TogoVar: 日本人ゲノム多様性統合データベース
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| 運用機関名: | 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | TogoVar（日本人ゲノム多様性統合データベース）は、日本人ゲノム配列の個人による違い（バリアント）とそれに関係する疾患情報などを収集・整理したデータベースです。TogoVarは、研究プロジェクト横断的に集約した日本人におけるバリアントの頻度情報を提供します。利用可能な２つのデータセットであるJGA-NGSとJGA-SNPはNBDCヒトデータベース/Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA)に登録されている個人ごとのゲノムデータを集約して得られた頻度情報です。さらに、多種多様なデータベースに散在して収録されてきた遺伝子型や表現型に関連する情報を整理統合し、バリアントを解釈するための情報をワンストップでわかりやすく提供します。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://togovar.org/doc/ja/downloads |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | https://grch38.togovar.org/downloads/release/current/grch38/frequency/tsv/README.txt, https://grch37.togovar.org/downloads/release/current/grch37/frequency/tsv/README.txt |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://togovar.org/doc/ja/terms |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://togovar.org/doc/ja/contact |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=TogoVar |
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-001182/ |
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類似データベース:
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iJGVD gnomAD DBASS DisGeNET: a database of gene-disease associations DistiLD Database: Diseases and Traits in Linkage Disequilibrium Blocks VDJbase JSNP（アーカイブ） 統合がんゲノムデータベース Cancer Genome Mine PhenoModifier |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2018-06-18 |
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レコード最終更新日:
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2023-10-01 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |