データベースのレコード一覧  (件数: )

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運用機関: 公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種: Viridiplantae
説明: さまざまな植物のゲノムやマーカー情報を集めたポータルサイトです。ゲノム配列、マーカー(SSR, CAPS, SCARなど)、Bio Sample、アノテーション(gff/gff3)、遺伝子(cds/gene)、転写物(... 詳細へ
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運用機関: European Molecular Biology Laboratory (EMBL), National Center for Protein Sciences
生物種: All
説明: 異なる種を対象とした、分散した、トランスクリプトミクス、ゲノミクス、プロテオミクス、メタボロミクスのデータリソースのグループ全体にわたってデータセットを検索できるリソースです。... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター, 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種: Homo sapiens
説明: TogoVar(日本人ゲノム多様性統合データベース)は、日本人ゲノム配列の個人による違い(バリアント)とそれに関係する疾患情報などを収集・整理したデータベースです。TogoVarは、研究プロ... 詳細へ
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運用機関: FAIRsharing
生物種:
説明: 生命科学、環境科学、バイオメディカル分野を中心としたデータ共有のためのレジストリサイトです。2017年7月に前身であるbiosharing.orgからFAIRsharing.orgへ変更され、カバー範囲をサイエ... 詳細へ
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運用機関: 東北大学東北メディカル・メガバンク機構
生物種: Homo sapiens
説明: 宮城県および岩手県を中心とした東北大震災の被災地を含む地域に住む健常者を対象として健康調査を実施するとともに、協力者の生体試料、健康情報、医療情報等を収集したバイオバンクの情報... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材向けの教材を提供するサイトです。科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンターが主催する統合データベース講習会の内容と資料... 詳細へ
運用機関: Flybrain Database Consortium
生物種: Drosophila melanogaster
説明: ショウジョウバエ脳神経系の解剖学的画像データベースです。各種分子マーカーによる染色像と解説を提供しています。このアトラスの初心者から専門家まで、階層的に使い方に見合った情報が得... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: 塩基配列を高速に検索するサイトです。数塩基のミスマッチ、挿入、欠失を許容した配列の検索が可能です。検索結果はHTMLのほか、タブ区切りテキスト、JSONなど様々なフォーマットで取得でき... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種: Homo sapiens
説明: 本サイトはヒトに関する様々なデータを共有するためのプラットフォームです。次世代シークエンサーをはじめとした解析技術の発達に伴い産生されつつある膨大な量のヒト関連データを整理・格... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: 生命科学において注目される分野/学問領域について、第一線の研究者の執筆による日本語レビューを公開するサービスです。 2019年1月23日をもって新規レビューの追加は終了しましたが、公開済... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種: Homo sapiens
説明: 数十万から数百万のSNPチップを用いて解析した健常者のアリル・遺伝子型頻度の情報とハーディーワインバーグ平衡検定値を登録し、GUIにより結果を閲覧できるようにしています。なお、データ... 詳細へ
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運用機関: 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種: Homo sapiens
説明: ヒトゲノム、病原体ゲノム、腸内細菌メタゲノムをはじめとしたゲノムの情報と疾患との関連、および医薬品の作用・副作用との関連が知識ベース化され、ゲノム解読と有効利用を促進する統合リ... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種: Bacteria | Archaea
説明: 本DBは,微生物に関する多種多様な情報を遺伝子・系統・環境の3つの軸に沿って整理統合し,セマンティックWeb技術を利用して単一の検索ウィンドウからそれらの情報を検索可能な統合DBです。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明: 創薬支援のための統合データウェアハウスです。16 個の公共データベースからのデータを統合し、タンパク質立体構造や医薬品関係データ、タンパク質相互作用や転写因子制御データなどの統合的... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: SRA, ENA, DRAに登録された次世代シークエンサからの出力データを対象とした目次を提供しています。具体的にはデータ生産の目的、プラットフォームの種類、生物種別に登録情報を閲覧、検索す... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: 遺伝子について関連する疾患、薬剤、臓器、生命現象などの特徴をキーワード (MeSH用語)で関連性の度合いとともに示したデータベースです。興味のある疾患名称やOMIM IDから関連する遺伝子の... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明: ヒトやマウスなどを対象に、異なる手法 (EST、Gene Chip、CAGE、RNA-seq)により取得された臓器/組織別の遺伝子発現データを並列に表示し、遺伝子発現解析を行う上で標準となるリファレンスと... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ センター
生物種: All
説明: DRAは次世代シークエンサからの出力データの登録及び登録されたデータの検索のためのデータベースです。NCBIのSRA、EBIのERAとの国際協力のもとDDBJにより運営されています。従来のキャピラ... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: 論文中に記述される、オンライン上に公開されいてる生命科学系データベースやソフトウェアなどを検索するシステムです。MeSH用語や著者名での検索も可能です。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種:
説明: 蛋白質関連データベース統合検索システムです。キーワード検索によりまずメニューに蛋白質のファミリー名のリストが表示されます。メニューから目的の蛋白質またはファミリーを選ぶとその蛋... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種:
説明: 国内外に散在する生命科学系データベースの中身を一括でキーワード検索できるサービスです。ライフサイエンスデータベース統合推進事業の一環で作成しています。500以上の文献、特許、分子等... 詳細へ
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運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学
生物種: Embryophyta | Homo sapiens | Arabidopsis | Bacillus
説明: 二次代謝産物データベースKNApSAcKをコアシステムとした統合型データベースです。遺伝子アノテーションではArabidopsis、Bacillus、Humanが公開されています。タンパク質の金属イオン結合部... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種:
説明: 生命科学系データベースの情報 (URL・稼働状況・提供機関・生物種・データ種)を対象や生物種などの項目別に閲覧検索できるカタログ型のデータベースです。2013年7月29日をもってバイオサイ... 詳細へ
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運用機関: Uppsala University
生物種: Homo sapiens
説明: 様々な種類のヒトの器官、組織、細胞におけるタンパク質の発現および局在に関するデータベースです。蛍光抗体イメージング、質量分析に基づくプロテオミクス、網羅的な遺伝子発現解析による... 詳細へ
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運用機関: 首都大学東京
生物種: Adiantum capillus-veneris
説明: ホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)のEST配列データ約3万件に2次情報を追加したデータベースです。これまで、様々な植物ゲノム解析が進められていますが、陸上植物(種子、シダ、コケ植... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種: Homo sapiens
説明: 解剖学用語が示す人体の部品(臓器、器官)の位置と形状を3次元人体モデルで記述したデータベースです。人体3次元モデルが無償利用できるのが最大の特徴です。臓器の3次元的位置や形状を... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: 統合TVは、ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)が発信するデータベース(DB)やツールの使い方を紹介した動画コンテンツです。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種:
説明: 真正細菌から動植物を含む200種類以上の生物種のアイコン(イラスト)集です。ダウンロードしたアイコンを自由に改変・使用することができます。現在の収録数は220件です。 詳細へ
運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種:
説明: ライフサイエンス分野のデータベースについての情報が収集、整理、分類されており、現在のところ約417件の記事が存在します。ディレクトリからは、データベースの構築法による分類と生物種お... 詳細へ
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運用機関: 新潟大学 工学部情報工学科
生物種: Bacteria | Archaea | Viruses
説明: 3種類のtRNA遺伝子予測プログラム(tRNAScan-SE、Aragorn、tRNAfinder)を用いて、塩基配列の解読された原核生物や真核生物のゲノムからtRNA遺伝子の網羅的検索を行い、その結果を収録してい... 詳細へ
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運用機関: Ohio State University
生物種: Arabidopsis thaliana
説明: シロイヌナズナについて、ゲノム、遺伝子、分子生物学的データなどを包括的に収集したデータベースです。注釈付けされたゲノム、遺伝子産物、代謝、遺伝子発現、マーカー、株リソース情報、... 詳細へ
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運用機関: STRING開発チーム
生物種: Bacteria | Archaea | Eukaryota | Viruses
説明: タンパク質相互作用情報のデータベースです。相互作用は既知のものと推定のものがあり、直接的(物理的)および間接的(機能的)関係が含まれています。情報源は高スループット実験や共発現... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: 次世代シーケンサーによる配列データのレポジトリサイトです。現在扱っているプラットフォームは454(ロシュ)、Genome Analyzer(イルミナ)、SOLiD(アプライドバイオシステムズ)、Heliscope(ヘ... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: NCBI(米国立バイオテクノロジー情報センター)は、NIH(米国立衛生研究所)のNLM(米国立医学図書館)の一部門として1988年に設立されたバイオインフォマティクス研究組織です。1989年にBLA... 詳細へ
運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: 文部科学省「統合データベースプロジェクト」のポータルサイトです。生命科学分野のデータベースカタログや横断検索、総説や特許、研究報告書の文献検索、各種ツール、バイオNLP、教材、事業... 詳細へ
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運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学
生物種: Embryophyta
説明: 生物種と代謝産物の関係を体系化することを目的に、二次代謝産物データベースシステムKNApSAcKを開発し、無償で公開しています。KNApSAcKは分子式、分子量、生物種名や実験によって得られた... 詳細へ
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運用機関: 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明: KEGGデータベースシステム全体の統括ページです。データタイプごと(PATHWAY、BRITE、DISEASE、DRUG、GENES、GENOME、COMPOUND、GLYCAN、REACTION)、生物種ごとにアクセスできます。KEGG Ma... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
説明: 産総研の糖鎖遺伝子機能解析チーム、糖鎖分子情報解析チーム、レクチン応用開発チームが保有する6種類のデータベース(GMDB、LfDB、レクチンと糖鎖の相互作用プロファイリングDB、GGDB:糖鎖... 詳細へ
運用機関: 情報・システム研究機構 国立情報学研究所
生物種:
説明: ジャビオンは日本語で最新の生物学や生命科学をわかりやすく解説した総合情報サイトです。コラム、注目ニュース、用語解説、研究最前線に関する情報に加え、GenomeViewer、データベースビュ... 詳細へ
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運用機関: DOE Joint Genome Institute
生物種:
説明: GOLDは世界中で行われているゲノム、メタゲノムの塩基配列解読プロジェクトに関する情報をそれらのメタデータとともに収集・提供しているデータベースです。GOLD (v.6)では28,744の研究、272... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: マイクロアレイや次世代シーケンサー等で得られた機能ゲノムデータのレポジトリであるGEO( http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00080 )のデータセット部分です。実験データのデータ... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: EBI ArrayExpress に登録されている遺伝子発現データを容易に検索、閲覧するためのインターフェースです。ArrayExpress のメタデータから集計した統計値をインタラクティブなグラフにまとめ... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種: Homo sapiens
説明: FANTOMは、理化学研究所 オミックス基盤研究領域が主催する国際研究コンソーシアムです。このデータベースでは、過去の FANTOMプロジェクトで得られたデータを最新のゲノム配列へマップした... 詳細へ
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運用機関: European Bioinformatics Institute
生物種:
説明: EBI(欧州バイオインフォマティクス研究所)は、ケンブリッジ郊外のウェルカムトラスト・ゲノムキャンパス内に設置されているバイオインフォマティクスの学術的研究機関です。EMBL(欧州分子... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: オンラインで利用できる生物医学関連の電子書籍を収録しています。テキスト中の引用文献はPubMedにリンクしています。 詳細へ
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運用機関: University of Wisconsin System Board of Regents
生物種:
説明: ADIT-NMR、SMSDepにより登録されたペプチド、タンパク質、核酸等、生体高分子のNMR実験データを公開しています。データの検索、各データエントリーからPDBなど他のデータベースへのリンク、... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明: 代謝パスウエイやシグナルパスウエイ、疾患やその他の生体内プロセスに関わる生体分子の相互作用セットを収集したデータベースです。現在は、KEGGとEcoCycデータベースのパスウエイを対象と... 詳細へ
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運用機関: 東北大学, 東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター
生物種: Arabidopsis thaliana | Oryza sativa | Glycine max | Zea mays | Solanum lycopersicum | ...
説明: ATTED-IIは、シロイヌナズナを中心とした植物の遺伝子共発現データを提供するデータベースです。AtGenExpress (TAIR)、ArrayExpressからのマイクロアレイデータと、DDBJからのRNAseqデータを... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ センター
生物種:
説明: DDBJがWWWならびにWeb APIで提供している高速なキーワード検索サービスです。国際塩基配列データベースのほか、生命科学分野の主要なデータベースに対して統合的な検索を行うことができます... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: 文献中に多く出現する略語は多義語であることが多く、特に専門外の読者には理解するのに困難を伴うことがあります。Allieはこの問題に対する一つの解となるよう開発されており、米国国立保健... 詳細へ