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FiT-DB: Field transcriptome database

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Oryza sativa

説明: FiT- DBは、圃場におけるイネ（日本晴－農林８号）の葉の遺伝子発現データと、遺伝子発現変化の背景にある要因の統計モデリング解析結果のデータベースです。遺伝子ごとの発現量や気象条件 ... 詳細へ

休止
(14日以上)

一括ダウンロード可

bex-db: Barley Gene Expression Database (オオムギ完全長cDNAデータベース)

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Hordeum vulgare

説明: オオムギ完全長cDNA遺伝子と遺伝子発現情報のデータベースです。塩基配列、マイクロアレイ解析による遺伝子発現データを収録し、IBSCによって解析されたゲノム情報を基にしたゲノムブラウザ... 詳細へ

運用終了

AfRicA DB: African Rice Annotation DataBase

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Oryza glaberrima

説明: AfRicA DBはアフリカ米 (Oryza glaberrima, IRGC104038) のゲノムについてまとめたデータベースです。ゲノムアノテーション情報、挿入/欠失、SNP、SSRなどの情報を収録しています。BLAST探索... 詳細へ

運用終了

PGF-DB: Plant Gene Family Database

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Arabidopsis thaliana | Oryza sativa | Sorghum bicolor | Zea mays

説明: PGF-DBは、RAP-DB (Rice Annotation Project Database)とつないで、イネ、ソルガム (モロコシ) 、トウモロコシ、シロイヌナズナの遺伝子ファミリーを解析するためのデータベースです。各遺伝... 詳細へ

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(14日以上)

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Komugi GSP: Komugi Genome Sequence Program

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Triticum aestivum

説明: コムギゲノムに関する統合データベースです。ゲノム配列、遺伝子発現情報、アノテーション情報やゲノム解読に関する論文、学会情報を収録しています。コムギ、オオムギの配列に対するBLAST検... 詳細へ

休止
(14日以上)

fpgp: Flowering Plant Gene Picker

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Viridiplantae

説明: 顕花植物のゲノムをアノテーションするためのウェブサービスです。Oryza sativa、 Zea mays、 Arabidopsis thaliana、 Solanum lycopersicumなど１０種の顕花植物の報告された完全長 cDNA（F... 詳細へ

DAIZUbase

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Glycine max

説明: DAIZUbaseは大豆ゲノムのデータベースです。遺伝子ごとに染色体上の位置、配列の情報が収録されています。マップブラウザ、遺伝子ビューア、およびBLAST検索システムを備えており、Gbrowseや... 詳細へ

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Raphanus sativus Genome DataBase

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

生物種: Raphanus sativus

説明: ダイコン (Raphanus sativus、ラファナス　サチブス) のDNAマーカーデータベースです。EST-SSR、Isozyme marker、Morphological marker、R-EST、RAPD、RFLP、SSR、STSに関する配列情報を収録... 詳細へ

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Carnation DB

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

生物種: Dianthus caryophyllus

説明: カーネーション (Dianthus caryophyllus、ダイアンサス　カリオフィラス)のゲノム情報のデータベースです。遺伝子ごとに配列データに加えてGOなどによるアノーテーション情報やUniProtなどの... 詳細へ

日本人由来Ｂ細胞株・ＤＮＡバンク

運用機関: 国立研究開発法人　医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 約2,000名の日本人由来のＢ細胞を不死化した細胞株と、同細胞株から抽出されたDNAを分譲しているデータベースです。この中には約1,400名の健常人（一般集団）に由来するB細胞株のDNAも含まれ... 詳細へ

ヒト組織バンク

運用機関: 国立研究開発法人　医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 患者への十分な説明と同意のもとに摘出されたヒト組織を匿名化などの個人情報保護に係る手続きを厳格に行った上で、研究者に分譲しています。詳細へ

休止
(14日以上)

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

KNApSAcK Bicycle: KNApSAcK Bicycle Algae Metabolic Pathway

運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学

生物種: Stramenopiles | Cyanobacteria | Cryptophyta | Chlorophyta

説明: 藻類のタンパク質と二次代謝反応の情報を集めたデータベースです。94種類の藻類に存在する96,641個のタンパク質の情報と、これらのタンパク質が関与する化学反応 (614反応)の情報が調べられ... 詳細へ

TradMPD: 伝統医薬データベース

運用機関: 富山大学　和漢医薬学総合研究所

生物種:

説明: 生薬や漢方薬、および生薬に含有される化合物についての各種情報のデータベースです。生薬の学術情報や関連植物の遺伝子情報、また漢方方剤の構成生薬、文献情報や疾患別頻用漢方方剤を調べ... 詳細へ

NCBNカタログデータベース

運用機関: 国立高度専門医療研究センター

生物種: Homo sapiens

説明: 国立高度専門医療センター（ナショナルセンター）で収集したバイオバンク試料を検索することができるデータベースです。６つのナショナルセンターが各々の専門性（がん、循環器疾患、精神... 詳細へ

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病気の解説　難病情報センター

運用機関: 難病医学研究財団

生物種: Homo sapiens

説明: 難病と呼ばれる疾患のうち，厚生労働省が難治性疾患克服研究事業（臨床調査研究分野）の対象としている疾患を中心に解説したページです。詳細へ

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HGVD: Human Genetic Variation Database

運用機関: 京都大学

生物種: Homo sapiens

説明: 日本人健常者のゲノム配列を解析したデータベースです。難病の原因遺伝子同定や、見いだされた遺伝変異が疾患発症に関わるかの評価分析のための活用を目的として構築されました。1,208検体の... 詳細へ

MiFuP: Microbial Functional Potential (微生物遺伝子機能検索DB)

運用機関: 独立行政法人製品評価技術基盤機構

生物種: Bacteria | Archaea

説明: MiFuPはゲノム配列情報から微生物の機能を推定するデータベースです。ゲノム配列が読まれている微生物について、その推定機能を収録しており、キーワード検索により、目的の機能を持つと推定... 詳細へ

運用終了

XS-TBR: つくば生物医学資源横断検索システム

運用機関: つくば国際戦略総合特区

生物種:

説明: つくば地区の研究機関（医薬基盤研究所薬用植物資源研究センター、筑波大学、農業生物資源研究所、理化学研究所）が保有する生物医学資源のデータベースを横断的に検索するシステムです。... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

FANTOM5: Functional Annotation of the Mammalian Genome

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所

生物種: Homo sapiens | Mus musculus

説明: FANTOMは、ゲノムDNAから転写されているRNAの機能をカタログ化することを目的として2000年に発足した理化学研究所が主催する国際研究コンソーシアムです。これまでに第４期に渡って活動が行... 詳細へ

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AgrID: 農畜産物ゲノム情報データベース

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種:

説明: AgrIDでは、農畜産物のゲノム情報のポータルサイトとして、主に農林水産省が進めたゲノム関連プロジェクトで作成されたデータベースをまとめています。またNIAS横断検索では、文部科学省、厚... 詳細へ

薬用植物総合情報データベース

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種: Embryophyta

説明: 「薬用植物総合情報データベース」は、漢方薬・生薬に用いられる薬用植物に関するさまざまな情報を、簡単な操作で検索・閲覧することができる、薬用植物の「総合図鑑」です。薬用植物の情報... 詳細へ

YOKOBAI (NC: green rice leafhopper) EST

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Nephotettix cincticeps

説明: ツマグロヨコバイ (Nephotettix cincticeps) のESTデータベースです。データは、様々な発生段階や組織から構築されたcDNAライブラリーに由来しています。クローンごとに、配列情報に加えてG... 詳細へ

PVcDNA: YUSURIKA cDNA

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Polypedilum vanderplanki

説明: ネムリユスリカ (Polypedilum vanderplank) のESTデータベースです。データは幼虫全体から得られたｃDNAライブラリーに由来しています。クローンごとに、配列情報に加えてGene Ontologyによ... 詳細へ

PcsEST: KAMEMUSHI (PS: oriental stink bug) EST

運用機関: 国立研究開発法人　農業・食品産業技術総合研究機構

生物種: Plautia stali

説明: 果樹の害虫として知られるチャバネアオカメムシ（Plautia crossota stali）のESTデータベースです。データはメス成虫の中腸から構築された2つのcDNAライブラリに由来しています。クローンご... 詳細へ

J-CHECK: 化審法データベース

運用機関: 独立行政法人製品評価技術基盤機構

生物種:

説明: J-CHECKは、「化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律」にかかわる厚生労働省、経済産業省及び環境省が、化学物質の安全性情報の発信基盤の充実・強化を目指して化学物質の安全性情報を... 詳細へ

ARTRA: Arabidopsis DNA Microarray probe information

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

生物種: Arabidopsis thaliana

説明: タカラバイオ株式会社との共同で作製した、シロイヌナズナのマイクロアレイ情報を提供しているデータベースです。DNAマイクロアレイやRNAi設計に利用できる転写産物や遺伝子特異的な配列を格... 詳細へ

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Strawberry GARDEN: Strawberry Genome And Resource ENtry

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

説明: 食用イチゴのゲノムに関するデータベースです。栽培品種であるFragaria x ananassaのゲノムを近縁野生種４種と比較し、公開されている１品種のゲノム上にマップして得られた遺伝子の、シーケ... 詳細へ

一括ダウンロード可

Coelacanth Genome Project

運用機関: 情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所

生物種: Latimeria chalumnae | Latimeria menadoensis

説明: シーラカンスのゲノム情報を集めたデータベースです。Gbrowseによる閲覧、Blast検索、キーワード検索が可能です。また、頭部のＣＴ画像や３次元像なども収録されています。詳細へ

iNTRODB: Integrated Neglected TROpical disease DataBase

運用機関: 東京工業大学

生物種: Leishmania major | Trypanosoma cruzi | Trypanosoma brucei | Schistosoma haematobium | Plasmodium falciparum

説明: 顧みられない熱帯感染症 (NTDs)の原因病原体に関する情報を統合した創薬研究向けのデータベースです。原因病原体であるトリパノソーマ科寄生原虫の全遺伝子情報、蛋白質構造情報、関連化合物... 詳細へ

休止
(14日以上)

ニュートリゲノミクス機能性評価データベース

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　食品総合研究所

生物種:

説明: 各種食品成分の動物試験による機能性評価法、およびその結果（DNAマイクロアレイ解析、生化学的データなど）を収めたデータベースです。DNAマイクロアレイを用いて動物組織での遺伝子発現を... 詳細へ

公開停止中

組換え農作物の安全性評価のための食品成分データベース

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　食品総合研究所

生物種: Oryza sativa | Glycine max

説明: 様々な地域で栽培された水稲（玄米）と大豆について、各成分を分析したデータベースです。品種、産地、収穫年、成分項目、測定値、試験方法が一覧になっています。品種、産地、成分項目、収... 詳細へ

MRV: Microbial Responses Viewer

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　食品総合研究所

生物種: Bacteria

説明: 食品環境における微生物の増殖/非増殖データのデータベースです。国際予測微生物データベースComBaseに収録されているデータから抽出した各種微生物の情報が、培地ベースのデータと食品由来... 詳細へ

休止
(14日以上)

酵素一覧

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　食品総合研究所

生物種:

説明: 日本国内で市販されている酵素とその用途に関するデータベースです。タンパク質およびアミノ酸、糖質、脂質に関連する酵素や酸化酵素について、商品名、起源、用途、酵素メーカー名を収録し... 詳細へ

運用終了

青果ネットカタログ

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　食品総合研究所

生物種: Embryophyta | Ascomycota | Basidiomycota

説明: 野菜、果物、米、茶などの農作物一品ごとの生産出荷情報を登録、公開するサイトです。各情報は商品についた８ケタの「カタログNo.」「産地」「品目」「栽培方法」などから検索することができ... 詳細へ

体細胞クローン技術に関する情報

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　畜産草地研究所

生物種: Bos taurus

説明: 国内で生産された体細胞クローン牛およびその後代牛に関するデータを集めたデータベースです。病理学的、臨床的データ集、体細胞クローン家畜や胚における分子生物学的な特性調査のためのマ... 詳細へ

飼料作物害虫目録

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　畜産草地研究所

生物種: Arthropoda | Mollusca | Aves | Mammalia

説明: 試料作物の害虫と加害作物をまとめたデータベースです。「日本牧草害虫目録　農林水産省　畜産試験場資料No.43-13 1969年3月」、「農林有害動物・昆虫名鑑　日本応用動物昆虫学会編　1987年1... 詳細へ

リンゴ害虫生態画像データベース: ApplePestDatabase (APD)

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構果樹研究所

生物種: Arthropoda

説明: 本データベースは、リンゴを加害する害虫の写真を中心に、害虫の形態・生態、被害を受けたリンゴの写真、防除などの情報を掲載しています。害虫名リスト、リンゴの加害部位別害虫名リスト、... 詳細へ

一括ダウンロード可

監視伝染病の発生状況

運用機関: 農林水産省

説明: 各種家畜伝染病と届出伝染病について、家畜名と病名、発生件数が県ごとおよび月ごとにまとめられています。詳細へ

電子顕微鏡で見た病原体

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構動物衛生研究部門

説明: 病原体の電子顕微鏡像を集めたデータベースです。病原体に感染した組織の光学顕微鏡像、電子顕微鏡像を収録しています。ウィルス、真菌、原虫など病原体の種類から検索できます。詳細へ

ダイズの病害虫診断

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　近畿中国四国農業研究センター

生物種: Glycine max | Nezara antennata | Fusarium avenaceum | Broad bean wilt virus | Hexapoda

説明: ダイズに関連する病害虫を診断するためのサイトです。病害虫を発生部位ごとの画像で紹介しているほか、ウイルスやかびなどの病原や害虫の基本情報を記載しています。病名、害虫名の一覧から... 詳細へ

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(14日以上)

ウンカのリアルタイム飛来予測

運用機関: 一般社団法人日本植物防疫協会

生物種: Hemiptera

説明: イネの重要害虫であるウンカの海外から日本への飛来をリアルタイムに予測するシステムです。前日夕方および当日明け方に飛び立ったウンカが48時間の間にどのように移動するかを１時間ごとに... 詳細へ

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(14日以上)

日本雑草学会　雑草情報共有システム研究会

運用機関: 日本雑草学会

生物種: Viridiplantae

説明: 雑草の種別に、発生・被害情報、生態的特性や生物間相互作用に基づく生物情報、防除等に関する情報を整理、蓄積したデータベースです。「雑草情報検索」「作物別雑草管理情報」および「外来... 詳細へ

休止
(14日以上)

カバークロップ導入支援データベース検索システム

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　中央農業総合研究センター

生物種: Magnoliophyta

説明: 収穫対象とならず、土壌侵食の防止や有機物の供給などを目的として、主作物の休閑期や栽培時の畦間などに栽培されるカバークロップの利用情報を収録したデータベースです。品種、商品名、利... 詳細へ

KiTSOSY: 病害虫雑草関連文献データベース

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構　中央農業総合研究センター

生物種: Arthropoda | Viridiplantae

説明: 日本国内の農林業病害虫雑草関連の文献について、学会誌、研究会誌（関東病虫研報など）、総説誌（植物防疫など）、都道府県研究機関報告、業界誌（今月の農業、農薬、農薬時代、農薬ガイド... 詳細へ

日本筋ジストロフィー協会 > 神経・筋疾患医学情報登録・管理機構

運用機関: 社団法人日本筋ジストロフィー協会

生物種: Homo sapiens

説明: 福山型筋ジストロフィーの遺伝子データを登録・管理するデータベースです。データは原則公開されず、日本筋ジストロフィー協会が運営する「神経・筋疾患医学情報登録・管理機構」で厳重に管... 詳細へ

公開停止中

JACLiD: 鍼灸文献データベース

運用機関: 公益社団法人全日本鍼灸学会

生物種: Homo sapiens

説明: 鍼灸医療に関わる学術研究論文の書誌情報（タイトル、著者名、掲載雑誌名、年・巻・号・ページ等）を提供するデータベースです。著作権上問題のない一部の論文は全文の閲覧が可能です。医療... 詳細へ

NCD: National Clinical Database 外科系の専門医制度と連携した症例データベース

運用機関: 一般社団法人National Clinical Database

生物種: Homo sapiens

説明: 外科系の専門医制度と連携し、各施設や学会から集められた症例データをまとめて管理しているデータベースです。本システムを利用できるのは利用者登録をした医師の方に限られます。詳細へ

実地診療のためのデータベース - 主な疾病に関するデータ2011

運用機関: 日本心臓財団

生物種: Homo sapiens

説明: 主な疾病の患者数の推移やそれらに掛かる医療費、国別死亡数の割合を表形式やグラフにして提示したページです。詳細へ

休止
(14日以上)

循環器疾患データベース

運用機関: 日本心臓財団

生物種: Homo sapiens

説明: 循環器疾患に関する統計データ（患者数、死亡率、医療施設数等）とそれらに関する概要や提言をまとめたデータベースです。詳細へ

医薬品に関する情報

運用機関: 国立医薬品食品衛生研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 日本国外の主な規制機関、国際機関等から出される医薬品に関わる重要な安全情報を収集、検討し、日本語の概要等をつけ迅速に提供することを目的に作成されています。詳細へ

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