Human Protein Atlas
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| 運用機関名: | Uppsala University |
| 運用機関所在国・地域: | スウェーデン |
| 説明: | 様々な種類のヒトの器官、組織、細胞におけるタンパク質の発現および局在に関するデータベースです。蛍光抗体イメージング、質量分析に基づくプロテオミクス、網羅的な遺伝子発現解析によるトランスクリプトミクスおよびシステム生物学の手法により得られた情報を遺伝子ごとに記載しています。各レコードは３つのアトラスで構成されています。 「組織アトラス」：ヒトの主要組織や器官におけるRNA発現量、タンパク質発現量 「細胞アトラス」：RNA発現量や発現画像、GFP発現画像など細胞内での局在 「疾病アトラス」：生存がん患者の組織における量的発現解析（RNA-seq）や空間的発現解析（マイクロアレイ）によるタンパク質発現レベル また、抗体の情報、細胞内器官の説明、各組織における腫瘍の説明や生存率の情報なども収録しています。 遺伝子名、抗体名、タンパク質の分類によるデータの絞り込みが可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, タンパク質, 細胞/オルガネラ, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 発現, 画像/動画, 分布 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://www.proteinatlas.org/about/download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | https://www.proteinatlas.org/about/download |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://www.proteinatlas.org/about/licence |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=Human Protein Atlas |
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-000411 |
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類似データベース:
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CYCLoPs ViBE-Z zTRAP Marmoset Gene Atlas DropViz Haemosphere MatrisomeDB Melonet DB GFP-fusion library of Schizosaccharomyces pombe LocDB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2022-01-24 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |