データベースのレコード一覧  (件数: )

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運用機関: Texas A and M University
生物種: Escherichia coli
説明: あらゆる非病原性大腸菌とそのファージ、プラスミド、可動性遺伝因子にアノテーションを付すことを目的とした、コミュニティベースのリソースです。大腸菌の各系統についての遺伝子型、表現... 詳細へ
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運用機関: Disease Systems Biology Group, Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research, University of Copenhagen
生物種: Homo sapiens
説明: 疾患に関連する SNP および遺伝子を染色体の観点から容易に照会・可視化することができるデータベースです。過去に行われたゲノムワイド関連解析(GWAS:genome-wide association study)の結... 詳細へ
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運用機関: Structural Biology and Bioinformatics Division Indian Institute of Chemical Biology
生物種: Actinobacillus | Aeromonas | Arcanobacterium | Bacillus | Bordetella | ...
説明: ヒトに対する細菌外毒素のデータベースです。本データベースは、ヒトの細菌性疾患の発症に寄与する毒素に関する情報を集約することを目的としています。病原菌については名称とNCBI Taxonomy... 詳細へ
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運用機関: European Medicines Agency
生物種:
説明: 2004 年 5 月 1 日以降、欧州連合(EU)において開始された医薬品のすべての介入臨床試験の欧州臨床試験データベースです。EudraCT データベースは、指令 2001/20/EC に従って開設されました。 詳細へ
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運用機関: Open Research and Contributor ID Initiative (ORCID)
生物種:
説明: ORCID は、研究者を特定する独自の識別子のレジストリであり、コミュニティが主導するオープンで非営利の取り組みです。透明性の高い手法で、これらの識別子に研究活動と成果を結びつけます... 詳細へ
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運用機関:
生物種:
説明: GESDB は、ヒト遺伝子研究についてのシミュレーションデータを共有し、シミュレーション技術を議論するためのプラットフォームです。データベースには、シミュレーションの説明、シミュレー... 詳細へ
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運用機関: University of California
生物種: All
説明: BiGG は、公開されたゲノムスケールの代謝ネットワークの概説を、単一のデータベースにまとめたフリーのリソースです。NCBI ゲノムアノテーションは、遺伝子をマッピングするために使用され... 詳細へ
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運用機関: AgBase, Mississippi State University
生物種: All
説明: 宿主-病原体間におけるタンパク質-タンパク間相互作用(PPI: protein-protein interaction)を収録したデータベースです。宿主-病原体間の相互作用についての統一されたリソースとして機能... 詳細へ
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運用機関: Universiteit Stellenbosch
生物種: All
説明: 運動モデルの構築、修正、シミュレーションを行う他、キュレーションされたモデルを保存するためのシステム生物学ツールです。 詳細へ
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運用機関: Labome
生物種: All
説明: 高品質のサプライヤーが販売している試薬についての情報を整理したデータベースです。試薬には、抗体、siRNA / shRNA、ELISA キット、cDNA クローン、タンパク質/ペプチド、および生化学物質... 詳細へ
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運用機関: ELIXIR-Hub, UK, URGI, transplant
生物種: Agaricus subrefescens | Arabidopsis thaliana | Arabis alpina | Botrytis cinerea B0510 | Botrytis cinerea T4 | ...
説明: 植物や真菌の害虫に特化した多種統合的な情報システムです。遺伝学データとゲノムデータを橋渡しすることで、研究者に農学に関係する種の遺伝的情報(遺伝地図、定量的形質遺伝子座、関連遺... 詳細へ
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運用機関: Heidelberg Institute for Theoretical Studies, University of Manchester
生物種: All
説明: 科学的コミュニティ内での共同作業を可能にする SEEK ソフトウェアを使用して構築された公開リソースです。FAIRDOM は、欧州システム生物学コミュニティ(European Systems Biology Communit... 詳細へ
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運用機関: Auckland Bioengineering Institute
生物種: All
説明: IUPS フィジオームプロジェクトのためのメインのオンラインリポジトリです。ユーザーがデータを保存するためのバージョン情報とワークスペース(アクセスが制限されたリポジトリ)を提供しま... 詳細へ
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運用機関: Personal Health Informatics - Tampere University
生物種:
説明: モデル化された患者の継続的な健康状態を視覚化するソフトウェアツールを対象とした、一連のユーザビリティテストから得られたデータセットです。結果は、hFigures による可視化ライブラリに... 詳細へ
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運用機関: Swiss-Prot group, SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Vital-IT group, SIB Swiss Institute of Bioinformatics
生物種: Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | Homo sapiens | Mus musculus | Mycobacterium tuberculosis | ...
説明: 脂質および脂質のデータを生物学的な知識およびモデルと統合するためのフレームワークを提供するリソースです。専門家がキュレーションを行っています。SwissLipids は毎日更新されます。 詳細へ
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運用機関: Stanford University Center for Biomedical Informatics Research, University of Miami School of Medicine
生物種: All
説明: RegenBase は、脊髄損傷 (SCI) の生物学のナレッジベースです。SCI のための初めてのオントロジーの形で、文献ベースのファクトと実験の詳細、SCI が化合物の酵素活性と細胞増殖に与える影響... 詳細へ
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運用機関: Max Planck Institute for Ornithology (MPIO), University of Konstanz Library
生物種: Animalia
説明: 査読済み出版物と関連する動物のトラッキングデータセットを無料で公開するアーカイブです。本リポジトリは、Movebank (movebank.org) に関連付けられた長期アーカイブです。Movebank は、... 詳細へ
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運用機関: Baylor College of Medicine, Human Microbiome Project, Broad Institute, J. Craig Venter Institute (JCVI), NIH Data Analysis and Coordination Center (DACC), Washington University in St Louis School of Medicine
生物種: Homo sapiens
説明: NIH のコモンファンドである ヒトマイクロバイオームプロジェクト(Human Microbiome Project:HMP)は、ヒトマイクロビオームの包括的な特性評価とヒトの健康と疾病におけるその役割の分析... 詳細へ
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運用機関: University of Southern California (USC)
生物種: Danio rerio | Homo sapiens | Mus musculus
説明: FaceBase は、頭蓋顔面の発達と奇形に関する研究を後押しするデータ生成を促進するため、NIDCR が資金を提供するコンソーシアムです。さまざまな種類の大規模なデータセットを生成し、本サイ... 詳細へ
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運用機関: Division of Sleep & Circadian Disorders, Brigham and Women's Hospital/Harvard Medical School
生物種: Homo sapiens
説明: 睡眠の研究に関する国家的リソースです。十分に特徴が明らかにされている研究コホートと臨床試験から収集された、匿名化された生理学的シグナルおよび臨床データ要素の大規模コレクションに... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Homo sapiens
説明: MHAS 調査は、波状に分布する一連のアンケートであり、そのうち 4 番目のものは 2015 年秋に行われました。研究目的には、以下が含まれますが、これらに限定されません: 1)大規模な高齢のメ... 詳細へ
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運用機関: Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale (INSERM), Pasteur Institute of Morocco
生物種: Homo sapiens
説明: 地中海地域の集団における創始者変異データへのオンラインアクセスを提供する包括的なデータベースです。地中海地域の集団に見られる創始者変異のスペクトルに関する概要を科学コミュニティ... 詳細へ
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運用機関: Biozentrum, University of Basel, SIB, Swiss Institute of Bioinformatics
生物種:
説明: 学術的文献の中で発表された計算マクロ分子モデルを安定して保存、提供するアーカイブです。寄託された各モデルについて、ユニークかつ安定した受託コード(DOI)を付与し、該当する本文の中... 詳細へ
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運用機関: University of Pennsylvania, Institute for Biomedical Informatics (IBI), University of Pennsylvania
生物種: Homo sapiens
説明: ヒトの小ノンコーディング RNA (sncRNAs)の全ての重要なクラスを対象に、アノテーションと配列決定に基づく発現データを統合的に提供するデータベースです。完全な sncRNA 転写物と、これ... 詳細へ
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運用機関: Centre for Proteomic and Genomic Research (CPGR)
生物種: Homo sapiens
説明: 細胞シグネチャーに関する統一されたネットワークベースのデータポータルです。LINCS データセットパッケージと試薬を検索することができる統一的なインターフェースを提供します。 LINCSの... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Homo sapiens
説明: eMERGE は、米国国立ヒトゲノム研究所(NHGRI)によって組織され、かつ資金提供を受けた国家的ネットワークです。DNA 生体リポジトリと、ゲノム医学の実施を支援する大規模かつハイスループ... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Homo sapiens
説明: 自閉症スペクトラム障害(ASD)は、反復的な社会的コミュニケーションにおける質的障害、ならびに反復的、制限的、および常同的行動によって特徴付けられます。これまで珍しいとされていたAS... 詳細へ
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運用機関: Gail and Gerald Oppenheimer Center for Neurobiology of Stress at UCLA , University of California
生物種: Homo sapiens
説明: UCLA で行われた構造的および機能的磁気共鳴スキャン(MRI、fMRI、および DTI)の脳画像アーカイブであり、すべての疼痛研究者に公開されています。 詳細へ
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運用機関: Eawag, Johannes Gutenberg University
生物種: Bacteria
説明: enviPath は、微生物生体内における有機環境汚染物質の変化に関するデータベース兼予測システムです。実験的に観察された生体内変化経路を保存し、表示することができる他、経路と実験条件お... 詳細へ
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運用機関: Bioinformatics Centre, Institute of Microbial Technology, Council of Scientific and Industrial Research (CSIR)
生物種: Archaea | Bacteria
説明: 原核生物におけるクオラムセンシングシグナリング分子(QSSM:quorom sensing signaling molecule)に特化したリポジトリです。様々なクオラムセンシングのシグナル伝達系に関わる QSSM に関... 詳細へ
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運用機関: Cataland Institution for Research and Advanced Studies (ICREA), Barcelona Supercomputing Center (BSC), Barcelona University, Institute for Research in Biomedicine
生物種: All
説明: 核酸の構造に関する、原子論的ダイナミクスシミュレーション軌道と解析のためのデータベースです。核酸シミュレーションデータの保存および解析を行う上で完全なプラットフォームです。BIGNA... 詳細へ
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運用機関: College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Group of Computational Epigenetic Research (GCER), Lab of Developmental Biology, Harbin Institute of Technology
生物種: All | Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | Homo sapiens | Mus musculus
説明: スーパーエンハンサーの収集、保管、オンライン分析に焦点を当てた、包括的なオンラインリソースです。複数の種におけるスーパーエンハンサーの統合と、それらの細胞同一性遺伝子発現の調節... 詳細へ
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運用機関: George Washington University
生物種: Homo sapiens
説明: 遺伝子発現と疾患の関連についてのキュレーションされたデータベースです。発現レベルが遺伝子にマッピングされています。 詳細へ
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運用機関: Comsats Institute of Information Technology (CIIT), Seoul National University
生物種: Archaea | Bacteria
説明: 2,472 個の完全に配列決定された原核生物ゲノムを対象に、推定によるゲノムワイド水平遺伝子導入(HGT:horizontal gene transfer)情報を提供するデータベースです。HGTの検出は、明示的な... 詳細へ
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運用機関: Baylor University, Churchill Group, The Jackson Laboratory, University of Tennessee
生物種: Caenorhabditis elegans | Canis familiaris | Danio rerio | Drosophila melanogaster | Gallus gallus | ...
説明: 非均一なデータソースから得られた遺伝子のセットを保存し、キュレーションし、分析することができる、一般に利用可能なオンラインリソースです。本システムを利用して、遺伝子セットの交叉... 詳細へ
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運用機関: Sequentia Biotech SL
生物種: Chlorophyta | Viridiplantae
説明: 37 種の植物種と 6 種の藻類を対象に、lncRNA (Long non-coding RNAs)にアノテーションを付ける独自開発のツールを適用することで生成された、12 万件以上の lncRNA のアノテーションデー... 詳細へ
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運用機関: Indian Institute of Technology Hyderabad (IITH)
生物種:
説明: EK3D は、72 個の大腸菌 K 抗原に関するリポジトリです。糖組成、エピマーおよびエナンチオマーの形態、および糖単量体間の結合に関する情報を提供します。 詳細へ
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運用機関: University of Vienna, Department of Microbiology and Ecosystem Science
生物種: All
説明: rRNA を標的としたオリゴヌクレオチドプローブおよびプライマーに関する手作業でメンテナンスおよびキュレーションされたデータベースです。各オリゴヌクレオチドエントリーについて、最新の... 詳細へ
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運用機関: Institut francais de recherche pour l'exploitation de la mer (Ifremer)
生物種: All
説明: Seanoe は、海洋科学分野における学術的データを取り扱う出版社です。PôleOcéan の枠組みの中で、Sismer によって運営されています。Seanoe が公表したデータは、自由に利用することができま... 詳細へ
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運用機関: Lab of bioinformatics and computational genomics (BIOBIX)
生物種:
説明: リボソームプロファイリングを用いて同定された 短いオープンリーディングフレーム(sORF) のデータベースです。リボソームプロファイリングから開始した sORFs.org は、sORF を同定し、最先... 詳細へ
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運用機関: Australian National Data Service (ANDS), eResearch Centre, Monash University
生物種:
説明: 高スループットデータセット(マイクロアレイ、プロテオミクスデータなど)から個々のインターフェロン調節遺伝子(IRG)または IRG のシグネチャーを高い信頼性の下で同定することができる... 詳細へ
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運用機関: Karr Lab, Institute for Multiscale Biology & Genomics
生物種:
説明: 全細胞モデルのシミュレーション結果を収録したデータベースです。研究者が、全細胞モデルの予測結果を簡単に調べて分析できるように設計されています。予測には以下の項目が含まれます。 - ... 詳細へ
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運用機関: BioVeL, Encyclopedia of Life, Natural History Museum, Pensoft Publishers, The Biodiversity Heritage Library (BHL), Virtual Biodiversity Research and Access Network for Taxonomy (ViBRANT), Vizzuality, e-monocot project
生物種: All
説明: 誰もが自分のデータを共有して独自の研究ネットワークを作成できる、生物多様性研究者のためのオンライン仮想研究環境です。オンライン登録フォームを入力した研究者には無料でサイトが提供... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Homo sapiens
説明: 多因子遺伝の最もシンプルな形態である消化器疾患に関与する遺伝子や関連遺伝子変異について詳細な情報を初めて提供する、新規なデータベースです。 詳細へ
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運用機関:
生物種: Homo sapiens
説明: 結腸直腸癌の細胞株および組織に関連するゲノムおよびプロテオームを統合したオンラインリソースです。 カタログ化されたデータには、定量的および非定量的タンパク質発現、配列変異、細胞シ... 詳細へ
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運用機関: Bioinformatics and Computational biology Unit, Molecular genetics Lab, University of Rome Tor Vergata
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明: 学術的な文献に掲載されているシグナリング情報を構造的に整理し、保存するオープンリソースです。捕捉された情報は、生物学的実体間の二元因果関係として保存され、活動フローとして図式的... 詳細へ
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運用機関: University of Rome Tor Vergata
生物種: Viruses
説明: VirusMenthaはIMExコンソーシアムに関わるタンパク質ータンパク質データベースから手動キュレーションしたウイルス相互作用のコレクションです。このリソースは相互作用のネットワークの関係... 詳細へ
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運用機関:
生物種: All
説明: 証拠として保存されている博物学コレクションの電子的情報を収録した米国の国家的リソースです。NIBA コミュニティ戦略計画の一貫として実施されており、NSF の ADBC(Advancing Digitizatio... 詳細へ
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運用機関:
生物種: Homo sapiens
説明: 公開されている転写因子のクロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-seq)実験結果を Encodeデータセットと統合した、包括的解析のためのリソースです。転写因子(TF)からの取得された転写因子結... 詳細へ
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運用機関: Centro de Investigacion Medica Aplicada (CIMA)
生物種: Archaea | Bacteria | Eukaryota
説明: スペインのプロテオミクス研究施設の連携、統合、発展を目的とした国家的ネットワークです。プロテオミクス分野のスペイン研究者を支援するため、プロテオミクスサービスを提供しています。 詳細へ