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(14日以上)

IRSLDB: Infrared and Raman Spectroscopy Literature Data Base

運用機関: 情報知識学会

生物種:

説明: 赤外ラマン文献データベースの情報検索システム。文献のタイトル、ジャーナル、ページ、日付が検索結果として表示される。詳細へ

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(14日以上)

ICB Database

運用機関: 株式会社海洋バイオテクノロジー研究所

生物種: Bacteria

説明: バクテリア中に存在するジャイレースB遺伝子（gyrB）のデータベースです。詳細へ

運用終了

HotMolecBase

運用機関: Weizmann Institute of Science

生物種:

説明: 疾患で重要な役割を果たしていると思われる因子（タンパク質や遺伝子等）について、広範囲の情報を提供していました。情報は次に示す項目に整理・分類されていました。因子の説明、構造、翻... 詳細へ

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(14日以上)

HMPDb: Human Mitochondrial Protein Database

運用機関: National Institute of Standards and Technology

生物種: Homo sapiens

説明: ミトコンドリアの発生と作用に関与するタンパク質のデータを包括的に集めたデータベース。以下のデータベースの情報を集約・整理したものである。SwissProt, LocusLink, Protein Data Bank (... 詳細へ

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(14日以上)

HemoPDB: Hematopoiesis Promoter Database

運用機関: The Wistar Institute

生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus

説明: 血液生成の際の転写制御に関する情報を集めたデータベースです。詳細へ

KCaM Search

運用機関: 京都大学　化学研究所　附属バイオインフォマティクスセンター

生物種:

説明: 枝分かれした糖鎖構造の相同性をKEGG GLYCANおよびCarbBankに登録されたデータから検索するサイトです。KCaM (KEGG Carbohydrate Matcher) のアルゴリズムを使用しており、Glycan IDやKCF形... 詳細へ

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(14日以上)

GeneMap DB

運用機関: Children's Hospital of Philadelphia

生物種: Homo sapiens

説明: ヒトBAC (bacterial artificial chromosome) クローンの情報に関するデータベースです。各クローンについて、染色体上の位置、制限酵素処理パターン、対応するSTSマーカーの情報が閲覧できま... 詳細へ

運用終了

GDB

運用機関: An international collaboration in support the Human Genome Project

生物種: Homo sapiens |

説明: ゲノム統合データベースです。Amplimer、クローン、遺伝子、遺伝子位置、SNP、文献などの情報がありました。詳細へ

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(14日以上)

FREP Database: Functional Repeats in Mouse cDNAs

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所

生物種: Homo sapiens | Mus musculus

説明: マウスのFREP解析の関連性と、ヒトを中心とする種間の比較をまとめたデータベースルールベースの知識発見支援システムです。詳細へ

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EICO DB: Expression-based Imprint Candidate Organizer

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所

生物種: Homo sapiens | Mus musculus

説明: ヒト、マウスの刷り込み遺伝子のデータベースです。詳細へ

運用終了

DoTS: Database Of Transcribed Sequences

運用機関: Computational Biology and Informatics Laboratory

生物種: Homo sapiens | Mus musculus

説明: 一般に公開されている転写配列から作成した、ヒトおよびマウスの転写インデックスのデータベースです。詳細へ

運用終了

DOMO

運用機関: Infobiogen

生物種:

説明: Swiss-ProtとPIRをもとに自動分割で作成したドメインのデータベース。詳細へ

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(14日以上)

DED: Database of Evolutionary Distances

運用機関: University of Pennsylvania

生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus

説明: ヒト、マウス、ラットの進化距離のデータベースです。詳細へ

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DDBJ/CIB ヒトゲノム情報工房

運用機関: 情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 国際DNAデータベースに登録、公開された配列情報をもとにヒトゲノム配列をアセンブルしてコンティグを作成する独自の方法を開発し、より正確な染色体配列を作成して公開していました。詳細へ

運用終了

Database for Anti-HIV Compounds

運用機関: National Institute of Allergy and Infectious Diseases

生物種: Homo sapiens | Human immunodeficiency virus

説明: 抗HIV化合物、HIV治療薬に関する情報を集めたデータベース。データベースに登録されている情報は、主要な文献の調査を継続して行い、収集したものである。Webサイトは、次の6つのセクション... 詳細へ

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(14日以上)

Cytokine Signaling Pathway Database（サイトカインシグナル伝達経路データベース）

運用機関: 熊本大学

生物種:

説明: サイトカインシグナル経路に関するデータベースです。詳細へ

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(14日以上)

Cricket EST DB and Expression DB

運用機関: 徳島大学

生物種: Gryllidae

説明: コオロギのESTおよび時空間発現のデータベースです。詳細へ

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(14日以上)

Chick Eye EST DB and Expression DB

運用機関: 徳島大学

生物種: Gallus gallus

説明: ニワトリの眼の発生に着目したESTおよび発現のデータベースです。詳細へ

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(14日以上)

BGED: Brain Gene Expression Database

運用機関: 地方国立研究開発法人大阪府立病院機構　大阪府立成人病センター研究所

生物種: Mus musculus

説明: マウスの脳に発現する遺伝子のデータベースです。詳細へ

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(14日以上)

BED: Brain EST Database

運用機関: 地方国立研究開発法人大阪府立病院機構　大阪府立成人病センター研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 大正製薬機能ゲノミクス研究所で集められた3'末端ESTコレクションに基づいて作成されたデータベースです。公共データベースのID番号や単語で検索が可能です。また、遺伝子とライブラリの発... 詳細へ

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(14日以上)

ASDB: Alternative Splicing DB

運用機関: 調査中

生物種:

説明: オルタナティブスプライシングのデータベースです。詳細へ

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(14日以上)

Alternative Protein Isoforms

運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 細胞内局在性シグナルを基にした、ヒトのタンパク質アイソフォームのパターン分類、相関関係のデータを公開しています。詳細へ

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(14日以上)

AHMII: Agent to help microbial information integration

運用機関: 調査中

生物種:

説明: 微生物に関する主要なデータベースを横断的に検索することができるシステムです。詳細へ

牧野標本館シーボルトコレクションデータベース

運用機関: 首都大学東京

生物種: Embryophyta

説明: 牧野標本館が所蔵している、シーボルトが収集した植物標本を主とするコレクション（シーボルトコレクション）の2325点について、文字情報（学名、和名、科名、採集地、採集年月日、採集者、... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

TMPDB （アーカイブ）: TransMembrane Protein DataBase

運用機関: 弘前大学大学院理工学研究科

生物種:

説明: 収集した膜貫通トポロジーに関する文献 (1074論文) から、X線結晶構造回折、NMR、遺伝子融合などの実験によって決定された、信頼度の高い302の膜貫通トポロジーモデルを抽出し、それらをSWIS... 詳細へ

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(14日以上)

ProLINT: Database for Protein-Ligand Interactions

運用機関: 九州工業大学

生物種:

説明: タンパク質-リガンド相互作用の情報を文献より収集したデータベースです。　リガンド（名称、分子構造、分子量など）、タンパク質（名称、生物種、PIR/SWISS-PROT/PDBにおけるIDなど）、実験... 詳細へ

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(14日以上)

PRIME: Protein interaction and Molecular information database

運用機関: 東京大学　医科学研究所

生物種:

説明: Kinase Pathway Database の進化版で、相互作用の種類が分類され、evidenceの信頼度も分類されています。詳細へ

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HOMOPHILA: Human Disease to Drosophila Gene Database

運用機関: University of California San Diego

生物種: Homo sapiens | Drosophila melanogaster

説明: ショウジョウバエの遺伝子と相同な配列を持つヒトの疾病遺伝子のデータベースです。疾患名、遺伝子名、OMIM番号、タイトルなどのキーワードでデータを検索することが可能です。詳細へ

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BodyMap-Xs: anatomical and taxonomical breakdown of animal EST

運用機関: 情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所

生物種:

説明: 臓器と遺伝子のオーソログ関係を前提に生物間で遺伝子発現パタンの比較ができます。最新のdbEST(DDBJのESTdivision)の材料記載を解剖名称自動分類機（自前）を用いて臓器別に分類合算して... 詳細へ

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BodyMap: Human and mouse gene expression database

運用機関: 東京大学　医科学研究所

生物種: Mus musculus | Homo sapiens

説明: ヒト、マウスの遺伝子発現を組織、細胞の種類ごとに解析した結果のデータベースです。　遺伝子発現は3' ESTをベースに解析されています。詳細へ

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(14日以上)

AGE: Ancient Genome Encyclopedia

運用機関: 情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所

生物種:

説明: 古代 DNA に関する論文の内容を表示・分類しています。詳細へ

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遺伝子名称シソーラス（アーカイブ）

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

説明: 9生物種(ヒト、マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、ショウジョウバエ、線虫、出芽酵母、分裂酵母、枯草菌)を対象に遺伝子名、遺伝子ファミリ名を集め並列関係【同義】および上下関係【ファ... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

施設名辞書（アーカイブ）

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: 施設名称や研究室名称と、それらの各表記の対応辞書です。ライフサイエンス統合データベースセンターによるオリジナルサイト（http://lifesciencedb.jp/MEXT_H18/ii-7d71540862808853958b767... 詳細へ

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生命科学系主要プロジェクト一覧

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種:

説明: 日本国内の主要プロジェクトに関する情報（体制、予算、概要、データベースサイト、ダウンロードサイト、報告書や文献へのリンク情報等）を収集したカタログ型のデータベースです。詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

生命科学系学協会カタログ（アーカイブ）

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種:

説明: 生命科学系学協会の情報(URL・名称・連絡先・会員数・学会誌)を分類別に閲覧検索できるカタログ型のデータベースです。オリジナルサイト http ://biosciencedbc.jp/adcatalog/adcatalog.cgi ... 詳細へ

LSDBアーカイブへ統合TVへ一括ダウンロード可

生命科学系データベースカタログ (アーカイブ)

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種:

説明: 生命科学系データベースの情報（URL・稼働状況・提供機関・生物種・データ種）を対象や生物種などの項目別に閲覧検索できるカタログ型のデータベースです。2013年7月29日をもってバイオサイ... 詳細へ

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The NAISTrap database

運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学　バイオサイエンス研究科

生物種: Mus musculus

説明: 遺伝子トラップで得たマウスES細胞のデータベースです。詳細へ

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RA target genes in the Ciona embryo

運用機関: 高知大学　理学部

生物種: Ciona intestinalis

説明: カタユウレイボヤ胚におけるレチノイン酸標的遺伝子候補のマイクロアレイによる発現解析とWhole mount in situ hybridizationによる画像のデータベースです。詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

Mouse BAC browser

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所　筑波研究所

生物種: Mus musculus

説明: マウス（C57BL/6N系統）のBACライブラリーを構成するクローンの末端配列情報のデータベースです。詳細へ

実験動物研究資源バンク

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種: Mus musculus

説明: ヒト疾患モデルマウス（ライソゾーム病モデル、生活習慣病モデル、ネフローゼモデル、心筋症モデルなど）を収集し、提供しています。25 疾患・評価系に関連する、144系統のマウスの情報があ... 詳細へ

遺伝子クローン事業

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Pan troglodytes | Macaca fascicularis

説明: 主にヒトやマウスの遺伝子を凍結保存し、クローン情報の公開と分譲を行うサイトです。マウス脳cDNAクローン、カニクイザルcDNAクローン、染色体特異的クローン、ヒト疾患関連遺伝子cDNAクロ... 詳細へ

MBRDB: メディカル・バイオリソース・データベース

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

説明: 疾患研究資源の所在情報のデータベースです。実験動物、疫学研究、バイオバンクの3つのデータベースがあり、それぞれ、ヒト疾患研究のためのマウス・ラット等の系統情報、日本人を対象とする... 詳細へ

一括ダウンロード可

難病研究資源バンク

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 厚生労働省の難治性疾患克服研究事業で収集された難病患者試料（DNA、細胞など）を集約・保管し、分譲を行うバンク事業のサイトです。試料データベースの利用には利用者登録が必要です。詳細へ

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Open TG-GATEs

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種: Homo sapiens | Rattus norvegicus

説明: 131化合物（医薬品等）のin vivo（ラットの肝臓と腎臓）およびin vitro（ヒトとラットの肝細胞）暴露データ（遺伝子発現データ、毒性学データ）を集積したデータベースです。遺伝子発現デー... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

DGBY: Database for Gene function and expression of Baker's Yeast (パン酵母遺伝子データベース)

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　食品総合研究所

生物種: Saccharomyces cerevisiae

説明: パン酵母のポストゲノム解析による遺伝子発現・遺伝子機能データベースです。DNA マイクロアレイを用いた網羅的遺伝子発現解析（トランスクリプトミクス）や酵母遺伝子破壊株セットを用いた... 詳細へ

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作物学DATABASE

運用機関: 独立行政法人農業生物資源研究所

生物種:

説明: 作物関連の文献データベースです。詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

KAIKOcDNA

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Bombyx mori

説明: カイコcDNAの塩基配列データベースです。詳細へ

SGP: SILKWORM GENOME RESEARCH PROGRAM

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Bombyx mori

説明: カイコゲノム研究プログラムのホームページです。物理地図情報、遺伝地図情報、EST (Expressed Sequence Tag)情報、およびゲノム配列情報のすべてを統合した統合データベースKAIKObaseと、KA... 詳細へ

運用終了

Koshihikari vs Nipponbare SNP Database

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Oryza sativa

説明: コシヒカリと日本晴のSNP比較データベースです。詳細へ

RiceXPro: Rice Expression Profile Database

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Oryza sativa

説明: イネの遺伝子発現情報データベースです。詳細へ

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