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DASH: Database of Aligned Structural Homologs

運用機関: 大阪大学　蛋白質研究所

生物種:

説明: PDBエントリに対し、似た構造のタンパク質ドメインやタンパク質鎖を検索するデータベースです。PDB IDで検索するとタンパク質鎖のIDや代表的なドメインのリストが表示されます。また、アミノ... 詳細へ

Sequence Navigator

運用機関: 大阪大学　蛋白質研究所

生物種:

説明: PDBエントリに対し、PDB ID やアミノ酸配列を入力してBLAST検索を行います。結果を類似性でクラスタリングする機能があり、また PDB ID 入力では、各配列の構造の重ね合わせができます。PDBj... 詳細へ

休止
(14日以上)

バイオ基幹情報資源の高準化と共用化

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種:

説明: バイオ研究分野の膨大なデータを標準形式化し、バイオ情報資源の選択的統合利用を可能にすることを目指した「バイオ基幹情報資源の高準化と共用化」BIRD受託事業の一環で作成されたデータベ... 詳細へ

休止
(14日以上)

BioDataBaseShowcase

運用機関: 東京理科大学

生物種:

説明: 生物学分野のデータベース情報をまとめたデータベースです。概要やカテゴリ、PubMed IDなどのリストを閲覧できます。また、いわゆるリンク集ではなくデータベースごとにCGI情報をまるごと保... 詳細へ

運用終了

GIB-IS: Genome Information Broker for Insertion sequence

運用機関: 情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所　生命情報・DDBJ研究センター

生物種: Bacteria

説明: DDBJに登録されている塩基配列から抽出したバクテリアの挿入配列（IS)のデータベースです。詳細へ

休止
(14日以上)

BSD: BioSimulated DataBase

運用機関: 情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所

生物種: Homo sapiens | Mus musculus

説明: さまざまなデータソース（マイクロアレイ、EST、SAGE）を扱う遺伝子発現解析システム。空間的、時間的変化による遺伝子発現情報を3次元グラフィック上で表示することができます。また、異な... 詳細へ

運用終了

一括ダウンロード可

GTPS: Gene Trek in Prokaryote Space

運用機関: 情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所　生命情報・DDBJ研究センター

生物種: Archaea | Bacteria

説明: ゲノム配列が決定された原核生物を対象に各種解析を行い再アノテーションを行ったデータベース。GIB (Genome Information Broker) に登録されている真正細菌と古細菌のORFを共通プロトコルを... 詳細へ

一括ダウンロード可

DoBISCUIT: Database Of BIoSynthesis clusters CUrated and InTegrated

運用機関: 独立行政法人製品評価技術基盤機構

生物種: Streptomyces | Bacteria

説明: 細菌がもつ二次代謝産物の生合成遺伝子クラスターについての知見を集約したデータベースです。放線菌をはじめとする細菌が産生する二次代謝産物は医薬品・化合物合成の候補品として注目され... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

PoSSuM: Pocket Similarity Search using Multiple-Sketches

運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所

生物種:

説明: タンパク質の類似リガンド結合部位データベースです。詳細へ

MFSearcher: Kazusa Molecular Formula Searcher

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

生物種:

説明: 精密質量値から予測される組成式を高速に推定することができます。既存の化合物データベースに対する質量値からの検索も高速に行えます。詳細へ

PMPj-Blast

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

生物種: Lotus japonicus | Arabidopsis thaliana

説明: ミヤコグサやシロイヌナズナのESTや完全長cDNA、マイクロアレイプローブなど、PMPj （NEDO植物物質生産プロジェクト、H14-22）で得られた遺伝子配列情報をBlast検索することができるデータ... 詳細へ

MCG CNV Database

運用機関: 東京医科歯科大学

生物種: Homo sapiens

説明: 日本人の健常者集団を対象として独自に開発したBACアレイ（ MCGアレイ）ならびにSNPアレイ (illumina, HumanOmniExpress Beadchip)を用いた解析を行い、検出された CNVと LOHを収録したデ... 詳細へ

FuLoJa: Lotus japonicus Full-length cDNA Databases

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

生物種: Lotus japonicus

説明: ミヤコグサの完全長cDNAの配列情報をInterProで解析したデータを集積したデータベースです。詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

WorTS （アーカイブ）: Worm TS mutant database

運用機関: 大阪大学微生物病研究所

生物種: Caenorhabditis elegans

説明: 表現型および遺伝子名から検索可能な線虫の胚発生致死温度感受性変異株のデータベース。変異株毎に、遺伝子名等の一般的な情報、及び変異情報、表現型の情報等を格納しています。大阪大学 ... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

SSBC: Systems and Structural Biology Center

運用機関: 特定国立研究開発法人理化学研究所

生物種: Homo sapiens | Mus musculus

説明: 高等動植物等タンパク質の立体構造解析実験データベース。タンパク3000プロジェクトにおいてRSGIにより取得された、Ｘ線回折画像データ、結晶化スクリーニング観察画像データと、発現・精製... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

ClEST: トコジラミ器官ESTデータベース

運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所生物プロセス研究部門

生物種: Cimex lectularius

説明: トコジラミCimex leculariusのさまざまな器官や体全体に発現する遺伝子配列（EST)のデータベースです。トコジラミはヒトなどの温血動物を吸血する害虫です。この昆虫は体内に栄養相利共生細... 詳細へ

ADFS: アレルゲンデータベース (Allergen Database for Food Safety)

運用機関: 厚生労働省　国立医薬品食品衛生研究所

生物種:

説明: 食物アレルギーを引き起こす抗原（アレルゲン）のデータベースです。アレルゲンタンパク質や低分子量アレルゲン化合物の情報を提供しています。アレルゲンタンパク質については、文献やAller... 詳細へ

運用終了

食品添加物ADI関連情報データベース

運用機関: 厚生労働省　国立医薬品食品衛生研究所

生物種:

説明: 食品添加物の一日許容摂取量（Acceptable Daily Intake；ADI）に関するデーターベースです。海外のデータはJECFA（Joint FAO/WHO Expert Committee on Food Additives）の情報，国内のデータ... 詳細へ

運用終了

農薬等ADI関連情報データベース

運用機関: 厚生労働省　国立医薬品食品衛生研究所

生物種:

説明: 農薬等の一日許容摂取量（Acceptable Daily Intake；ADI）に関するデーターベースです。海外のデータはJMPR（Joint FAO/WHO Meeting on Pesticide Residues）およびJECFA（Joint FAO/WHO Exp... 詳細へ

休止
(14日以上)

食品添加物含有量データベース

運用機関: 厚生労働省　国立医薬品食品衛生研究所

生物種:

説明: 生鮮食品および加工食品に含まれる、天然由来の食品添加物の自然含有量を収載したデータベースです。1997年までに国立医薬品食品衛生研究所・大阪支所食品試験部（2004年3月31日に閉鎖）で行... 詳細へ

毒物及び劇物取締法 (毒劇法)

運用機関: 厚生労働省　国立医薬品食品衛生研究所

生物種:

説明: 毒物および劇物のデータベースです。毒物及び劇物取締法（毒劇法）の対象となっている物質が収載されています。官報告示名、化学物質名またはCAS登録番号で検索できます。データベースの検索... 詳細へ

休止
(14日以上)

遺伝子組換えデータベース

運用機関: 厚生労働省　国立医薬品食品衛生研究所

生物種:

説明: 非食用モダンバイオテクノロジー応用植物・生物（医薬品遺伝子組換え植物・生物および工業原料遺伝子組換え植物・生物など）の食品への混入を監視することを目的とした、非食用の遺伝子組換... 詳細へ

日本語版ICSC (ICSC in Japanese): 国際化学物質安全性カード(ICSC) 日本語版 (International Chemical Safety Cards (ICSC) Japanese Version)

運用機関: 厚生労働省　国立医薬品食品衛生研究所

生物種:

説明: ICSCは、化学物質を扱う労働者など化学や毒性の専門家でない人々を対象に化学物質の健康や安全に関する重要な情報を簡潔にまとめたものです。国際的に認められた専門家達が健康や安全性に関... 詳細へ

JAN: 日本医薬品一般名称データベース (Japanese Accepted Names for Pharmaceuticals)

運用機関: 厚生労働省　国立医薬品食品衛生研究所

生物種:

説明: 医薬行政・研究のための基盤となる情報を提供することを目的として、日本で一般的名称が付けられたすべての医薬品について、医薬品の名称、日本薬局方収載状況、構造式、化学名、分子式、CAS... 詳細へ

第十七改正日本薬局方名称データベース (The Japanese Pharmacopoeia Sixteenth Edition (JP17) Name and Structure Database)

運用機関: 厚生労働省　国立医薬品食品衛生研究所

生物種:

説明: 第十七改正日本薬局方に収載されている化学薬品等および生薬等について、名称、構造式、化学名、分子式、CAS登録番号、本品記載などをデータベース化したものです。現在公開しているデータベ... 詳細へ

運用終了

HSRRB: ヒューマンサイエンス研究資源バンク (Health Science Research Resources Bank)

運用機関: ヒューマンサイエンス振興財団

説明: ヒューマンサイエンス研究資源バンクでは、高等動物の細胞・遺伝子バンク業務に加え、ヒト組織バンク業務、日本人の遺伝子多型解析に有用な日本人由来B細胞株・DNAのバンク業務を行っていま... 詳細へ

休止
(14日以上)

振動障害HP・データベース

運用機関: 独立行政法人労働者健康福祉機構

生物種:

説明: 振動障害の診療等に携わっている労災指定医療機関の医師や産業医の研究・診療の参考となることを目的に作成されており、労災病院に蓄積された振動障害の臨床データを集積したデータベースの... 詳細へ

休止
(14日以上)

腰痛データベース

運用機関: 独立行政法人労働者健康福祉機構

生物種:

説明: 腰痛についての大規模調査の成果から、各調査の概要とレポートを掲載しています。腰痛の大規模調査は、勤労者脊椎・腰痛センターを中心に全国の労災病院で実施されています。詳細へ

休止
(14日以上)

じん肺データーベース

運用機関: 独立行政法人労働者健康福祉機構

生物種:

説明: じん肺診療に携わる医療関係者の研究、診療等の参考となることを目的に作成されており、じん肺症例の分類、所見、レントゲンやCTなどの各種画像が閲覧できます。全国の労災病院からじん肺患... 詳細へ

休止
(14日以上)

産業中毒文献検索

運用機関: 独立行政法人労働者健康福祉機構

生物種:

説明: 産業中毒の研究者向けに産業中毒の症例・論文・学会発表の情報を提供しています。産業中毒、災害医学、産業医学、産業衛生学などの分野の国内学術誌や学会抄録集から産業中毒を中心とするデ... 詳細へ

がん情報サービスレファレンスリスト

運用機関: 国立研究開発法人国立がん研究センター

生物種: Homo sapiens

説明: がんに関連する、科学的根拠に基づく診療ガイドラインおよびそれに準じた診療ガイドラインや資料をデータベースとしたものです。日本国内と欧米の両方の情報が収集され、リンクされています... 詳細へ

がん研究データベース

運用機関: 国立研究開発法人国立がん研究センター

生物種:

説明: がん研究開発費（正式名称は国立研究開発法人国立がん研究センター運営費交付金研究開発費，旧がん研究助成金）によって行われる研究をデータベース化したものです。研究の基本情報、研究者... 詳細へ

一括ダウンロード可

緊急安全性情報（イエローレター）・安全性速報（ブルーレター）

運用機関: 独立行政法人医薬品医療機器総合機構

生物種:

説明: 医薬品または医療機器の「緊急安全性情報」と「安全性速報」を提供しているサイトです。医薬品または医療機器の製造販売業者が作成した情報をPDF化したものが掲載されています。「緊急安全性... 詳細へ

2009年度以降の医薬品及び医療機器の回収に関する情報 (回収情報検索ページ）

運用機関: 独立行政法人医薬品医療機器総合機構

生物種:

説明: 2009年度以降の医薬品および医療機器の回収（リコール）に関する情報のデータベースです。提供している情報は、医薬品等の回収を行う製造販売業者等が作成したものです。回収品目、種類、製... 詳細へ

一括ダウンロード可

DSU（医薬品安全対策情報）

運用機関: 独立行政法人医薬品医療機器総合機構

生物種:

説明: DSU（医薬品安全対策情報；Drug Safety Update）は、医療用医薬品の「使用上の注意」改訂に関する情報です。日本製薬団体連合会安全対策情報部会に参加している製薬企業が製造または輸入して... 詳細へ

医療用医薬品の添付文書情報【禁忌】

運用機関: 独立行政法人医薬品医療機器総合機構

生物種:

説明: 医療用医薬品（体外診断薬を除く）の添付文書に書かれている禁忌情報（その医薬品を使用してはいけない患者の情報）のデータベースです。医薬品名（一般名または販売名）での検索および医薬... 詳細へ

医療用医薬品の添付文書情報【副作用】

運用機関: 独立行政法人医薬品医療機器総合機構

生物種:

説明: 医療用医薬品（体外診断薬を除く）の添付文書に書かれている副作用情報のデータベースです。医薬品名（一般名または販売名）での検索および医薬品名（販売名）の五十音順リストを利用して探... 詳細へ

医療用医薬品情報検索

運用機関: 独立行政法人医薬品医療機器総合機構

生物種:

説明: 医療用医薬品（体外診断薬を除く）の添付文書の内容を各製薬企業において電子化したものを提供しています。添付文書の内容をWeb上で閲覧できるほか、PDFおよびSGML形式のファイルをダウンロ... 詳細へ

休止
(14日以上)

国立健康・栄養研究所産学連携提案テーマデータベース

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種:

説明: 医薬基盤・健康・栄養研究所の最新の成果の概要と、それに基づく発展的な研究テーマについてのデータベースです。産学連携で研究成果の具体化や発展化に共同で取りくむことを考えている企業... 詳細へ

運用終了

特別用途食品・栄養療法エビデンス情報 (Information on Food for Special Dietary Uses and Nutrition Care)

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種:

説明: 栄養療法や特別用途食品を、管理栄養士などの専門家や一般消費者が自主的に「利用する」あるいは「利用しない」などの選択を行う際の指針となることを目的としているサイトです。主に専門職... 詳細へ

一括ダウンロード可

国民栄養の現状

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種:

説明: 1947年（昭和22年）から2002年（平成14年）まで実施された国民栄養調査（現在の国民健康・栄養調査）の結果を集約したデータベースです。この調査は栄養改善法（現在の健康増進法）に基づい... 詳細へ

健康・体力と身体活動・運動に関する文献データベース

運用機関: 公益財団法人健康・体力づくり事業財団

生物種:

説明: 運動と生活習慣病予防、健康増進についての、最新かつ可能な限り科学的根拠 (エビデンス) の高い文献を1,200本余収集し、その概要を提供するデータベースです。疫学、運動生理学を中心とした... 詳細へ

運用終了

健康づくりに向けた『食育』取組データベース

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 「食育推進基本計画」、「健康日本２１」等の健康づくりに関連した指標に関する各種事業の取組のデータベースです。全国の自治体で実施している食育の事例の登録を受けつけています。団体区... 詳細へ

休止
(14日以上)

Gene Brain Systems.nimh

運用機関: National Institute of Mental Health

生物種: Mus musculus

説明: GENSATプロジェクトによって提供された、BACトランスジェニックマウスの脳細胞の発現画像を検索・閲覧することができます。詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

Plabrain DB: Planarian Brain Database

運用機関: 京都大学大学院　理学研究科

生物種: Dugesia japonica

説明: プラナリアの神経回路形成に関わる遺伝子群の、単一細胞ごとの遺伝子発現情報、Whole-mount in situ hybridizationによる発現解析、および組織免疫染色による解析データを収録したデータベー... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

Tomato SBM Database: Tomato selected BAC clone mixture Database

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

生物種: Solanum lycopersicum

説明: トマト品種マイクロトムのBACライブラリーを構成するクローンの末端配列情報のデータベースです。配列、BLAST検索により一致する外部データベースでの情報、予想されるタンパク質ファミリー... 詳細へ

統合TVへ

TargetMine

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種:

説明: 創薬支援のための統合データウェアハウスです。16 個の公共データベースからのデータを統合し、タンパク質立体構造や医薬品関係データ、タンパク質相互作用や転写因子制御データなどの統合的... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

Togo Picture Gallery

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: ライフサイエンス分野のイラストをだれでも自由に利用できるよう無料で公開しています。研究発表のスライドなどで使用することが可能です。詳細へ

運用終了

kusarinoko: Search SRA Entries with PubMed Article

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: 公共データベースに登録されている次世代シーケンサから出力された配列データを対象に、メタデータ（実験手法やサンプルなどの登録情報）を検索・閲覧することができます。単独のサイトとし... 詳細へ

ライフサイエンスQA

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: ライフサイエンス研究に関する質問や疑問、それに対する回答を共有するためのQAサイトです。質問及び回答は誰でも投稿可能ですが、対象ユーザーはライフサイエンス研究に携わっている人を想... 詳細へ

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