Prokaryotic Operon DataBase: ProOpDB
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| 運用機関名: | ― |
| 運用機関所在国・地域: | メキシコ |
| 説明: | 原核生物ゲノムのオペロン予測リポジトリです。 独自の新しい高精度オペロンアルゴリズムを用いることで、1,200 以上の原核生物のゲノムのオペロン構造を予測しています。 各オペロンごとに生物名、パスウェイ、遺伝子オーソログ、保存されたタンパク質モチーフ、アミノ酸配列、5'や3'の遺伝子間配列などを収録しています。生物種やオペロンのリスト、COG、KEGG、Pfamによるリストからの検索が可能です。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | タンパク質, ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 画像/動画, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.p6hdm8 |
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類似データベース:
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ODB CDD GreenPhylDB: A phylogenomic database for plant comparative genomics Conserved Domains and Protein Classification OrthoInspector COGs GenProtEC (E. Coli genome and proteome database) Pfam RegulonDB AntWeb |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |