BGDB: Buckwheat Genome DataBase
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| 運用機関名: | 公益財団法人 かずさDNA研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | ソバのゲノムデータベースです。NGSによって得られたショートリード配列を用いてドラフトゲノムを決定し、遺伝子予測解析により決定されたCDSについて、NCBI NRまたはTAIR 10データベースによるBLAST解析によって機能予測を行なっています。InterProに対するドメイン検索の結果も収録しています。BLAST検索、キーワード検索が可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ftp://ftp.kazusa.or.jp/pub/buckwheat/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Eucalyptus camaldulensis Genome Database Zoysia Genome Database Jatropha Genome Database Eggplant Genome DataBase DAIZUbase KAOS TOT-DB Carnation DB gEVE database PPDB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2018-12-04 |
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レコード最終更新日:
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2018-12-04 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |