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Ig-Base: Immunoglobulin structure database

運用機関: 大阪大学

生物種: Homo sapiens | Rattus | Mus musculus | Oryctolagus cuniculus | Escherichia coli

説明: Protein Data Bank (PDB) に収録されたタンパク質について、手動のアノテーションにより収集した抗体のデータベースです。エントリーはそれぞれPBD ID、抗体名、パーツの長さおよびシーケン... 詳細へ

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IDEAL: Intrinsically Disordered proteins with Extensive Annotations and Literature

運用機関: IDEAL Development Team

説明: 天然変性タンパク質のデータベースです。マニュアルでアノテーションしており、他の物質との相互作用部位、翻訳後修飾部位、変性位置、生物種、アミノ酸数、複合体構造などを収録しています... 詳細へ

HKUPP: Human Kidney and Urine Proteome Project

運用機関: HUPO

生物種: Homo sapiens | Rattus

説明: プロテオミクスを用いて腎臓や尿についての研究をする国際的なプロジェクトHuman Kidney and Urine Proteome Project のサイトです。腎臓や尿中のタンパク質に関するデータベースおよび関連... 詳細へ

JCIA BIGDr （ビッグドクター）

運用機関: 一般社団法人日本化学工業協会

生物種:

説明: 一般社団法人日本化学工業協会が提供する化学物質リスク評価支援ポータルサイトです。国内の主な有害性情報DBや法規制情報DBについての横断検索、国内外の主要な有害性評価書等へのリンク、... 詳細へ

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CaMPDB: Calpain for Modulatory Proteolysis Database

運用機関: 京都大学　化学研究所　附属バイオインフォマティクスセンター

生物種:

説明: カルシウム依存型プロテアーゼであるカルパインに関連するデータベースです。カルパイン、関連する基質、阻害タンパク質であるカルパスタチンの情報を集めています。カルパインの各基質に対... 詳細へ

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水稲冷害早期警戒システム

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構東北農業研究センター

生物種:

説明: 日平均気温の平年偏差や、分布図による葉いもち病への感染のしやすさを日付ごとに確認できます。技術情報へのリンクから、平均気温データ、生育予測モデル等のダウンロードが可能です。東北... 詳細へ

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Google Mapによる気象予測データを利用した農作物警戒情報

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構東北農業研究センター

生物種:

説明: 東北地域の個別農家圃場における水稲の生育、障害などの予測情報を生育段階に応じて提供するシステムです。予測には気象データ、生育モデルを用いています。ご利用にはユーザー登録が必要です。詳細へ

北海道の土性（土壌）調査報告

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構北海道農業研究センター

生物種:

説明: 北海道農業研究センターが実施した北海道の農牧地及び農牧適地の土壌の現地調査を、調査地区ごとに第1編 (昭和26年) から第32編 (昭和63年) として取りまとめた報告書です。各報告書はPDFで... 詳細へ

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農業防災気象ネット

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農村工学研究所

生物種:

説明: 農業施設のための気象情報提供サイトです。詳細へ

牛海綿状脳症 (BSE)

運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構動物衛生研究部門

生物種:

説明: 牛海綿状脳症 (BSE) に関する国内、海外の情報をリンクしたポータルサイトです。詳細へ

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DB-AT: Database of Apicomplexa Transcriptomes

運用機関: 北海道大学

生物種: Apicomplexa

説明: 数種の重要な寄生虫のfull-ength cDNA情報とRNA-seqのデータセットを提供するデータベースです。前バージョン（Full-Length cDNA Database）からの大規模なバージョンアップで、新しい寄生虫... 詳細へ

Flybrain NDB: FLYBRAIN Neuron Database

運用機関: 東京大学

生物種: Drosophila melanogaster

説明: ショウジョウバエの脳について、文献に発表されたすべての神経細胞に関する情報を統一したフォーマットで提供するデータベースです。既知神経の情報を各神経や経路の名称から検索・閲覧でき... 詳細へ

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FLYBRAIN

運用機関: Flybrain Database Consortium

生物種: Drosophila melanogaster

説明: ショウジョウバエ脳神経系の解剖学的画像データベースです。各種分子マーカーによる染色像と解説を提供しています。このアトラスの初心者から専門家まで、階層的に使い方に見合った情報が得... 詳細へ

fabry-database.org

運用機関: 明治薬科大学

生物種: Homo sapiens

説明: ファブリー病の病因であるalpha-galactosidase A (GLA) の構造変異のデータベースです。変異の種類、臨床表現型や文献、α-ガラクトシダーゼの立体構造変化の情報を収録しています。変異位置... 詳細へ

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ED-Genes

運用機関: 福井大学医学部

生物種: Homo sapiens | Rattus

説明: 内分泌かく乱物質が女性生殖器系に及ぼす影響を遺伝子発現の変化としてとらえ、解析したデータベースです。ラットとヒトの生殖器細胞株について、ダイオキシン (TCDD) およびジエチルスティ... 詳細へ

Dynamic Brain Platform

運用機関: ダイナミックブレインプラットフォーム(DBPF)委員会

生物種:

説明: 脳の情報表現やその処理に関わるダイナミクスの研究に関係する研究データおよび研究者のメッセージを広く体系的に共有するためのプラットフォームです。脳の細胞、局所回路、脳全域、行動な... 詳細へ

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DTA DATABASE: Dihedral Transition Analysis database

運用機関: 東京工業大学生命理工学院

生物種:

説明: タンパク質の動きを主鎖二面角の大きな変化に基づいて特徴づけしたデータベースです。動きを示す高分解能タンパク質構造ペアを幅広くかつ重複無いように集めています。データは様々な側面か... 詳細へ

DBSCR: Database of transcriptional regulation in Streptomyces coelicolor and its closest relatives

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所

説明: 抗生物質生産菌である放線菌Streptomyces coelicolor A3(2)とその近縁種の転写制御に関するデータベースです。転写因子、被制御遺伝子、転写開始点のシーケンスや機能、遺伝子位置などのアノ... 詳細へ

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Database of Synaptic Connectivity of C. elegans for Computation

運用機関: 慶應義塾大学

生物種: Caenorhabditis elegans

説明: 線虫の神経シナプス結合に関するデータベースです。咽頭および咽頭以外の体性神経系におけるニューロン中のシナプス接続についての図と表により構成されています。いくつかのニューロンクラ... 詳細へ

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Database for Genes Contributing to Human Health (健康への貢献遺伝子データベース)

運用機関: 長浜バイオ大学

生物種:

説明: 国際塩基配列データベース (DDBJ/EMBL/Genbank, INSDC) に登録されている環境メタゲノム解析由来の配列から、ヒトの健康に役立つ可能性のある遺伝子の候補を抽出して収録したデータベースで... 詳細へ

Cerebellar Platform

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所

生物種:

説明: 小脳プラットフォームは、小脳研究に関連する情報を収録したデジタル研究アーカイブです。実験結果の数値データ、画像、動画や、モデルプログラムおよびスクリプト、データ解析用プログラム... 詳細へ

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CEOPつくばリファレンスサイト

運用機関: CEOPつくばリファレンスサイトプロジェクト

生物種:

説明: つくば学園都市にある多数の研究所および大学によって観察された水文気象学のデータをアーカイブするためのポータルデータベースです。このデータベースは、地表気象・放射線測定データ、フ... 詳細へ

Cassava Online Archive

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所　環境資源科学研究センター

生物種: Manihot esculenta | Ricinus communis | Populus trichocarpa | Vitis vinifera | Arabidopsis thaliana

説明: 有用熱帯作物キャッサバのmRNA配列、EST、それらのアノテーション情報を提供するデータベースです。mRNAやESTの配列、そのアノテーション、既知遺伝子との類似性、タンパク質ドメインなどの... 詳細へ

CARPIS 副作用症例検索システムWeb版

運用機関: 名城大学薬学部医薬情報センター

生物種: Homo sapiens

説明: 国内で報告された副作用及び中毒に関する症例報告を集めたデータベースです。利用、検索には利用者番号とパスワードの入力が必要です。詳細へ

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CancerProView: Cancer related Gene/Protein and Disease Pathway Database

運用機関: 慶應義塾大学

生物種:

説明: 癌関連タンパク質の相互作用を含めたパスウエイの画像データベースシステムです。癌を引き起こす遺伝子名、タンパク質名やそれぞれの配列情報、ドメイン情報、および関連するパスウェイデー... 詳細へ

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ANISEED: Ascidian Network of In Situ Expression and Embryological Data

運用機関: Institut de Biologie du Développement de Marseille

説明: ホヤ初期胚における遺伝子発現のデータベースです。既存データベースや文献から抽出された遺伝子のアノテーション、解剖学的オントロジー、遺伝子の発現や機能、文献などの情報が、胚の発生... 詳細へ

AIIC: アジア・大平洋地域産昆虫類のタイプ標本および一般標本データベース

運用機関: 九州大学　大学院農学研究院

生物種: Hexapoda

説明: 日本国内の大学、博物館、研究機関などが所蔵するアジア、大平洋地域産昆虫類のタイプ標本および種情報のデータベースをまとめたポータルサイトです。日本だけでなく、海外調査によってもた... 詳細へ

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SHOGoiN: Human Omics database for the Generation of iPS and Normal Cells

運用機関: 京都大学 iPS細胞研究所

生物種: Homo sapiens

説明: ヒトの分化した細胞および幹細胞に関する情報を網羅的に収集したデータベースです。各エントリーには形態情報や細胞の画像、物理的位置や機能、遺伝子発現、細胞オントロジー、関連文献など... 詳細へ

KEGG Metagenomes

運用機関: 京都大学　化学研究所　附属バイオインフォマティクスセンター

生物種:

説明: KEGG Metagenomeはメタゲノム配列が決定された環境サンプル情報のデータベースです。KEGG MGENEに収録されている遺伝子のサンプル情報にあたります。Projectからそのサンプルで決定されたメ... 詳細へ

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KEGG MODULE

運用機関: 京都大学　化学研究所　附属バイオインフォマティクスセンター

生物種:

説明: KEGG MODULEは、シークエンスが明らかにされたゲノムのアノテーションおよび生物学的意味解釈に使用される機能ユニット (KEGGモジュール) のデータベースです。KEGGモジュールは手動で定義さ... 詳細へ

Mouse Phenotype Database

運用機関: 藤田保健衛生大学総合医科学研究所システム医科学研究部門

生物種: Mus musculus

説明: マウス系統を使った行動実験の生データを収録したデータベースです。データは公表された論文から収集しています。マウス表現型データベース、C57BL6系統行動データベースと行動解析用ソフト... 詳細へ

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Medaka Methylome Browser

運用機関: 東京大学

生物種: Oryzias latipes

説明: メダカゲノムのメチル化に関するデータベースです。CpGサイトのメチル化レベルの情報を２つの系統（HdrR、HNI）の３種類の組織（胞胚、肝臓、精巣）について収録しています。ゲノムブラウ... 詳細へ

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WormTSS

運用機関: 東京大学

生物種: Caenorhabditis elegans

説明: 線虫のトランススプライシング遺伝子に関連する転写開始点(TSS）についての包括的なコレクションです。ゲノムブラウザとTSSリストで構成されています。リストにはアウトロンTSSとエクソンTSS... 詳細へ

LSDBアーカイブへ統合TVへ

超絶高速ゲノム配列検索 GGGenome

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: 塩基配列を高速に検索するサイトです。数塩基のミスマッチ、挿入、欠失を許容した配列の検索が可能です。検索結果はHTMLのほか、タブ区切りテキスト、JSONなど様々なフォーマットで取得でき... 詳細へ

ClinicalTrials.gov

運用機関: アメリカ国立医学図書館

生物種: Homo sapiens

説明: ClinicalTrials.govは，米国国立公衆衛生研究所 (NIH) と米国医薬食品局 (FDA) が共同で、米国国立医学図書館 (NLM) を通じて、現在行われている治験及び臨床研究に関する情報を提供している... 詳細へ

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Orphanet

運用機関: フランス国立保健医学研究所

生物種: Homo sapiens

説明: Orphanetは希少疾患患者の診断と治療の向上を図ることを目的とした、希少疾患や希少疾患用医薬品について様々な情報を参照可能にしたデータベースです。疾患や薬に関する一般的な情報をはじ... 詳細へ

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染色体異常をみつけたら

運用機関: 日本人類遺伝学会臨床細胞遺伝学認定士制度委員ワーキンググループ

生物種: Homo sapiens

説明: 山口大学名誉教授梶井正医学博士により作成された，染色体異常の報告を受けた医師のための解説サイトです。染色体数の異常，出生前診断等項目別に詳しい解説を参照することが出来ます。詳細へ

国際基準に基づく小奇形アトラス

運用機関: 日本小児遺伝学会

生物種: Homo sapiens

説明: 国際基準に基づく小奇形アトラスは、奇形徴候の記載法に関する国際的なコンセンサスに基づき、頭蓋顔面の形態異常と四肢の形態異常（頭部・眼囲・外耳・鼻・口囲・手足）の用語と定義や写... 詳細へ

GENEReviews 日本語版

運用機関: GeneReviews Japan 運営事務局

生物種: Homo sapiens

説明: GENEReviewsは、遺伝性疾患の症状や診断、遺伝学的検査、遺伝カウンセリングなどについて、専門家による解説が参照できる医療スタッフ向けの遺伝性疾患情報サイトです。臨床遺伝医学に関する... 詳細へ

東アジア伝統医学エビデンスレポート

運用機関: 日本ハンドサーチ・エレクトロニックサーチ研究会

生物種: Homo sapiens

説明: 東アジアの伝統医学（漢方治療、日本鍼灸、あんまマッサージ指圧、韓医学）について、論文を参考にしてエビデンスレポートを作成、まとめたデータベースです。詳細へ

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日本人難聴遺伝子データベース

運用機関: 信州大学医学部

生物種: Homo sapiens

説明: 難聴に関する一般的な情報や診断・治療法に関わる情報、原因遺伝子についての情報が掲載されているデータベースです。信州大学医学部によるオリジナルサイト（http ://www.shinshu-u.ac.jp/... 詳細へ

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リハ患者DB: リハビリテーション患者データベース

運用機関: 日本リハビリテーション・データベース協議会

生物種: Homo sapiens

説明: リハビリテーション患者データベースは、患者さんのリハビリテーションに関わる項目（リハビリ実施情報、看護必要度、入院・退院情報、発症情報、担当医療従事者など）を蓄積したデータベ... 詳細へ

MEN-Net.org: 多発性内分泌腫瘍症情報サイト

運用機関: 多発性内分泌腫瘍症研究コンソーシアム

生物種: Homo sapiens

説明: 多発性内分泌腫瘍症（Multiple Endocrine Neoplasia: MEN）の情報サイトです。MENに関する一般的な情報や医療従事者、患者さん向けの情報が充実しており、症例調査結果も閲覧することが出... 詳細へ

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都道府県健康・栄養調査結果

運用機関: 青森県立保健大学健康科学部

生物種: Homo sapiens

説明: 国民健康・栄養調査の結果（全国）および各都道府県から提供された健康・栄養調査結果の報告書等に記載されている公開データを参照し、主に「健康日本２１」に掲げられている主要指標につ... 詳細へ

PercellomeDB

運用機関: 厚生労働省国立医薬品食品衛生研究所

生物種: Homo sapiens | Rattus norvegicus | Mus musculus

説明: 100種類超の化学物質をマウス、ラット、ヒトの細胞に投与した場合における生体影響のトランスクリプトームをマイクロアレイを用いて網羅的かつ高精度に測定した大規模トキシコゲノミクスデー... 詳細へ

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下痢症ウイルスデータベース

運用機関: 厚生労働省　国立感染症研究所

説明: 下痢症ウイルスの遺伝情報や関連する文献情報を調べられるデータベースです。遺伝子配列に関する情報やウイルスなどの条件を指定して検索をすることができます。詳細へ

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周産期母子医療センターネットワークデータベース解析報告

運用機関: 東京女子医科大学

生物種: Homo sapiens

説明: 2003年以降に全国の総合周産期母子医療センターおよび主要新生児医療施設に入院して治療を受けた出生体重1500g以下の新生児の情報を共有したデータベースです。母体情報、妊娠合併症、分娩情... 詳細へ

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クリニカルパス（乳がん手術リハビリテーション、血液・リンパ）

運用機関: 国立研究開発法人　国立がん研究センター

生物種: Homo sapiens

説明: がん専門施設から集めたクリニカルパス（タイムスケジュールと医療内容を記述した表）のデータベースです。医学的な根拠を基に現時点で最も妥当であると考えられる処置や治療を掲載した基... 詳細へ

日本脳卒中データバンク

運用機関: 国立研究開発法人国立循環器病研究センター

生物種: Homo sapiens

説明: 日本脳卒中データバンクは、脳卒中の急性期治療等の標準化に必要なEBM (Evidence based medicine) を確立するためのインフラとして作成された、脳卒中急性期患者データベース（患者の診断や... 詳細へ

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DDIDA

運用機関: 京都大学

生物種: Homo sapiens

説明: DDIDAは薬、低分子化合物とその身体的応答（疾患／症状）の関係性についてのメカニズムに基づいた情報を提供するために開発されたデータベースです。医薬品、低分子化合物、表現型応答、薬の... 詳細へ

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