データベースのレコード一覧  (件数: )

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運用機関: 東京大学 医科学研究所
生物種: Plasmodium falciparum | Plasmodium yoelii | Plasmodium vivax | Plasmodium berghei | Toxoplasma gondii | ...
説明: 7種類の寄生原虫(熱帯熱マラリア原虫、三日熱マラリア原虫、ネズミマラリア原虫2種、トキソプラズマ原虫、クリプトスポリジウム原虫、エキノコックス条虫)から全長cDNAライブラリを作成し... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種: Archaea | Bacteria | Proteobacteria
説明: 全ゲノムにコードされているタンパク質配列の全てのオーソログを定義しているデータベースです。オーソログクラスターに含まれる生物種とタンパク質名、系統樹を収録しています。各クラスタ... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明: 遺伝子クローンとライブラリの統合データベースです。クローン名とライブラリ情報、末端塩基配列情報、提供者の情報を提供しています。クローンの登録も行えます。 詳細へ
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運用機関: 調査中
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: ヒトとマウスの遺伝子発現データを収集・整備し、実験間で比較することができるデータベースです。キーワード検索が可能です。 詳細へ
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運用機関: 筑波大学 下田臨海実験センター
生物種: Ciona intestinalis
説明: NBRPカタユウレイボヤでは、 1.カタユウレイボヤ野生型(クローズドコロニー)の飼育と提供(京都大学および東京大学) 2.カタユウレイボヤトランスジェニック系統・突然変異体の収集・保... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所
生物種: Arabidopsis thaliana
説明: シロイヌナズナの葉緑体タンパク質を産生すると予想した遺伝子に、トランスポゾンまたはT-DNAを挿入して破壊したタグラインを大規模に収集し、植物体の形態変化を育成プレート上で観察・分類... 詳細へ
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運用機関: Ewha Womans University
生物種: Homo sapiens
説明: ChimerDBは融合遺伝子の情報を集めたデータベースです。ChimerKB、ChimerPub、ChimerSeqの3つのモジュールで構成されています。 ChimerKBは、文献や公開されているリソースからのマニュアル... 詳細へ
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運用機関: Stanford University
生物種: Candida albicans
説明: ヒト病原体であるカンジダ菌(Candida albicans)のゲノム配列や、手作業でキュレートした遺伝子、タンパク質のアノテーション情報を提供しているデータベースです。カンジダ菌の代謝パスウ... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 和光研究所
生物種: Mus musculus
説明: 哺乳類の脳の発達に伴う時間的空間的な遺伝子発現の情報を視覚化し分析するための総合的な神経科学データベースです。遺伝子名、発現場所、発現タイミング、関連する遺伝子オントロジーの情... 詳細へ
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運用終了
Cassava Full-Length cDNA Database
運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種: Manihot esculenta
説明: ESTのアセンブルによって得られたキャッサバの完全長cDNAデータベースです。キーワード検索やBLAST検索が可能です。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人国立がん研究センター
生物種: Homo sapiens
説明: がんの診療に有用な放射線、CT、MR、内視鏡、超音波、病理画像等の各種臨床画像・診断情報を提供する医師向けデータベースです。国立がん研究センター中央病院、東病院の症例を中心に、国立... 詳細へ
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運用終了
Caenorhabditis elegans WWW Server
運用機関: Virginia Commonwealth University
生物種: Caenorhabditis elegans
説明: 線虫研究に関するポータルサイト、リンク集です。最新の論文、学会情報、解析ソフトウェア、C. elegans以外の線虫を紹介するページや、主要な線虫データベース、関連サイト、各研究室へのリ... 詳細へ
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運用機関: Broad Institute of Harvard and MIT
生物種: Homo sapiens
説明: ブロード研究所は、マサチューセッツ工科大学(MIT)のホワイトヘッド研究所とハーバード大学のHarvard Institute of Chemistry and Cell Biology (ICCB) という遺伝子医学の二大研究所が200... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人国立病院機構 九州がんセンター
生物種: Homo sapiens
説明: マンモグラフィ検診の導入や診断機器の進歩により、早期乳癌の発見率は増加してきました。一方で、境界病変や非触知病変、腫瘤非形成型病変など診断に苦慮する機会も増えています。そこで、... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: オンラインで利用できる生物医学関連の電子書籍を収録しています。テキスト中の引用文献はPubMedにリンクしています。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Bombyx mori
説明: エンハンサートラップ法によりカイコの新規突然変異系統を作出し、これらの系統におけるGFPレポーター発現部位情報や画像、ゲノム挿入位置情報などをまとめた新規突然変異系統データベースを... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Bombyx mori
説明: カイコゲノムの遺伝地図と物理地図情報が統合されたデータベースです。 グラフィカルなビューアにより、遺伝地図と物理地図の関連やマーカ情報を参照できます。 詳細へ
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運用機関: University of Wisconsin System Board of Regents
生物種:
説明: ADIT-NMR、SMSDepにより登録されたペプチド、タンパク質、核酸等、生体高分子のNMR実験データを公開しています。データの検索、各データエントリーからPDBなど他のデータベースへのリンク、... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: 代謝パスウエイやシグナルパスウエイ、疾患やその他の生体内プロセスに関わる生体分子の相互作用セットを収集したデータベースです。現在は、KEGGとEcoCycデータベースのパスウエイを対象と... 詳細へ
運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明: バイオマーカー候補と臨床的障害の関係から新規のバイオマーカー候補を見出すためのデータベースです。MEDLINE、OMIM、PPIs等の文献情報からバイオマーカー関連の情報をまとめています。キー... 詳細へ
運用機関: Harvard University Department of Molecular and Cellular Biology
生物種:
説明: ハーバード大学分子細胞生物学部で公開している生物学全般に関するリンク集です。生物学の各分野や、インターネットバイオリソース、検索エンジン、データバンク、モデル生物データベースと... 詳細へ
運用機関: North Dakota State University
生物種: Phaseolus | Vigna
説明: マメ(インゲンマメ属、ササゲ属)ゲノムデータベースへのリンク集です。※アクセス不可のページが多数みられます。 詳細へ
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運用機関: Beta Cell Biology Consortium
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: Beta Cell Biology Consortiumは、膵臓ランゲルハンス島の発生と機能に関する理解を進展させる学際的アプローチの促進を目的としています。長期的な目標として、インスリン・デリバリーのた... 詳細へ
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運用機関: 東北大学, 東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター
生物種: Arabidopsis thaliana | Oryza sativa | Glycine max | Zea mays | Solanum lycopersicum | ...
説明: ATTED-IIは、シロイヌナズナを中心とした植物の遺伝子共発現データを提供するデータベースです。AtGenExpress (TAIR)、ArrayExpressからのマイクロアレイデータと、DDBJからのRNAseqデータを... 詳細へ
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運用機関: 筑波大学大学院 生命環境科学研究科
生物種: Dictyostelium discoideum AX2
説明: 細胞性粘菌 Dictyostelium discoideum AX2 株 cDNAクローンについて、Whole-mount in situ hybridizationに基づく空間的遺伝子発現情報(画像)を収録したデータベースです。シンプルな発生... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種: Arabidopsis thaliana
説明: 理化学研究所植物科学研究センターがMaxPlank研究所などと協力して、植物において初めて大規模なトランスクリプトームデータ(Affymetrixチップ1000枚以上)を収集して公開した「AtGenExpres... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans | Oryza sativa | ...
説明: ASTRAは、ヒト、マウス、ハエ、線虫、シロイヌナズナ、イネについて、選択的スプライシングと選択的転写開始のパターンを収集したデータベースです。独自のアルゴリズムを用いて、ゲノム塩基... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種: Mus musculus
説明: 二つのマウス細胞株(メラノサイト、メラノーマ)由来の完全長cDNA ライブラリから選択的スプライシングライブラリ(Alternative Splicing Library: ASL)を構築し、そこから濃縮した選択的ス... 詳細へ
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運用機関: 独立行政法人酒類総合研究所
生物種: Aspergillus oryzae RIB40
説明: 麹菌Aspergillus oryzae のゲノム配列データベースです。Aspergillus oryzaeのゲノム配列決定には、酒類総合研究所のRIB40株が使われました。ゲノムの遺伝子アノテーションに対するキーワー... 詳細へ
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運用機関: 長浜バイオ大学
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: 遺伝子機能の多様化に重要な役割を果たす現象と考えられている選択的スプライシングが、タンパク質の立体構造や機能にどのような影響を与え得るかについてコンピュータにより解析した結果を... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ センター
生物種:
説明: DDBJがWWWならびにWeb APIで提供している高速なキーワード検索サービスです。国際塩基配列データベースのほか、生命科学分野の主要なデータベースに対して統合的な検索を行うことができます... 詳細へ
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運用機関: University of California, Santa Cruz
生物種: Saccharomyces cerevisiae
説明: 真核ゲノムのスプライシングパターンや制御を理解するために、酵母ORFのイントロン情報やスプライシング因子破壊株のマイクロアレイデータを蓄積しています。各エントリーには、ORF名、イン... 詳細へ
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運用機関: Helmholtz Zentrum Munchen
生物種: Arabidopsis thaliana
説明: ドイツのシロイヌナズナゲノム解析グループのホームページです。クローンやコンティグ、遺伝子情報を公開しています。データベースMatDBでは、シロイヌナズナゲノムデータベースであるMIPS、... 詳細へ
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運用機関: 公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種: Arabidopsis thaliana
説明: かずさDNA研究所で決定したシロイヌナズナのEST配列と、非冗長タンパク配列データベースとの間で行ったblastx検索の結果が収録されています。 詳細へ
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運用終了
AQUA DNABook
運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明: ヒラメの遺伝地図作成に用いたマイクロサテライトマーカーと魚病診断に用いるプライマーをスポットしたDNAブックです。コイヘルペスなど病原体17種類のDNA断片と、ヒラメやマダイなどの耐病... 詳細へ
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運用機関: Institut national de la recherche agronomique
生物種: Acyrthosiphon
説明: アブラムシゲノム解析コンソーシアムによる成果として、エンドウヒゲナガアブラムシのドラフト配列とアノテーションを公開しています。各種プログラムによる自動的な遺伝子予測結果に加え、... 詳細へ
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運用機関: Lady Davis Institute for Medical Research
生物種: Homo sapiens
説明: アンドロゲン(男性ホルモン)受容体変異データベースです。PDFファイルによる一覧と、FileMakerPro用データベースファイルのダウンロードによりデータが得られます。 詳細へ
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運用機関: University of Texas Southwestern Medical Center
生物種:
説明: CASP8に参加したグループの予測構造と、その評価を納めたデータベースです。各グループの予測構造はPyMOLを用いて表示することができます。 詳細へ
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運用機関: Poznan Supercomputing and Networking Center
生物種:
説明: 既知のすべてのアミノアシル-tRNA合成酵素のアミノ酸配列を集積しているデータベースです。対応するアミノ酸や生物種により分類されています。X線回折やNMRで解析した三次元構造も掲載されて... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: 文献中に多く出現する略語は多義語であることが多く、特に専門外の読者には理解するのに困難を伴うことがあります。Allieはこの問題に対する一つの解となるよう開発されており、米国国立保健... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種: Chlorophyta
説明: 藻類に関する株情報の検索、寄託情報、遺伝子情報、藻類の画像、文献情報を検索することができます。その他、株の分譲に関する情報も得ることができます。 詳細へ
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運用機関: Addgene
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Danio rerio | Drosophila melanogaster | ...
説明: Addgeneは、研究者にプラスミドを分配する非営利組織です。数百の研究室と共同で、論文発表で用いた高品質なプラスミドのライブラリを収集し、プラスミドレポジトリを構築しています。プラス... 詳細へ
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運用機関: Universite Libre de Bruxelles
生物種: Eukaryota | Bacteria | Viruses
説明: ファージゲノムやプラスミド、トランスポゾンを含む、原核生物の全ての既知の可動性遺伝因子(Mobile Genetic Elements; MGEs)の収集とクラス分けを行ったデータベースです。ゲノムや遺伝子の... 詳細へ
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運用機関: 法政大学
生物種: Eukaryota | Bacteria | Viruses
説明: ネット上に存在する生物多様性関連のWebサイト454件のリンク集です。各生物種ごと、あるいは標本ごとにWebページが存在し、各々について種の特徴が判別できる精細な画像と、その撮影場所、年... 詳細へ
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運用機関: University of Leicester Department of Genetics
生物種: Homo sapiens
説明: 骨形成不全症とエーラー・ダンロス症候群を引き起こすと報告されている全ての遺伝子の変異情報を収録することを目的としています。骨形成不全症では、COL1A1, COL1A2, CRTAP, FKBP10, LEPRE1... 詳細へ
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運用機関: Department of Computational Biology, Adam Mickiewicz University
生物種: Eukaryota | Bacteria | Archaea
説明: 古細菌、真正細菌、真核生物の5S rRNAの塩基配列を提供しているデータベースです。二次構造や三次構造、修飾分子の情報も掲載されています。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
説明: 天然分子の三次元構造、物性値を閲覧することができます。細胞内での分子認識においては三次元構造が重要であり、特に農業分野で利用できる(農薬の設計、食品の成分分析等)天然物を中心に... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
説明: 木材標本庫所蔵の顕微鏡像、表面観、さく葉標本像、採集時の画像、種名、採集情報を掲載しています。 詳細へ
運用機関: 文科省科研費ゲノム4領域特定領域「ゲノム」
生物種:
説明: 文部科学省は、5年単位プロジェクトの4代目として、2005年4月に「特定領域研究ゲノム」をスタートさせました。このプロジェクトの研究成果情報を、カテゴリ、期間、領域、受付番号、氏名、キ... 詳細へ
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運用終了
Database for Genetic Engineering of Microalgae (微細藻類遺伝子工学データベース)
運用機関: 独立行政法人産業技術総合研究所
生物種: Anabaena sp. | Anabaena sp. PCC 7118 | Anabaena sp. PCC 7120 | Chlamydomonas reinhardtii | Chlorella sorokiniana | ...
説明: 微細藻類の遺伝子組換えの実用化へ向けて役立つ技術を集めたもので、相互に利用を図ることを目指しています。現在は手持ちのラン藻のホストーベクター系を中心に、ベクターの構造、塩基配列... 詳細へ