データベースのレコード一覧  (件数: )

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運用機関: Churchill Group, The Jackson Laboratory, MRC Institute of Genetics & Molecular Medicine (IGMM), University of Edinburgh
生物種: Mus musculus
説明: e-Mouse Atlas (EMA) は、発生中のマウスの詳細なモデルです。本リソースの目的は、1) マウスの形状、全身の解剖学的構造、および詳細な組織学的構造に関する情報を提供すること、ならびに、... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Danio rerio | Drosophila | Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | ...
説明: ゲノミクスデータのメタ分析、再利用、および共有のためのデータベースです。現在のところ、遺伝子発現プロファイルの分析を主なターゲットとしています。Gemma には数千件の公的研究のデー... 詳細へ
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運用機関: STRENDA Commission
生物種: All
説明: Beilstein-Institut のサポートを受けるデータ保存・検索プラットフォームです。ユーザーフレンドリーなウェブベースのシステムに STRENDA ガイドラインが組み込まれています。機能的酵素に関... 詳細へ
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運用機関: eNanoMapper
生物種:
説明: ナノ材料の特性データと生物学的および毒物学的情報を収載する公開データベースです。情報を検索し探索し、様々な標準フォーマットでデータをダウンロードするための様々な機能を備えていま... 詳細へ
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運用機関: SIB Swiss Institute of Bioinformatics
生物種: Animalia | Archaea | Bacteria | Fungi | Viridiplantae
説明: ゲノムスケールで代謝ネットワークを集約することを目的とした、代謝産物と生化学反応の調和に関するデータベースです。MetaNetX において開発されたツールは、代謝ネットワークにアクセスし... 詳細へ
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運用機関: Francis Crick Institute
生物種: Mus musculus
説明: 本データベースは、Wellcome Trust Sanger 研究所で作成されたすべての胚性致死的ノックアウト株を特定するという野心的な目標の下、2013 年に開設されました。この目標の下、マウス個体の遺... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Homo sapiens
説明: 2 型糖尿病(T2D)に関するヒトの遺伝的情報を収載したオープンアクセスリソースです。DNA 変異体のうち、T2D または関連する形質(高いボディマス指数など)に伴うリスクの変化に関係するも... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Caenorhabditis | Drosophila | Homo sapiens | Mus musculus
説明: ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements) コンソーシアムは、米国の国立ヒトゲノム研究所(National Human Genome Research Institute:NHGRI)から資金提供を受けた研究グループによる国際... 詳細へ
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運用機関: Institute of Clinical Physiology (IFC-CNR), Icahn School of Medicine at Mount Sinai, Institute of Informatics and Telematics (ITT), National Research Council, Ohio State University, University of Catania
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明: 細胞外循環 RNA を取り扱った初めてのリソースです。最初のバージョンは、2012 年に Plos One で公開されました。主に、循環 miRNA およびその他のノンコーディング RNA に関する情報を含み... 詳細へ
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運用機関: Genomics England
生物種: Homo sapiens
説明: 100,000 Genomes Project データベースは、PanelApp ツール/アプリケーションを介して公開されているデータベースです。遺伝子パネルはウェブサイトから閲覧とダウンロードが可能です。また... 詳細へ
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運用機関: US Food and Drug Administration (FDA)
生物種: Homo sapiens
説明: グローバルユニークデバイス識別データベース(GUDID:Good ID と発音)は、UDI システムの一貫として、FDA が運営するデータベースです。デバイス企業が FDA に提出したデバイス識別情報を... 詳細へ
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運用機関: Bujnicki Lab, Laboratory of Bioinformatics and Protein Engineering, International Institute of Molecular and Cell Biology in Warsaw (IIMCB)
生物種: Aquifex aeolicus | Arabidopsis thaliana | Archaeoglobus fulgidus | Bacillus subtilis | Chlorobium tepidum | ...
説明: RNA修飾の生物学のための、初めての包括的なデータベースシステムです。修飾されたヌクレオシドの化学構造、RNA配列におけるそれらの局在、それらの生合成の経路、および(タンパク質補因子... 詳細へ
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運用機関: Laboratory of Integrative Structural & Chemical Biology (iSCB)
生物種: All
説明: タンパク質 - タンパク質相互作用(PPI)のモジュール化に特化した、構造的データベースです。手作業でキュレーションされています。タンパク質 - タンパク質複合体およびタンパク質 - モジ... 詳細へ
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運用機関: North Carolina State University
生物種: Bos taurus | Caenorhabditis elegans | Canis lupus | Danio rerio | Eumetazoa | ...
説明: ヒトの健康に対する環境化学物質の影響の理解を進展させるためのデータベースです。化学的遺伝子、化学的疾患、および遺伝子と疾患の関係についてのデータを、学術的文献から手動でキュレー... 詳細へ
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運用機関: European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), HLA Informatics Group, Anthony Nolan Research Institute
生物種: All
説明: 免疫系の遺伝子の多型性の研究のための集約システムとして2003年に開発されたデータベースです。 詳細へ
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運用機関: Plant Molecular Biology Institute (IBMP)
生物種: Arabidopsis thaliana | Brachypodium distachyon | Chlamydomonas reinhardtii | Cyanophora paradoxa | Ectocarpus siliculosus | ...
説明: 完全にアノテーションを付された植物の核、プラスチドおよびミトコンドリアゲノムから収集された tRNA 遺伝子配列を集約したデータベースです。各 tRNA 遺伝子について、線形二次構造ならび... 詳細へ
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運用機関: Cambridge Systems Biology Centre, University of Cambridge, European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
生物種: All
説明: MetaboLightsは代謝産物構造のデータベースです。このリソースは化合物の由来、生物学的役割、位置、濃度、代謝実験の実験データに関する情報を提供します。このデータベースのツールと機能... 詳細へ
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運用機関: Division Signaling and Functional Genomics, German Cancer Research Center (DKFZ) and University of Heidelberg
生物種: Drosophila melanogaster | Homo sapiens
説明: ホモサピエンスおよびキイロショウジョウバエの、文献に含まれるRNAi表現型ならびにRNAi試薬に関する詳細情報のコレクションです。データは他のリソースから得られた情報と十分に統合されて... 詳細へ
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運用機関: Fiona Brinkman Laboratory, Simon Fraser University
生物種: Archaea | Bacteria
説明: 配列が完全に決定された細菌ゲノムおよび古細菌ゲノムのオーソログに基づくオーソロジー予測を収録したデータベースです。細菌と古細菌における相互に最良の BLAST ベースのオーソログ予測、... 詳細へ
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運用機関: Shanghai Jiao Tong University
生物種: Bacteria
説明: 細菌におけるIV型分泌機構(T4SS)および同型のエフェクターのためのウェブベースのリソースです。 詳細へ
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運用機関:
生物種: Aedes aegypti | Anopheles gambiae | Arabidopsis thaliana | Bos taurus | Caenorhabditis elegans | ...
説明: 相互作用タンパク質の内およびそれらの間のタンパク質翻訳後修飾(PTM)の機能的連関性について、既知および予測のデータを集めたリソースです。 詳細へ
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運用機関: Institute of Integrative Biology, University of Liverpool
生物種: Caenorhabditis briggsae | Caenorhabditis elegans | Danio rerio | Drosophila melanogaster | Homo sapiens | ...
説明: 老化に関する生物学と遺伝学のためのデータベースとツールのコレクションです。手作業でキュレーションされた高品質のデータを備えた複数のデータベースを取り上げています。1)GenAge は、... 詳細へ
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運用機関: Karr Lab, Institute for Multiscale Biology & Genomics
生物種: Mycoplasma genitalium
説明: 全細胞モデルを実現にするべく設計された、モデル生物データベースのオープンアクセスコレクションです。現在、マイコプラズマ・ジェニタリウム、グラム陽性細菌、および一般的なヒト病原体... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Saccharomyces cerevisiae
説明: パン酵母、ビール酵母としても知られる出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)に見られる、またはこれから産生される小分子代謝産物に関する、手作業でキュレーションされたデータベースです... 詳細へ
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運用機関: Universiteit Maastricht, Gladstone Institutes
生物種: Anopheles gambiae | Arabidopsis thaliana | Bacillus subtilis | Bos taurus | Caenorhabditis elegans | ...
説明: 生物学的経路のキュレーションに特化したオープンな共同プラットフォームです。生物学コミュニティによる経路情報の寄贈およびメンテナンスを促進するために設立されました。 詳細へ
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運用機関: J. Craig Venter Institute (JCVI), Northrop Grumman Health IT, Vecna Technologies
生物種: Arenaviridae | Bunyaviridae | Caliciviridae | Coronaviridae | Filoviridae | ...
説明: 複数のウイルスファミリーのデータと分析ツールを提供する統合リポジトリです。アレルギー・感染症研究所(NIAID)のバイオインフォマティクスリソースセンター(BRC)プログラムの支援を受... 詳細へ
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運用機関: Department of Biomolecular Engineering, University of California Santa Cruz, Center for Biomolecular Science and Engineering, School of Engineering, University of California Santa Cruz, University of California
生物種: Archaea | Plasmodium falciparum
説明: 古細菌ドメインに属する 100 以上の微生物種の生物学的情報を提供するツールです。基本的な遺伝子アノテーションは、NCBI Genbank / RefSeq のエントリーから抽出されたものです。アノテーシ... 詳細へ
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運用機関: National University of Singapore
生物種: All
説明: 治療用タンパク質および核酸標的、標的疾患、経路情報およびこれらの標的の各々に向けられた薬剤に関する情報を提供します。このデータベースには、関連データベースへのリンクも含まれてお... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Arabidopsis thaliana | Escherichia coli | Homo sapiens | Mus musculus | Saccharomyces cerevisiae
説明: タンパク質末端のアノテーションを収録したデータベースです。現在第3版です。非カノニカルなタンパク質末端は、翻訳前プロセス(代替スプライシングや代替翻訳開始など)またはプロテアーゼ... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Prochlorococcus marinus | Synechococcus | unclassified T4virus | unclassified Myoviridae | unclassified dsDNA phages | ...
説明: 海洋性ラン藻プロクロロコッカスのゲノム、メタゲノム、転写に関する情報ならびにフィールドデータを収録したデータベースです。様々なスケールでの生物学的組織化(ゲノムから生態系まで)... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Archaea | Bacteria
説明: 現在最も正確かつ完全なオペロン予測リポジトリの一つです。 独自の新しい高精度オペロンアルゴリズムを用いることで、1,200 以上の原核生物のゲノムのオペロン構造を予測しています。 詳細へ
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運用機関: Center for Computational and Integrative Biology
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: PCR プライマーのための公共のリソースです。これらのプライマーは、遺伝子発現の検出または定量化(リアルタイム PCR)用に設計されています。PrimerBank には、最もよく知られているヒトお... 詳細へ
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運用機関: Department of Biochemistry, University of Cambridge, National Center for Biological Sciences (NCBS), Department of Crystallography, Birkbeck College, University of London
生物種: All
説明: タンパク質スーパーファミリーの構造的モチーフのアラインメントを収録するデータベースです。PASS2 は、元のスーパーファミリーアラインメントデータベース CAMPASS (CAMbridge database of... 詳細へ
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運用機関: Computer and Laboratory Investigation of Proteins of Human Origin Group (CALIPHO), Swiss Institute of Bioinformatics, SIB Swiss Institute of Bioinformatics
生物種: Homo sapiens
説明: タンパク質関連のデータをシームレスに統合することができ、またそのためのナビゲーションを提供する、包括的なヒト発見プラットフォームです。 詳細へ
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運用機関: Korean Bioinformation Center (KOBIC), Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB)
生物種: Homo sapiens
説明: 異なる 2 タイプの統合データを提示するデータベースです。経路レベルでの統合データは、元のデータベースで説明された個々の経路を単純に集めたものです。また、エンティティレベルの統合デ... 詳細へ
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運用機関: Theoretical Biology and Biophysics, T-10, Los Alamos National Laboratory
生物種: Nairovirus | Viruses | Zika virus
説明: HFV データベースは、2009年にロスアラモス国立研究所 (LANL)で Carla Kuiken 博士が創設した出血熱ウイルス(HFV)データベースプロジェクトから誕生しました。Bette Korber 博士が主導し... 詳細へ
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運用機関: Universal Mutations Database (UMD)
生物種: Homo sapiens
説明: BRCA1 および BRCA2 遺伝子データを含む BRCA Share(旧UMD-BRCA1)へのアクセスを世界中の科学者および民間試験機関に提供する、新しい遺伝子データ共有の取り組みです。本プログラムは、BR... 詳細へ
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運用機関: Bioinformatics Centre, Institute of Microbial Technology, Council of Scientific and Industrial Research (CSIR)
生物種: Arenaviridae | Bunyaviridae | Coronaviridae | Filoviridae | Flaviviridae | ...
説明: ウイルスゲノム領域を標的とするウイルスの siRNA / shRNA に関する情報を収録しています。情報は実験的に検証されたものです。本データベースは、siRNA 配列、ウイルス標的およびサブタイプ... 詳細へ
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運用機関: Institute for Biomedical Informatics (IBI), University of Pennsylvania, Diana Lab Group, Biomedical Sciences Research Center Alexander Fleming (BSRC)
生物種: Arabidopsis thaliana | Bombyx mori | Bos taurus | Caenorhabditis elegans | Danio rerio | ...
説明: DIANA-TarBase は、2006年に最初に公開され、実験的に検証された miRNA-遺伝子の相互作用のカタログ化を目的とした最初のデータベースでした。DIANA-TarBase(v7.0)は、高品質の手動で実験... 詳細へ
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運用機関: The Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics Lab, Novosibirsk State University
生物種: Anopheles gambiae | Ascaris suum | Bos taurus | Caenorhabditis elegans | Canis familiaris | ...
説明: 真核生物のタンパク質機能部位に関する情報を含むデータベースです。本データベースは、機能部位におけるアミノ酸配列位置を、コーディング遺伝子のエクソン構造との関連とともに収録してい... 詳細へ
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運用機関: McDonnell Genome Institute at Washington University School of Medicine, Genome Technology Access Center, Department of Genetics, Washington University School of Medicine
生物種: Ancylostoma caninum | Ancylostoma ceylanicum | Ancylostoma duodenale | Ascaris suum | Brugia malayi | ...
説明: ワシントン大学セントルイス校・ゲノム研究所が実施する寄生線虫 EST プロジェクトのホームページです。本サイトは、NIH-NIAID 助成プロジェクト "A Genomic Approach to Parasites from the ... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Metazoa | Placozoa
説明: 平板動物門を除いて、完全なおよびほぼ完全な(7 kbより長い)mtDNA エントリーを集めた専門的なデータベースです。MitoZoa は、半自動リアノテーションパイプラインを使用し、かつミトゲノ... 詳細へ
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運用機関: Columbia University
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: ヒトおよびマウスの脳における DNA メチル化プロファイルについての詳細な情報を提供するリソースです。ヒトおよびマウスの脳におけるゲノムワイドの DNA メチル化プロファイルが収録されて... 詳細へ
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運用機関: Systems Biology Laboratory of Gwangju Institute of Science and Technology, Department of Life Sciences
生物種: Homo sapiens
説明: 手作業でキュレーションされ、かつ高度に構造化された、ヒトの経路データのコレクションです。あわせて、いくつかの公共データベースから得られた生物学的経路についての情報を統合します。... 詳細へ
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運用機関: University of Hong Kong
生物種: Homo sapiens
説明: 現在の GWAS から得られる形質/疾患関連 SNP(TAS)と、その包括的な機能性アテーション、ならびに疾患分類のコレクションにより構成されるデータベースです。 詳細へ
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運用機関: Institute for Microbial Technology
生物種: All
説明: タンパク質の構造的または機能的アノテーションに広く使用されるデータセットのコレクションです。文献および 蛋白質構造データバンク (PDB:Protein Data Bank) から取得された非常に多くの... 詳細へ
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運用機関: Wishart Lab, University of Alberta
生物種: Archaea | Bacteria
説明: アノテーションが付された細菌ゲノムの写真アトラスです。細菌ゲノムマップのインタラクティブな視覚的データベースです。完全に標識された、ズーム可能な、検索可能なマップが、数百収録さ... 詳細へ
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運用機関: Mayo Clinic
生物種: Danio rerio
説明: ゼブラフィッシュのトランスポゾン標識変異体のリアルタイムデータベースです。研究コミュニティにおける連携を促進するため、規模を問わずゼブラフィッシュの GBT 変異誘発プロジェクトにサ... 詳細へ
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運用機関: The Biotechnology Center (BIOTEC), Technische Universitat Dresden, European Molecular Biology Organisation (EMBO), University of Copenhagen
生物種: All
説明: 化学物質とタンパク質間の既存および予測される相互作用を探索することができるリソースです。実験、データベースおよび文献から得られたエビデンスに基づいて、化学物質を他の化学物質およ... 詳細へ
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運用機関: Korean Bioinformation Center (KOBIC), Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB)
生物種: All
説明: PDB に寄託された NMR 構造の精査したバージョンを収録するデータベースです。これらの精査は、統計的ねじれ角ポテンシャルと構造的または実験的に導出された距離ポテンシャルを用いて行われ... 詳細へ