成するMorphSe...
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休止
(14日以上)
MitoDat: Mendelian Inheritance and the Mitochondrion
運用機関:
Center for Cancer Research Nanobiology Program
生物種:
Eukaryota
説明:
ミトコンドリアの生合成や機能に関わっている酵素、骨格系タンパク質やその他機能がいまだ判明していないタンパク質を規定している核遺伝子の情報を集めたものです。遺伝子名や分画で検索が...
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休止
(14日以上)
miRo2: The miR-Ontology Knowledgebase
運用機関:
The Ohio State University Wexner Medical Center
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトにおけるmiRNAの情報を提供するナレッジベースです。miRNA名、ターゲット遺伝子名、機能、関連疾患名等で検索でき、ターゲッティング情報、ターゲット遺伝子に関連する情報、ゲノムの位...
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一括ダウンロード可
MiBASE: Micro-Tom Database
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Solanum lycopersicum
説明:
トマト品種Micro-Tomの果実由来のESTと葉由来のEST(合計125,883EST)を公開しています。公共データベースから得たトマトESTとMicro-Tom ESTと合わせ、アセンブルを行い構築した 76,276個のUNI...
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MIAMI: Microarray-based Integrated Analysis of Methylation by Isoschizomers
運用機関:
群馬大学 生体調節研究所附属生体情報ゲノムリソースセンター
生物種:
Homo sapiens
説明:
MIAMI法(マイクロアレイによるゲノムワイドなメチル化解析法)について詳しい実験手法を示すとともに、この手法を用いた解析により、様々な疾患とエピジェネティクスの関係の例をまとめてい...
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MGI: Medaka Genome Initiative
運用機関:
東京大学 大学院新領域創成科学研究科
生物種:
Oryzias latipes
説明:
MGIはメダカに関する研究チームの国際的な枠組みです。メダカゲノムプロジェクトを推進するべく、効率的に研究を進め、遺伝子情報をはじめそのために必要な情報を収集し、開発するためのコミ...
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MethDB: the database for DNA methylation and environmental epigenetic effects
運用機関:
MethDBチーム
生物種:
Eukaryota
説明:
DNAに存在するメチル化シトシンの出現頻度に関するデータベースです。HPLCやシーケンスなど様々な方法で解析されたデータが蓄積されています。このデータベースはメチル化情報を登録するため...
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休止
(14日以上)
一括ダウンロード可
MEROPS: the Peptidase Database
運用機関:
Sanger Institute
生物種:
説明:
ぺプチダーゼ(プロテアーゼ、タンパク質分解酵素)とそのインヒビターの情報を収集、整備したデータベースです。約3,000件のぺプチダーゼとインヒビターが登録されており、各エントリーには...
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休止
(14日以上)
MEDIE
運用機関:
東京大学 大学院情報理工学系研究科
生物種:
説明:
自然言語処理とテキストマイニング技術をベースとし、MEDLINEアブストラクトから生物医学の関係概念を検出するための知的検索エンジンです。構文解析によって計算された意味構造を用いて、高...
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一括ダウンロード可
MEDALS: METI database portal for life science
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター
生物種:
説明:
このポータルサイトでは、これまで経済産業省関連機関により実施されたライフサイエンス分野の研究開発プロジェクトについて、1989年以降の成果物(データベース、ツール等)の情報を整理・...
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LSDBアーカイブへ
一括ダウンロード可
MDeR (アーカイブ): The metadata element repository in life sciences
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部
生物種:
説明:
ライフサイエンス分野のメタデータ要素のレポジトリサイト。国際標準およびライフサイエンス分野のデータベースのメタデータ要素の定義や内容、さらにデータ記述法を収録し、データベース構...
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休止
(14日以上)
MDB: Metalloprotein Database and Browser
運用機関:
The Scripps Research Institute
生物種:
説明:
MDBはProteinDatabase(PDB)に存在する構造のうち、金属イオンを含むものに関して定量的な情報を提供しています。金属イオンの種類とその個数、タンパク質立体構造の分解能でも検索することが...
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休止
(8日目)
McSyBi: Multi-document Clustering System for Biomedicine
運用機関:
東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター
生物種:
説明:
PubMed検索結果を用いた、生体臨床医学のための文献クラスタリングシステムです。
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一括ダウンロード可
MCPA2: 哺乳類頭蓋の画像データベース (Mammalian Crania Photographic Archive Second Edition)
運用機関:
獨協医科大学
生物種:
Mammalia
説明:
1997年より高解像度デジタルカメラで撮影された10,956件の哺乳類頭蓋の画像集です。6方向(前面・後面・左側面・右側面・上面・下面)からの撮影は、原則として、耳眼平面[眼窩の下縁と外耳...
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牧野標本館所蔵タイプ標本データベース
運用機関:
首都大学東京
生物種:
Embryophyta
説明:
日本の植物分類学の草分けともいえる故牧野富太郎博士(1862~1957)が収集した植物標本約40万点を整理、保管している「牧野標本館」所蔵のタイプ標本データベースです。東京都立大学(現:...
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LSDBアーカイブへ
一括ダウンロード可
Macrophage Curated Database Index
運用機関:
東京大学 医科学研究所
生物種:
Metazoa
説明:
マクロファージの分化・活性化ネットワークに関する遺伝子発現情報等の大規模・総合的データから動的転写制御ネットワークを抽出し、利用するための計算戦略をイン・シリコパイプラインとし...
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休止
(14日以上)
MacroArray Analysis Page of Bradyrhizobium japonicum
運用機関:
大阪大学 大学院理学研究科
生物種:
Bradyrhizobium japonicum
説明:
根粒菌Bradyrhizobium japonicumのゲノムワイドな発現比較およびCGH解析データをまとめています。1)芳香族化合物の分解過程における遺伝子発現解析結果、2)ダイズ種子抽出物と大豆由来フ...
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一括ダウンロード可
MachiBase: A Drosophila Melanogaster 5'-end mRNA Transcription Database
運用機関:
東京大学 大学院新領域創成科学研究科
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエの転写開始点に関して世界最大の情報量を提供するゲノムブラウザです。ショウジョウバエの7つの組織(胚、幼虫、老/若x雄/雌, S2(培養細胞株))から収集した約2500万個の...
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M Base: Medaka Genome Database
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Oryzias latipes
説明:
MEBase (メダカのESTデータベース)、MLBase (メダカの連鎖地図データベース)、MBBase (メダカの人工染色体データベース)の3種類からなっています。また、メダカに関する外部リンクも使用する...
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LSDB: 統合ホームページ (統合データベースプロジェクト)
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明:
文部科学省「統合データベースプロジェクト」のポータルサイトです。生命科学分野のデータベースカタログや横断検索、総説や特許、研究報告書の文献検索、各種ツール、バイオNLP、教材、事業...
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運用終了
Lowe Syndrome Mutation Database
運用機関:
National Human Genome Research Institute, National Institute of Health
生物種:
Homo sapiens
説明:
先天性白内障、精神発達遅滞、尿細管性アシドーシスを主な症状とするLowe症候群を引き起こす原因となっているOCRL1遺伝子の変異に関するデータベースです。このサイトは運用を終了し、データ...
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休止
(14日以上)
LSDBアーカイブへ
一括ダウンロード可
Lotus japonicus (miyakogusa) EST dataset
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Lotus japonicus
説明:
かずさDNA研究所で決定したミヤコグサのEST配列と、非冗長タンパク配列データベースとの間で行ったblastx検索の結果が収録されています。
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LSDBアーカイブへ
一括ダウンロード可
LigandBox: LIGANds Data Base Open and eXtensible
運用機関:
大阪大学 蛋白質研究所
生物種:
説明:
低分子化合物の3次元分子構造と原子荷電を提供するデータベースです。分子シュミレーションシステムmyPrestoの一部として開発され、KEGGや企業から提供された2次元の化合物データを元に、計...
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LSDB Archive: 生命科学系データベースアーカイブ (Life Science Database Archive)
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部
生物種:
All
説明:
生命科学系データベースアーカイブは、国内のライフサイエンス研究者が生み出したデータセットをわが国の公共財としてまとめて長期間安定に維持保管しています。データ説明(メタデータ)を...
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LSDBアーカイブへ
一括ダウンロード可
LEGENDA (アーカイブ): Literature-Extracted Gene-Disease Associations
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
PubMedに登録されている文献に記載されているヒト遺伝子/タンパク質名、遺伝子機能名、疾患名、化合物名のうち、2つの用語が共起した文献を検索するシステムです。遺伝子2つのように同じタイ...
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休止
(14日以上)
Labome.Org
運用機関:
National Center for Biotechnology Information, Computer Retrieval of Information on Scientific Projects, United States Patent and Trademark Office
生物種:
説明:
Labome.Orgは研究助成金、論文、特許、研究テーマに関連したWebページに関する情報を掲載しており、ゲノムや遺伝子、科学者や生物種を簡単に検索閲覧できるページです。
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L1Base: Annotation of Full-Length, Intact L1 Element
運用機関:
University of Wurzburg
生物種:
Homo sapiens
|
Mus musculus
|
Rattus norvegicus
説明:
L1Baseはヒトやげっ歯類ゲノムに存在する有効と思われるL1 Insertion専門のデータベースです。2つのORFが欠損していないL1 Element配列全長、そして、欠損していないORF2と欠損しているORF1...
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KOP: Kazusa ORFeome Project
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト蛋白質発現クローン(Flexi ORF clones)データベースです。ORF配列やアミノ酸配列、InterProScanの結果、transmembrane regionの予測結果、OMIM databaseの疾病遺伝子に対するホモロジ...
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一括ダウンロード可
KNApSAcK: A Comprehensive Species-Metabolite Relationship Database
運用機関:
奈良先端科学技術大学院大学
生物種:
Embryophyta
説明:
生物種と代謝産物の関係を体系化することを目的に、二次代謝産物データベースシステムKNApSAcKを開発し、無償で公開しています。KNApSAcKは分子式、分子量、生物種名や実験によって得られた...
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KMsyndromeDB: Keio Mutation syndrome database
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、Waardenburg症候群、QT延長症候群に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺...
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KMmuscleDB: Keio Mutation muscle database
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、筋ジストロフィーに関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検...
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KMheartDB: Keio Mutation heart database
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、心筋症に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検索、表示が...
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KMeyeDB: Keio Mutation eye database
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、網膜色素変性症、緑内障、内障に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝...
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KMearDB: Keio Mutation ear database
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、聴覚障害に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検索、表示...
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KMDB/MutationView: Keio Mutation Databases
運用機関:
慶應義塾大学
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト疾患に関連する遺伝子変異をOMIM、GDB、文献より収集し、人体・臓器の模式図上への疾患遺伝子/発症疾患名のマッピング表示や、染色体上への疾患遺伝子のマッピング表示を行っています。...
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KMcancerDB: Keio Mutation cancer database
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、乳ガン、網膜芽細胞腫、神経線維腫症に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上で...
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KMbrainDB: Keio Mutation brain database
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、パーキンソン病、アルツハイマー病に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での...
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KMbloodDB: Keio Mutation blood database
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、血液関連疾患に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検索、...
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KMaiDB: Keio Mutation autoimmune database
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、自己免疫関連疾患に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検...
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Klotho: Biochemical Compounds Declarative Database
運用機関:
University of Missouri Bioinformatics Consortium
生物種:
説明:
Klothoは生物化学で始まる生物学的プロセスをモデル化しようとする試みです。このデータベースでは分子構造を検索することができます。
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KEGG GLYCAN: Glycome informatics resource integrating genomics and chemistry
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
文献で報告されている糖鎖構造と関連するパスウェイを収集したデータベースです。KEGG Pathwayとのリンクにより、糖鎖の生合成および分解反応や関連酵素の情報も得られます。
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一括ダウンロード可
KEGG GENES Database: Molecular building blocks of life in the genomic space
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
KEGG GENESは、全ゲノム配列が決定された生物種について、その遺伝子セットをRefSeq その他の公共データベースから自動生成し、KEGG 独自のアノテーション(KO アノテーション)を行っている...
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休止
(14日以上)
KEGG DAS: KEGG Distributed Annotation System
運用機関:
東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター
生物種:
説明:
KEGGに含まれる全生物のゲノムマップ情報に対して、DAS(Distributed Annotation System)サービスを提供する高度ゲノムデータベースシステムです。GBrowse GUIを用いて、ウェブブラウザから...
詳細へ
統合TVへ
一括ダウンロード可
KEGG: Kyoto Encyclopedia at Genes and Genomes
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
KEGGデータベースシステム全体の統括ページです。データタイプごと(PATHWAY、BRITE、DISEASE、DRUG、GENES、GENOME、COMPOUND、GLYCAN、REACTION)、生物種ごとにアクセスできます。KEGG Ma...
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