検索結果 - Integbio データベースカタログ

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PubChem

運用機関: National Center for Biotechnology Information

生物種:

説明: 統合的な化学情報データベースです。化学物質とその生物活性に関する情報を収録したPubChem Substance、医薬品名やその効能、LogP値などの物性値や類似構造を持つ別の化合物の情報を収録した... 詳細へ

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ChEMBL

運用機関: EMBL-EBI

生物種:

説明: ChEMBLは創薬を目的とした生理活性をもつ化合物や小分子のデータベースです。化合物、核酸などの小分子と、そのターゲットやアッセイ情報を紐付けて収載しています。化合物や小分子の名称、... 詳細へ

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CMAUP: Collective Molecular Activities of Useful Plants

運用機関: National University of Singapore

生物種: Viridiplantae | Homo sapiens

説明: 食用・薬用等さまざまな有用植物の分子活性を集めたデータベースです。文献および公開データベースより情報を収集しています。キーワード、成分、植物の用途、標的タンパク質、KEGG Pathway... 詳細へ

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(14日以上)

SuperTarget

運用機関: Structural Bioinformatics Group, Institute of Molecular Biology and Bioinformatics, Charité-University Medicine Berlin

生物種: All

説明: 薬剤とターゲットとの相互作用に関するデータベースです。主に薬剤、タンパク質、副作用に重点を置き、 UniProt、SuperDrug、SIDERなどから以下の情報を収録しています。薬剤：名称、PubChem... 詳細へ

FlavorDB

運用機関: Indraprastha Institute of Information Technology (IIIT-Delhi)

生物種: All

説明: FlavorDB は、味と香りを表すフレーバー分子を収載したデータベースです。これらのうち 2,254 分子は、34 のカテゴリーに属する 936 の天然成分に由来しています。ダイナミックでユーザーフ... 詳細へ

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Omics Discovery Index: OmicsDI

運用機関: European Molecular Biology Laboratory (EMBL), National Center for Protein Sciences

生物種: All

説明: 複数のレポジトリからのオミックスデータ（トランスクリプトミクス、ゲノミクス、プロテオミクス、メタボロミクス）を統合し、検索を可能にしたリソースです。ArrayExpress、PRIDE、MassIVE... 詳細へ

EPA Comptox Chemicals Dashboard

運用機関: US Environmental Protection Agency

生物種:

説明: Chemistry Dashboard は、化学物質の安全性を評価するため EPA によって開発されたダッシュボードの一部分です。現在使用されている 70 万以上の化学物質に関するさまざまな情報にアクセスで... 詳細へ

SureChEMBL

運用機関:

生物種: All

説明: 特許文書の全文、画像および添付ファイルから抽出された化合物データを収録した大規模な公開リソースです。データは、自動テキスト･イメージマイニングパイプラインにより、毎日特許文献から... 詳細へ

DrugCentral

運用機関: UNM School of Medicine

生物種: Bacteria | Homo sapiens | Protozoa | Viruses

説明: 薬のオンラインデータベースです。有効成分、化学物質、医薬製品、薬の作用機序、適応症に関する情報を提供しています。FDA、EMA、および PMDA の新薬承認情報を定期的にモニタリングし、リ... 詳細へ

The Chemical Probes Portal

運用機関: The University of North Carolina, Chapel Hill Eshelman School of Pharmacy

生物種:

説明: アノテーションが付された低分子阻害剤、作動薬（アゴニスト）、およびその他の化学的ツールのカタログです。アノテーションは広範であり、細胞およびモデル生物における活性の有無を識別し... 詳細へ

data.eNanoMapper.net

運用機関: eNanoMapper

生物種:

説明: ナノ材料の特性データと生物学的および毒物学的情報を収載する公開データベースです。材料の名称、報告文献、プロトコル、出力方法を収録しています。情報を検索し、JSON、CSV、XLSX、RDFな... 詳細へ

Comparative Toxicogenomics Database: CTD

運用機関: North Carolina State University

説明: ヒトの健康に対する環境化学物質の影響についてのデータベースです。化学物質と遺伝子、化学物質と疾患、および遺伝子と疾患の関係についてのデータを、学術的文献から手動でキュレーション... 詳細へ

Search Tool for Interactions of Chemicals: STITCH

運用機関: The Biotechnology Center (BIOTEC), Technische Universitat Dresden, European Molecular Biology Organisation (EMBO), University of Copenhagen

生物種: All

説明: 化学物質とタンパク質間の既存および予測される相互作用を探索することができるリソースです。実験、データベースおよび文献から得られたエビデンスに基づいて、化学物質を他の化学物質およ... 詳細へ

SCRIPDB: A Portal for Easy Access to Syntheses, Chemicals, and Reactions In Patents: SCRIPDB

運用機関: Jurisica Lab, Ontario Cancer Institute

生物種: All

説明: 特許メタデータにアクセスできるように設計された化学構造データベースです。米国特許に含まれるパブリックドメインの化学情報にインデックスを付け、特許文書フルテキストの他、個々の特許... 詳細へ

Protein-Chemical Structural Interactions: ProtChemSI

運用機関: Cell Networks, University of Heidelberg

生物種: All

説明: 分子量が低いタンパク質の相互作用の3次元化学構造に関する情報を提供します。タンパク質 - タンパク質、タンパク質 - ペプチド、タンパク質 - 化学物質の相互作用について、スーパーインポ... 詳細へ

enviPath

運用機関: Eawag, Johannes Gutenberg University

生物種: Bacteria

説明: enviPath は、微生物生体内における有機環境汚染物質の変化に関するデータベース兼予測システムです。実験的に観察された生体内変化パスウェイを保存し、表示することができる他、パスウェイ... 詳細へ

eCrystals

運用機関: United Kingdom National Crystallography Service (NCS), University of Southampton

生物種:

説明: サウサンプトン化学結晶学グループ（Southampton Chemical Crystallography Group）と英国 EPSRC 国家結晶学サービス（National Crystallography Service）によって作成された結晶構造のア... 詳細へ

The UC Irvine ChemDB: ChemDB

運用機関: Institute for Genomics and Bioinformatics, University of California, Irvine, University of California Los Angeles

生物種:

説明: システム生物学における合成ビルディングブロック、プローブとして、そして薬物および他の有用な化合物の発見のためのリード化合物として使用する上で重要な、約 500 万の商業的に入手可能な... 詳細へ

Toxin and Toxin Target Database: T3DB

運用機関: Wishart Lab, University of Alberta

生物種: All

説明: 詳細な毒素データと包括的な毒素標的情報を組み合わせたバイオインフォマティクスリソースです。カテゴリーからのブラウジングの他、テキスト、構造やMSデータなどによる検索が可能です。詳細へ

Chemical Effects in Biological Systems: CEBS

運用機関: National Toxicology Program (NTP), NIEHS, NIH

生物種: All

説明: 毒物ゲノミクスデータの統合公開リポジトリです。研究デザインおよびスケジュール、臨床化学的および組織病理学的所見、ならびにマイクロアレイデータおよびプロテオミクスデータが含まれま... 詳細へ

Ligand Expo

運用機関: Rutgers, The State University of New Jersey

生物種: All

説明: タンパク質と核酸に結合した小分子のデータリソースです。PDBの構造データから特定の低分子を含む構造エントリーを特定し、PDBエントリ内の小分子成分の3D構造をダウンロードするためのツー... 詳細へ

ChemSpider

運用機関: Royal Society of Chemistry

生物種:

説明: ウェブ全体から手動で収集した、化合物に関する情報を自由に利用することができるコレクションです。化学構造および関連情報を、単一の検索可能なリポジトリエントリーに集約しています。こ... 詳細へ

ChemIDplus

運用機関: U.S. National Library of Medicine

生物種: All

説明: NLM（National Library of Medicine）データベースに引用されている化学物質の同定に使用された構造および命名典拠ファイルへのアクセスを提供するオンライン検索システムです。また、構造検... 詳細へ

caNanoLab

運用機関: Center for Biomedical Informatics and Information Technology (CBIIT), Centers of Cancer Nanotechnology Excellence (CCNEs), Nanotechnology Characterization Laboratory (NLC), National Institute of Health

生物種: Homo sapiens | Mus musculus

説明: 世界の生物医学ナノテクノロジー研究コミュニティ全体の情報共有を促進するべく設計されたデータ共有ポータルです。生物医学においてナノテクノロジーがより迅速に利用され、その有効性が確... 詳細へ

Chemical Component Dictionary: CCD

運用機関: European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), wwPDB, European Molecular Biology Laboratory (EMBL)

生物種: All

説明: Protein Data Bank のエントリーに含まれるすべての残基および小分子成分を記述するデータベースです。リガンド、小分子、モノマーについての詳細な化学的記述（分子名、分子構造、SMILES、I... 詳細へ

The Cambridge Structural Database: CSD

運用機関: Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC)

生物種: All

説明: 1965年に創設された、小分子有機結晶および金属-有機結晶構造の世界的なデータベースです。X線および中性子回折解析から得られた化学構造、3D構造、文献を収録しています。詳細へ

Chemical Abstracts Service Registry: CAS Registry

運用機関: American Chemical Society

生物種: All

説明: 米国化学会（American Chemical Society）の情報部門であるCASが提供する化学物質情報のレポジトリです。各レコードには名称、同義語、構造、分子式、タンパク質や核酸の配列などが登録され... 詳細へ

SuperSweet

運用機関: Charité - Universitätsmedizin Berlin

生物種: Homo sapiens

説明: 人工、天然の甘味料化合物のデータベースです。甘味を感じさせる炭水化物および類似化合物の情報と、ヒト甘味受容体構造モデルについての記述を収録しています。化合物の情報は分子構造、シ... 詳細へ

休止
(14日以上)

ChemProt

運用機関: Center for Biological Sequence Analysis, Department of Systems Biology, Technical University of Denmark

生物種:

説明: ChemProtは、化学物質-タンパク質-疾患間の関係に関して複数の無償および商用データベースからの情報をまとめた統合データベースです。化学物質名や標的タンパク質名、化学物質の構造に基づ... 詳細へ

休止
(14日以上)

FragmentStore

運用機関: Charite - University Medicine Berlin, Institute for Physiology, Structural Bioinformatics Group

生物種:

説明: FragmentStoreは代謝産物、薬品、毒物である低分子化合物から作成した化合物断片 (フラグメント)のデータベースです。FragmentStoreでは、フラグメントの2D構造、分子量や回転可能な結合数な... 詳細へ

運用終了

Database for Anti-HIV Compounds

運用機関: National Institute of Allergy and Infectious Diseases

生物種: Homo sapiens | Human immunodeficiency virus

説明: 抗HIV化合物、HIV治療薬に関する情報を集めたデータベース。データベースに登録されている情報は、主要な文献の調査を継続して行い、収集したものである。Webサイトは、次の6つのセクション... 詳細へ

休止
(14日以上)

ITER: International Toxicity Estimates for Risk

運用機関: Toxicology Excellence for Risk Assessment

生物種:

説明: 世界の信頼ある研究グループから寄せられた600以上の化学物質の人体に及ぼすリスク情報を収載しています。詳細へ

休止
(14日以上)

GENE-TOX: Genetic Toxicology Data Bank

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 3,000以上の化学物質の遺伝毒性テストデータを収載しています。各物質について、実施された試験方法、ホスト、試験結果、文献情報等を確認できます。2019年よりGENE-TOXの内容はアップデート... 詳細へ

休止
(14日以上)

DART: Developmental and Reproductive Toxicology Database

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 生殖毒性試験に関する文献データを収載したデータベースです。2019年よりDARTの内容はPubMed の “DART subset" として移行しました。PubMedでの利用方法は以下に掲載されています。https://w... 詳細へ

休止
(14日以上)

TOXLINE: Toxicology Literature Online

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 毒性に関する文献データを収載したデータベースです。2019年よりTOXLINEの内容はPubMed の“Toxicology subset” として移行しました。PubMedでの利用方法やアップデートされない内容のダウン... 詳細へ

休止
(14日以上)

CCRIS: Chemical Carcinogenesis Research Information System

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 8,000以上の化学物質の発がん性や変異原性、腫瘍プロモーション、助発ガン性などについての試験結果とその条件が集められています。一般的に受け入れられているプロトコルに従った研究からの... 詳細へ

IRIS: Integrated Risk Information System

運用機関: U.S. Environmental Protection Agency

生物種:

説明: 500以上の化学物質のリスクアセスメントに役立つ情報が提供されています。データレコードは発ガン性のアセスメント (暴露度に関するリスクの推測) とレファレンスコード (有害物質への暴露、... 詳細へ

休止
(14日以上)

HSDB: Hazardous Substances Data Bank

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 5,000以上の潜在的危険有害化学物質の毒性に焦点を当てた毒性データファイルです。ヒト曝露値、産業衛生、緊急時の取扱手順、環境運命、法的要求事項やその他の関連事項情報などが収載されて... 詳細へ

運用終了

TOXNET: Toxicology Data Network

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 毒性、有害危険化学物質、環境衛生、毒性排出に関するデータベース群を集めた毒性情報総合サイトです。化合物名、病名、環境衛生に関するキーワードを入力すると、TOXNET上の全データベース... 詳細へ

LactMed: Drugs and Lactation Database

運用機関: National Library of Medicine

生物種:

説明: 母乳育児中の母親が曝露するかも知れない薬や化学物質のデータベースで、母乳や乳幼児血液中のレベルと可能性のある副作用のほかに、代用可能な治療薬に関する情報を提供しています。すべて... 詳細へ

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PubChem Substance

運用機関: National Center for Biotechnology Information

生物種:

説明: PubChem Substanceは、出版社、研究者、化学ベンダー、製薬会社、および多くの重要なケミカルバイオロジーリソースをもつ研究者によって提供された化学物質とその生物活性に関する情報のオー... 詳細へ

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PubChem Compound

運用機関: National Center for Biotechnology Information

生物種:

説明: 化合物名や分子量、CompoundIDなどで化合物の情報を検索することができるサイトです。医薬品名やその効能、LogP値などの物性値も掲載されています。また、類似構造を持つ別の化合物の検索も... 詳細へ

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PubChem BioAssay

運用機関: National Center for Biotechnology Information

生物種:

説明: 化合物を用いた実験結果を参照できるサービスです。どの様な目的で行った実験か、どの様なデータを取得したか、用いた複数の化合物データがPubChemIDと結びついて閲覧することができます。使... 詳細へ

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NCBI: National Center for Biotechnology Information

運用機関: National Center for Biotechnology Information

生物種: All

説明: NCBI（米国立バイオテクノロジー情報センター）は、NIH（米国立衛生研究所）のNLM（米国立医学図書館）の一部門として1988年に設立されたバイオインフォマティクス研究組織です。1989年にBLA... 詳細へ

EMBL-EBI > Services

運用機関: European Bioinformatics Institute

生物種: All

説明: EMBL-EBI のツールとデータリソースをまとめたサイトです。Ensembl、UniProt、PDBe、Europe PMC、Expression AtlasなどのデータベースやClustal Omega、InterProScan、BLAST などのツールが... 詳細へ

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EBI: European Bioinformatics Institute

運用機関: European Bioinformatics Institute

生物種: All

説明: EBI（欧州バイオインフォマティクス研究所）は、ケンブリッジ郊外のウェルカムトラスト・ゲノムキャンパス内に設置されているバイオインフォマティクスの学術的研究機関です。EMBL（欧州分子... 詳細へ

HIV Structural Database and Chem-BLAST

運用機関: National Institute of Standards and Technology

生物種: Human immunodeficiency virus | Homo sapiens

説明: HIVの構造データベース。2次元構造（化学式）、3次元構造（立体構造）どちらも見ることができます。詳細へ

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PharmGKB: Pharmacogenomics Knowledge Base

運用機関: Stanford University

生物種: Homo sapiens

説明: 薬物応答におけるヒトの遺伝的変異の影響に関する知識を蓄積しているデータベースです。文献より、医薬品や低分子、ジェノタイプ、フェノタイプ、PK/PD、臨床情報、パスウエイの情報を抽出し... 詳細へ

Search NCBI databases

運用機関: National Center for Biotechnology Information

生物種:

説明: PubMed、核酸、アミノ酸配列、発現データ、PubChem (生化学的な働きをする小分子)、タンパク質構造、解読が完了したゲノム、TaxonomyといったNCBIの主要な30以上ものデータベースに対して、... 詳細へ

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ChEBI: Chemical Entities of Biological Interest

運用機関: European Bioinformatics Institute

生物種:

説明: 生命プロセスに介在する小分子化合物の辞典です。ゲノムに直接コード化されている分子（例：核酸、タンパク、ペプチド）はこのデータベースの対象外です。登録されているデータは、多数の情... 詳細へ

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