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4省の生命科学系データベースの統合を目指して

このサイトは、文部科学省厚生労働省農林水産省経済産業省による、生命科学系データベース統合のための合同ポータルサイトです。
内閣府 総合科学技術会議ライフサイエンスプロジェクトチーム 統合データベース(推進)タスクフォースの示す方針を踏まえて、平成23年度より、4省の間で生命科学系データベースの統合が推進されています。その統合のためのステップとして、データベースのカタログ、横断検索、アーカイブ構築などの連携を4省合同で進めています(図1)。

段階的進展の説明図
図1.4省データベース統合の段階的進展

database 48データベースを探す (カタログ)

一覧

searchデータを探す (横断検索)

box download_48データを使う (アーカイブ)

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以下は、各省で統合を進めている4つの機関それぞれのポータルサイトです。

文部科学省:バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)ポータルサイト

NBDC website

NBDCは、データベース整備・統合の様々な実務に携わるとともに、ファンディングを介して、統合のための基盤技術開発や、生命科学の各分野のデータベースの統合を進めています。平成22年度までの「文部科学省データベース統合プロジェクト」と平成23年度までの「バイオインフォマティクス推進事業」の流れを継承しています。

URL: http://biosciencedbc.jp/

厚生労働省:国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所のデータベースサイト

NAAC website

医薬基盤・健康・栄養研究所は医薬品・医療機器の開発のための基盤技術の研究と研究開発の振興を行う機関で、細胞や遺伝子などの研究資源やトキシコゲノミクスなどに関する8つのデータベースを公開しています。また、この8つのデータベースをはじめ,創薬・疾患研究に関するデータベースを横断的に検索できるサイト "Sagace"も提供しています。

URL: http://www.nibiohn.go.jp/nibio/data/

農林水産省:AgrID-農畜産物ゲノム情報データベース

agritogo-website

このサイトは、農畜産物のゲノム情報のポータルサイトとして、主に農林水産省が進めたゲノム関連プロジェクトで作成されたデータベースを統合しています。特に、植物、動物、昆虫などのゲノム情報やアノテーションデータを中心としたデータベースやツール60 件をまとめています。

URL: http://agrid.dna.affrc.go.jp/

経済産業省:MEDALS-経済産業省ライフサイエンス統合データベースポータルサイト

medals website

このサイトでは、経済産業省関連機関により実施された研究開発プロジェクトの成果を整備、統合しています。産業技術総合研究所、製品評価技術基盤機構、そしてNEDOプロジェクトの成果など、ライフサイエンス分野の研究開発に有用なデータベースをDNA・ゲノム、たんぱく質、RNAに分類して紹介するとともに、ツール(解析ソフト)、関連プロジェクト、報告書をまとめています。

URL: http://medals.jp/