PPDB - Integbio データベースカタログ

PPDB: PlantPromoterDB

ID:	NBDC01041
名称:	PPDB
別称:	PlantPromoterDB
URL:	https://ppdb.agr.gifu-u.ac.jp/ppdb/cgi-bin/index.cgi
運用機関名:	岐阜大学 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域:	日本
説明:	シロイヌナズナの高密度転写開始点情報や、イネなどのプロモーター情報を提供しているデータベースです。CT-MPSS 法を用いて、シロイヌナズナの完全長cDNA 5'末端タグ配列を解析し、ゲノム上にマップすることで転写開始点を決定しています。
生物種:	Arabidopsis thaliana (3702), Oryza sativa (4530), Physcomitrella patens (3218), Chlamydomonas reinhardtii (3055)
タグ（対象）:	ゲノム/遺伝子
タグ (データの種類):	配列
論文等 (PubMed ID/DOI):	PubMed ID: 17947329 DOI: - PubMed ID: 24194597 DOI: -
言語:	英語
稼動状況:	稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク:	http://ppdb.agr.gifu-u.ac.jp/ppdb/cgi-bin/index.cgi#download
一括ダウンロードデータのデータ説明:	―
データベースの利用許諾へのリンク:	http://ppdb.agr.gifu-u.ac.jp/ppdb/cgi-bin/license.cgi
データベースの使い方	―
データベースの連絡先:	―
API / SPARQL endpoint:	―

LSDBアーカイブへのリンク:	―
MEDALSデータベース便覧へのリンク:	―
統合TVへのリンク:	―
FAIRsharingへのリンク:	https://fairsharing.org/biodbcore-000603
類似データベース:	Arabidopsis thaliana project トレニア遺伝子データベース EPD KAOS BGDB Genome Methylation Database ARCHAIC TOT-DB KAIKObase DAIZUbase