文部科学省：NBDC－バイオサイエンスデータベースセンター

NBDCは、データベース整備・統合の様々な実務に携わるとともに、ファンディングを介して、統合のための基盤技術開発や、生命科学の各分野のデータベースの統合を進めています。平成22年度までの「文部科学省データベース統合プロジェクト」と平成23年度までの「バイオインフォマティクス推進事業」の流れを継承しています。

URL: http://biosciencedbc.jp/

厚生労働省：独立行政法人医薬基盤研究所のデータベースサイト

医薬基盤研究所では、医薬品・医療機器の開発に資する基盤技術を研究し、研究開発を振興することを通じて革新的医薬品等の創出に貢献し、国民保健の向上に資することを目的とし、細胞バンクや遺伝子バンクなどの研究資源やトキシコゲノミクスなど、8件のデータベースを公開しています。また、8つのデータベースを横断的に検索できる横断検索機能も提供しています。

URL: http://www.nibio.go.jp/data/

農林水産省：AgriTOGO－農林水産生物ゲノム情報統合データベース

このサイトは、農林水産省の研究の成果として公開している情報を統合し、より価値の高い情報を発信することを目的としています。

イネとカイコに関する統合データベースを公開するとともに、植物、動物、昆虫などのゲノム情報、アノテーションデータを中心としたデータベース47件をまとめています。また、提供しているデータベースに付随し、ゲノムデータの解析に役立つツールやviewerなど14件を取りそろえています。

URL: http://togo.dna.affrc.go.jp/

経済産業省：MEDALS－経済産業省ライフサイエンス統合データベースポータルサイト

このサイトでは、経済産業省関連機関により実施された研究開発プロジェクトの成果を整備、統合しています。産業技術総合研究所、製品評価技術基盤機構、そしてNEDOプロジェクトの成果など、ライフサイエンス分野の研究開発に有用なデータベースをDNA・ゲノム、たんぱく質、RNAに分類して紹介するとともに、ツール（解析ソフト）、関連プロジェクト、報告書をまとめています。

URL: http://medals.jp/