ホーム - Integbio データベースカタログ

運用終了

NIAS Oryza SNP Database

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Oryza sativa

説明: NIAS栽培イネコアコレクションと在来品種の多型情報データベースです。詳細へ

運用終了

Genome Methylation Database

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Oryza sativa | Arabidopsis thaliana

説明: RLGS法によるイネ・シロイヌナズナゲノムのメチル化状況をまとめたデータベースです。詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

The Rice Growth Monitoring System (アーカイブ)

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Oryza sativa

説明: イネの発芽から開花までの生育画像を数分から数時間間隔で継続的に取得できるシステムによる、表現型の網羅的解析結果のデータベースです。国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機... 詳細へ

運用終了

RGRC: Rice Genome Resource Center (イネゲノムリソースセンター)

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Oryza sativa

説明: イネゲノムリソースセンターのホームページです。イネ完全長cDNAクローン配布に関する情報と、イネ突然変異系統であるTos17突然変異系統のデータヘのリンク、研究材料の申し込み方法を記載し... 詳細へ

IMPC: International Mouse Phenotyping Consortium

運用機関: International Mouse Phenotype Consortium

生物種: Mus musculus

説明: 国際マウス表現型解析コンソーシアム（IMPC）によるノックアウトマウスの網羅的表現型データを収集したデータベースです。国際マウスコンソーシアム（IKMC）により整備されたC57BL/6マウス... 詳細へ

休止
(14日以上)

一括ダウンロード可

ChromatinDB

運用機関: Washington State University

生物種: Saccharomyces cerevisiae

説明: 酵母のヒストン修飾やその他の染色体の特徴パターンをマッピングしたゲノムワイドChIPマイクロアレイデータを収集しています。遺伝子名とプロモーター領域あるいはORFを選択すると、その領域... 詳細へ

The Multi-Dimensional Human Embryo

運用機関: University of Michigan

生物種: Homo sapiens

説明: 核磁気共鳴画像法(MRI)で撮影されたヒト胚の立体画像のデータベースです（アメリカ国立小児保健発育研究所(NICHD)資金提供）。ヒト胚画像コレクションはヒト発生研究に興味を持つ学生や研究... 詳細へ

GtRNAdb: Genomic tRNA Database

運用機関: University of California

生物種: Eukaryota | Archaea | Bacteria

説明: ゲノム全塩基配列が決定された生物種について、tRNAscan-SEプログラム(Lowe & Eddy, 1997)によって予測されたtRNA遺伝子を収集しています。全てのアノテーションは自動的に付与されています。詳細へ

休止
(14日以上)

ITER: International Toxicity Estimates for Risk

運用機関: Toxicology Excellence for Risk Assessment

生物種:

説明: 世界の信頼ある研究グループから寄せられた600以上の化学物質の人体に及ぼすリスク情報を収載しています。詳細へ

休止
(14日以上)

GENE-TOX: Genetic Toxicology Data Bank

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 3,000以上の化学物質の遺伝毒性テストデータを収載しています。各物質について、実施された試験方法、ホスト、試験結果、文献情報等を確認できます。2019年よりGENE-TOXの内容はアップデート... 詳細へ

休止
(14日以上)

DART: Developmental and Reproductive Toxicology Database

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 生殖毒性試験に関する文献データを収載したデータベースです。2019年よりDARTの内容はPubMed の “DART subset" として移行しました。PubMedでの利用方法は以下に掲載されています。https://w... 詳細へ

休止
(14日以上)

TOXLINE: Toxicology Literature Online

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 毒性に関する文献データを収載したデータベースです。2019年よりTOXLINEの内容はPubMed の“Toxicology subset” として移行しました。PubMedでの利用方法やアップデートされない内容のダウン... 詳細へ

休止
(14日以上)

CCRIS: Chemical Carcinogenesis Research Information System

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 8,000以上の化学物質の発がん性や変異原性、腫瘍プロモーション、助発ガン性などについての試験結果とその条件が集められています。一般的に受け入れられているプロトコルに従った研究からの... 詳細へ

IRIS: Integrated Risk Information System

運用機関: U.S. Environmental Protection Agency

生物種:

説明: 500以上の化学物質のリスクアセスメントに役立つ情報が提供されています。データレコードは発ガン性のアセスメント (暴露度に関するリスクの推測) とレファレンスコード (有害物質への暴露、... 詳細へ

休止
(14日以上)

HSDB: Hazardous Substances Data Bank

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 5,000以上の潜在的危険有害化学物質の毒性に焦点を当てた毒性データファイルです。ヒト曝露値、産業衛生、緊急時の取扱手順、環境運命、法的要求事項やその他の関連事項情報などが収載されて... 詳細へ

運用終了

TOXNET: Toxicology Data Network

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 毒性、有害危険化学物質、環境衛生、毒性排出に関するデータベース群を集めた毒性情報総合サイトです。化合物名、病名、環境衛生に関するキーワードを入力すると、TOXNET上の全データベース... 詳細へ

LactMed: Drugs and Lactation Database

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 母乳育児中の母親が曝露するかも知れない薬や化学物質のデータベースで、母乳や乳幼児血液中のレベルと可能性のある副作用のほかに、代用可能な治療薬に関する情報を提供しています。すべて... 詳細へ

休止
(14日以上)

BBID: Biological Biochemical Image Database

運用機関: National Institute on Aging

生物種:

説明: 生物学的パスウエイ、高分子構造、遺伝子ファミリー、細胞間相互作用に関する画像を収集したデータベースです。遺伝子名、パスウエイ名、細胞や組織、病名、生物学的機能名をキーワードとし... 詳細へ

運用終了

一括ダウンロード可

GAD: Genetic Association Database

運用機関: National Institutes of Health

生物種: Homo sapiens

説明: ヒト疾患の遺伝的関連研究データを管理するデータベースです。候補遺伝子解析やゲノムワイド関連解析(GWAS)に関する査読文献から抽出した要約データも含まれます。各エントリーは遺伝子名、... 詳細へ

Health Information

運用機関: National Institutes of Health

生物種:

説明: NIHヘルスインフォメーションは、読者に健康に関するより良い知識と理解を助け、病気を防ぐ手段とし、家族や身近な人が罹る病気の理解を深めることを目的としています。これらの記事は専門家... 詳細へ

IEDB: Immune Epitope Database

運用機関: National Institute of Allergy and Infectious Diseases

説明: IEDBでは、実験で明らかにされたT細胞およびB細胞エピトープ（抗原決定基）のカタログや、主要組織適合性複合体(MHC)結合アッセイ、MHCリガンド溶出アッセイのデータ等を提供しています。エ... 詳細へ

一括ダウンロード可

HIV-1, Human Protein Interaction Database

運用機関: National Center for Biotechnology Information

生物種: Homo sapiens | Human immunodeficiency virus 1

説明: HIV-1タンパクと宿主細胞タンパクとの相互作用の知見を収集することは、HIV-1の複製や発症のプロセスを理解するのに重要であり、また安全かつ効率的なAIDSの治療法や予防戦略の開発に必須と... 詳細へ

Cancer Types Studied in DCEG

運用機関: National Cancer Institute

生物種: Homo sapiens

説明: NIHのDivision of Cancer Epidemiology and Genetics (DCEG) で行われている、がんの遺伝的、環境的決定因子とがん予防に関する研究のサイトです。前立腺がん、乳がん、膵がん、肺がんなど多... 詳細へ

一括ダウンロード可

GDC Data Portal: Genomic Data Commons Data Portal

運用機関: National Cancer Institute

生物種: Homo sapiens

説明: がんに関連するゲノム研究のデータセットを検索、ダウンロード、アップデート、分析するためのポータルサイトです。TCGA （The Cancer Genome Atlas: https://cancergenome.nih.gov）および... 詳細へ

運用終了

一括ダウンロード可

Pathway Interaction Database

運用機関: National Cancer Institute

生物種: Homo sapiens

説明: National Cancer Institute (NCI)とNature Publishing Group (NPG)の共同プロジェクト。NCIとNPGでキュレートした信頼性の高い113ヒトパスウエイ（7496相互作用）と、BioCarta/Reactomeから... 詳細へ

休止
(14日以上)

Cancer Genes

運用機関: Memorial Sloan-Kettering Cancer Center

生物種: Homo sapiens

説明: がんゲノム大型共同プロジェクトにおける遺伝子選択および優先付けプロセスを簡素化するためのリソースです。各遺伝子は専門家によってアノテーション付けされています - 遺伝子名、機能説明... 詳細へ

運用終了

GenProtEC (E. Coli genome and proteome database)

運用機関: Marine Biological Laboratory

生物種: Escherichia coli K-12

説明: Escherichia coli K-12 (strain MG1655) ゲノムにコードされた機能に対するアノテーションを蓄積しています。1)オーソログの配列相同性、機能ごとに分子ユニットを形成する融合タンパクの解... 詳細へ

一括ダウンロード可

ITIS

運用機関: Integrated Taxonomic Information System

説明: 生物名と種の階層分類を収録しているデータベースです。ホワイトハウスの生物多様性および生態力学に関する分科委員会では、系統分類学が生物多様性保全と生態系管理の基礎となる優先研究課... 詳細へ

Geneimprint

運用機関: Duke University

説明: ゲノムインプリンティングの関連記事、レビュー、プレス報道、講演のビデオおよび音声、学会、遺伝情報を収集したポータルサイトです。「genes」タブには、7種類の生物種のインプリンティン... 詳細へ

一括ダウンロード可

PMN: Plant Metabolic Network

運用機関: Carnegie Institution for Science/Department of Plant Biology

生物種: Embryophyta

説明: PMNは生化学者とデータベースのコラボレーションプロジェクトであり、植物の代謝パスウエイデータベースを構築することを目標としています。PMNで現在公開しているデータベースは、「PlantCy... 詳細へ

運用終了

BioCarta: Charting Pathways of Life

運用機関: BioCarta LLC

生物種:

説明: 細胞内のパスウエイ模式図を検索できる企業サイトです。図中の分子をクリックすると、OMIMやPubMedなど外部リンクにて分子の詳細を確認することができます。図が綺麗です。BioCarta LLCによ... 詳細へ

休止
(11日目)

Plant DNA C-value Database

運用機関: Royal Botanic Gardens, Kew

生物種: Embryophyta

説明: 一生物種の非複製配偶子の核DNA量はC-valueとして表されます。植物DNA C-value データベースは現在5150種の植物のC-valueデータを収容しています。被子植物DNA C-valueデータベース、裸子植... 詳細へ

運用終了

一括ダウンロード可

IPI: International Protein Index

運用機関: European Bioinformatics Institute

説明: 7つのデータリソース（UniProtKB/Swiiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL., RefSeq, Ensembl, TAIR, H-InvDB, Vega)のタンパク配列をもとに、非冗長タンパク配列データセットを収録しています。2001... 詳細へ

Animal Genome Size Database

運用機関: University of Guelph

生物種: Metazoa

説明: 動物のゲノムサイズデータの総合的なカタログです。ゲノムサイズとは、ハプロイド核DNA含量、すなわち、1生物種の染色体の1コピーのDNA量を指します。ハプロイドDNA含量は「C-value」とも呼... 詳細へ

統合TVへ一括ダウンロード可

HMDB: Human Metabolome Database

運用機関: University of Alberta

生物種: Homo sapiens

説明: ヒト体内における低分子代謝物の詳細情報を収集したデータベースです。メタボロミクスや臨床化学、バイオマーカー探索、教育分野で活用されることを目的に構築しており、化学データ、臨床デ... 詳細へ

一括ダウンロード可

SMPDB: Small Molecule Pathway Database

運用機関: University of Alberta

生物種: Homo sapiens

説明: SMPDB(Small Molecule Pathway Database)は、350以上のヒトの小分子パスウエイを含む視覚的なデータベースです。これらのうち2/3以上のパスウエイ(>280)は他のパスウエイデータベースでは見... 詳細へ

一括ダウンロード可

MetaCyc

運用機関: SRI International

生物種: All

説明: MetaCycは実験的に検証された代謝パスウエイのデータベースで、1900種以上の生物由来の1500以上のパスウエイが収録されています。詳細へ

運用終了

GlycoSuite

運用機関: Swiss Institute of Bioinformatics

生物種:

説明: GlycoSuiteDBは、アノテーション付けされた糖鎖構造の関係型データベースで、Tyrian Diagnostics Ltd の製品です。1990-2005年に文献で発表されたO-glycan, N-glycanの構造が収録されていま... 詳細へ

統合TVへ一括ダウンロード可

Human Protein Atlas

運用機関: Uppsala University

生物種: Homo sapiens

説明: 様々な種類のヒトの器官、組織、細胞におけるタンパク質の発現および局在に関するデータベースです。蛍光抗体イメージング、質量分析に基づくプロテオミクス、網羅的な遺伝子発現解析による... 詳細へ

一括ダウンロード可

JASPAR

運用機関: University of Copenhagen

生物種: Eukaryota

説明: JASPAR COREデータベースは、実験で明らかにされ文献で報告された真核生物の転写結合サイトのデータをキュレートし、冗長を省いた転写結合プロファイルを収容しています。TRANSFAC等の同様の... 詳細へ

休止
(14日以上)

tRNAdb: Transfer RNA Database

運用機関: University of Leipzig

生物種: Archaea | Bacteria | Eukaryota | Viruses

説明: 577生物種の12,000以上のtRNA遺伝子と、104生物種の623以上のtRNA配列と構造が格納されています。これらはアンチコドン・トリプレットによって決定されるアミノ酸特異性によってファミリーに... 詳細へ

休止
(14日以上)

AffinDB: Affynity Database For Protein-Ligand Complexes

運用機関: Department of Pharmaceutical Chemistry, Philipps-University Marburg

生物種:

説明: PDBに登録されているタンパク-リガンド複合体のアフィニティデータを収集したデータベースです。リガンドの構造やアフィニティ強度、文献等の情報を調べることができます。現在748のアフィニ... 詳細へ

休止
(14日以上)

GLYCOSCIENCES.de

運用機関: Justus-Liebig University Giessen

生物種:

説明: 糖鎖生物学やグライコミクスのためのデータベースや各種ツールを提供しているサイトです。GLYCOSCIENCES.deプロジェクトは German Cancer Research Center (DKFZ)の分子モデリンググループに... 詳細へ

運用終了

一括ダウンロード可

GlycomeDB: The carbohydrate structures metadatabase

運用機関: German Cancer Research Center

生物種:

説明: 糖鎖配列の構造情報を蓄積するためのXMLベースの配列記述フォーマット(GlycoCT)を定義し、公共データベース(CFG, KEGG, KEGG, GLYCOSCIENCES.de, BCSDB and Carbbank)の全糖鎖配列をGlycoCT... 詳細へ

副作用情報データベース

運用機関: 農林水産省　動物医薬品検査所

生物種:

説明: 過去に報告された動物用医薬品副作用情報を収集したデータベースです。最新報告、報告年月日、品名、主成分名、生物学的製剤名で検索できます。詳細へ

動物用医薬品データベース

運用機関: 農林水産省　動物医薬品検査所

生物種:

説明: 動物用医薬品の詳細情報を収集したデータベースです。商品名、販売社名、主成分、対象動物、薬効分類から検索できます。詳細へ

運用終了

MgNEST-DB: Magnaporthe grisea EST Database

運用機関: 国立研究開発法人農業生物資源研究所

生物種: Magnaporthe grisea

説明: イネいもち病菌のESTを35,189配列解読し、その配列を用いて4,155の遺伝子情報を詳細に決定しました。解読したEST配列、決定した遺伝子座及び関連解析の結果をデータベースに収録し、公開して... 詳細へ

農業生物資源ジーンバンク：遺伝資源データベース

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: All

説明: 農業生物資源ジーンバンクでは、遺伝資源に関する情報をデータベース化し、オンラインで公開しています。遺伝資源の配布を希望される方にもご利用いただくことができます。植物遺伝資源、動... 詳細へ

休止
(14日以上)

農業生物資源ジーンバンク：動物画像データベース

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Gallus gallus | Bombyx mori

説明: 国内に多くの品種・系統が存在するニワトリとカイコについて、その特徴を画像とともに紹介しています。詳細へ

休止
(14日以上)

農業生物資源ジーンバンク：植物画像データベース

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Embryophyta

説明: 稲類、麦類、豆類、野菜、花き・緑化植物、特用・飼料作物について、分類、分布、形態的特徴、遺伝資源としての評価などの情報を、種子、葉、花、生息地などの画像とともに紹介しています。詳細へ

データベースのレコード一覧 (件数: )

一覧内を検索する

一覧を絞り込む

生物種

タグ＜対象＞

タグ＜データの種類＞

稼動状況

地域

その他の条件

メニュー

新着情報

本カタログの使い方