ホーム - Integbio データベースカタログ

統合TVへ

統合遺伝子検索GGRNA

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: キーワードから遺伝子を簡単に検索できるGoogleライクな検索エンジンです。塩基配列やアミノ酸配列情報を入力し高速に検索することも可能です。詳細へ

統合TVへ

DBCLS SRA: Survey of Read Archives

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: SRA, ENA, DRAに登録された次世代シークエンサからの出力データを対象とした目次を提供しています。具体的にはデータ生産の目的、プラットフォームの種類、生物種別に登録情報を閲覧、検索す... 詳細へ

統合TVへ一括ダウンロード可

Gendoo: Gene. Disease Features Ontology-based Overview System

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: 遺伝子について関連する疾患、薬剤、臓器、生命現象などの特徴をキーワード (MeSH用語)で関連性の度合いとともに示したデータベースです。興味のある疾患名称やOMIM IDから関連する遺伝子の... 詳細へ

LSDBアーカイブへ統合TVへ一括ダウンロード可

RefEx: Reference Expression Dataset

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus

説明: ヒトやマウスなどを対象に、異なる手法 (EST、Gene Chip、CAGE、RNA-seq)により取得された臓器/組織別の遺伝子発現データを並列に表示し、遺伝子発現解析を行う上で標準となるリファレンスと... 詳細へ

統合TVへ一括ダウンロード可

DRA: DDBJ Sequence Read Archive

運用機関: 情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所　生命情報・DDBJ センター

生物種: All

説明: DRAは次世代シークエンサからの出力データの登録及び登録されたデータの検索のためのデータベースです。NCBIのSRA、EBIのERAとの国際協力のもとDDBJにより運営されています。従来のキャピラ... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

医学・薬学予稿集全文データベース

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: 科学技術振興機構(JST)のJDreamサービスの「医学・薬学予稿集全文データベース」に搭載されていた学会要旨集のうち、改めて利用許諾をいただいた学会の予稿集を無償で公開しています。詳細へ

統合TVへ

OReFiL: Online Resource Finder for Lifesciences

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: 論文中に記述される、オンライン上に公開されいてる生命科学系データベースやソフトウェアなどを検索するシステムです。MeSH用語や著者名での検索も可能です。詳細へ

運用終了

統合TVへ

TogoProt

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種:

説明: 蛋白質関連データベース統合検索システムです。キーワード検索によりまずメニューに蛋白質のファミリー名のリストが表示されます。メニューから目的の蛋白質またはファミリーを選ぶとその蛋... 詳細へ

一括ダウンロード可

ゲノム特定領域（2005年-2009年）年次報告書データ一覧

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: 2005年から2009年に実施された文部科学省ゲノム特定領域の年次報告書及び最終報告書のPDFをダウンロードして閲覧できます。また2000年から2004年に実施された旧ゲノム特定領域の最終報告書の... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

GenLibi: Gene Linker to Bibliography

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus

説明: ＪＳＴ文献情報から得られる遺伝子機能や関連する疾患／表現型を提供するためのシステムです。テスト版では、ヒト、ラット、マウスの遺伝子について、遺伝子、蛋白質、多型、パスウェイ(代謝... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

ゲノム解析ツールリンク集

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種:

説明: 分子生物学分野のデータ解析に欠かせないツール提供サイトへのリンク集です。論文やWebから解析ツールに関する情報を調査収集し、各ツールを用途によって階層的に分類しています。また各ツー... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

Webリソースポータルサイト

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種:

説明: バイオインフォマティクス解析に役立つツールやワークフローなどのリソース情報をまとめたサイトです。処理要素、分野、文献別などの階層分類により目的のリソース情報を探し出すことが可能... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

ライフサイエンス新着論文レビュー: FIRST AUTHOR'S

運用機関: 情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター

生物種:

説明: トップジャーナルに掲載された日本人を著者とする生命科学分野の論文について，論文の著者自身の執筆による日本語のレビューを、だれでも自由に閲覧・利用できるよう、いち早く公開していま... 詳細へ

統合TVへ

生命科学データベース横断検索

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種:

説明: 国内外に散在する生命科学分野のデータベースを、特許や文献情報とあわせて一括して検索できるサービスです。キーワードによる検索や、生物種リスト、更新時期による絞り込み、対象とするデ... 詳細へ

NBDC事業推進部

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構　NBDC事業推進部

生物種:

説明: ライフサイエンスデータベース統合推進事業を所管するNBDC事業推進部（旧バイオサイエンスデータベースセンター）の事業・組織紹介サイトです。NBDCが直接提供するサービスサイト（データベ... 詳細へ

運用終了

機能性RNAゲノムブラウザー

運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所

説明: UCSC Genome Browserに機能性RNAに関連したトラックの追加および機能拡張を施したものです。様々な既知ncRNAのゲノムへのマッピング情報がトラック情報として閲覧することができます。機能性... 詳細へ

LSDBアーカイブへ統合TVへ

KNApSAck Family

運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学

生物種: Embryophyta | Homo sapiens | Arabidopsis | Bacillus

説明: 二次代謝産物データベースKNApSAcKをコアシステムとした統合型データベースです。遺伝子アノテーションではArabidopsis、Bacillus、Humanが公開されています。タンパク質の金属イオン結合部... 詳細へ

一括ダウンロード可

Escherichia coil Multi-omics Database

運用機関: 慶應義塾大学

生物種: Escherichia coli

説明: 大腸菌のオミックスデータを集積したデータベースです。詳細へ

休止
(14日以上)

RefExA: Reference database for gene Expression Analysis

運用機関: 東京大学　先端科学技術研究センター

生物種: Homo sapiens

説明: ヒト正常組織、正常細胞、癌細胞株の網羅的な遺伝子発現データベースです。詳細へ

一括ダウンロード可

NITE-CHRIP: NITE Chemical Risk Information Platform

運用機関: 独立行政法人製品評価技術基盤機構

生物種:

説明: 化学物質の番号や名称等から、国内外の法規制情報及び国内外の機関による有害性情報、リスク評価情報等を検索することができるシステムです。詳細へ

一括ダウンロード可

ミヤコグサEST・完全長配列

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

生物種: Lotus japonicus

説明: ミヤコグサの98838のEST配列と3488の完全長cDNA配列を蓄積したデータベースです。詳細へ

RISH Database: EST Database of Trees for Sustainable Humanosphere

運用機関: 京都大学

生物種: Acacia mangium

説明: アカシアのESTを6253個、配列決定し、そのデータを蓄積したデータベースです。詳細へ

MS-MS Fragment Viewer

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

生物種:

説明: LC-FT/ICR-MS解析で得たフラグメントイオンの構造を予測したFT-MS、IT-MS/MS、FT-MS/MSのスペクトルデータを格納したメタボロミクスデータベースです。詳細へ

休止
(14日以上)

KomicMarket: Kazusa Omics Data Market

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

説明: KomicMarket (Kazusa Omics Data Market)は、代謝物を含むシステムバイオロジーやマルチオミックス解析に強く興味を持つ研究者により開発、運用されています。KomicMarketは、LC-FT-ICR-MS法... 詳細へ

運用終了

H-Exp

運用機関: 独立行政法人産業技術総合研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 組織特異的転写物発現頻度データベース（iAFLP-DB）です。詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

DNA ProbeLocator （アーカイブ）

運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 多様な形式のマイクロアレイプローブ配列すべてを完全長cDNA配列に対してマッピングした結果を格納しています。産業技術総合研究所によるオリジナルサイト（http ://h-invitational.jp/DNAP... 詳細へ

LSDBアーカイブへ一括ダウンロード可

DIAM （アーカイブ）: 微生物産業利用支援データベース：DataBiosafety for Industrial Applications of Microbes

運用機関: 一般財団法人バイオインダストリー協会

生物種:

説明: 微生物やバイオセーフティ関連情報のデータベースです。「バイオセイフティ関連の法規則」、「バイオテクノロジーの基礎知識」、「安全性に関する文献」、「微生物情報」に分かれます。2011... 詳細へ

DAGViz: Directed Acyclic Graphs Viewer

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

説明: 各生物種のオントロジーを検索・閲覧できるデータベースです。詳細へ

CoP: Co-expressed Biological Processes

運用機関: 公益財団法人かずさDNA研究所

説明: 植物遺伝子の発現相関データベースです。詳細へ

運用終了

ARMLiPDB

運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所

生物種: Mus musculus

説明: マウス肝蛋白質の年齢軸発現データベースです。詳細へ

The Stem Cell Community

運用機関:

生物種: Homo sapiens

説明: ヒト胚性幹細胞（ES cell)に関する情報を共有するためのコミュニティです。ES cell lineデータベース、論文、特許、遺伝子発現データなどが掲載されています。詳細へ

一括ダウンロード可

DrugBank

運用機関: University of Alberta/Department of Computing Science

生物種:

説明: 薬剤の化学的、薬理的、薬事的データとそのターゲット（配列、構造、パスウエイ）の詳細情報を収集、統合したバイオインフォマティクスおよびケモインフォマティクスのリソースです。薬剤エ... 詳細へ

一括ダウンロード可

ExPASy (Bioinformatics Resource Portal)

運用機関: Swiss Institute of Bioinformatics

生物種:

説明: ExPASy Webサーバーはスイス生物情報科学機構(SIB)において提供されるプロテオミクス分野に向けた統合サービスです。タンパク質やプロテオミクスを中心とした種々のデータベースや解析ツール... 詳細へ

公開停止中

JFODB: Japan Fisheries Oceanography Database (水産海洋データベース)

運用機関: 国立研究開発法人水産研究・教育機構

生物種:

説明: 明治、大正から継続されている日本の水産調査研究により収集された日本周辺海域の海水温など海洋環境、卵・稚仔・プランクトンおよびマイワシ・サバなど浮魚類の魚体測定データなど生物デー... 詳細へ

休止
(14日以上)

Functional Food Factors

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種:

説明: さまざまな機能性食品因子が食品中にどれくらい含まれているか実際に定量した結果が、一般的な栄養素とともにデータベース化されています。イソフラボンを含む食品を摂取したいといったとき... 詳細へ

公開停止中

健康・栄養情報基盤データベース

運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

生物種:

説明: 国民栄養調査(NNS:National Nutrition Survey）に関するデータ検索サービスです。世帯別摂取量、個人別摂取量、個人身体情報、料理情報、各国栄養所要量、栄養素寄与に関する情報を提供して... 詳細へ

公開停止中

Marine Biological Sample Database (海洋生物サンプルデータベース)

運用機関: 国立研究開発法人海洋研究開発機構

生物種:

説明: JAMSTECの船舶・潜水船等で採取した生物サンプルのデータベースです。サンプル名、採取場所、水深、保存方法、採取システムなどを収集、蓄積、公開しています。詳細へ

運用終了

Deep Sea Image Database (深海画像データベース)

運用機関: 国立研究開発法人海洋研究開発機構

生物種:

説明: JAMSTECでは潜水調査船や無人探査船により取得された膨大な深海の静止画像を保管・管理しています。本データベースではこれらの画像のうち公開猶予期間を経過したものを公開しています。「深... 詳細へ

運用終了

深海ビデオキャスト

運用機関: 国立研究開発法人海洋研究開発機構

生物種:

説明: JAMSTECが保有する貴重な深海調査映像を軽量なフォーマット（MPEG-4）で公開しています。「深海ビデオキャスト」は「深海映像データベース」「深海画像データベース」と共に「深海映像・画像... 詳細へ

深海映像・画像アーカイブス（J-EDI）

運用機関: 国立研究開発法人海洋研究開発機構

生物種:

説明: 深海にすむ生物や深海底の映像・画像、潜航調査の様子を収録したデータベースです。「しんかい6500」や「ハイパードルフィン」などの潜水調査船や無人探査機で撮影された深海の映像や画像を... 詳細へ

運用終了

SNP Database Network in Japan

運用機関: 独立行政法人科学技術振興機構

生物種:

説明: わが国で構築した多型情報データベースや多型情報解析ツールのリンク集を紹介しています。詳細へ

運用終了

KEGG ENVIRON

運用機関: 京都大学　化学研究所　附属バイオインフォマティクスセンター

生物種:

説明: 生薬、精油など、主に植物由来の天然物を集めたデータベースです。成分、効能、由来生物種などの情報が蓄積されています。現時点での主なカテゴリーは生薬、精油、メディカルハーブの３つで... 詳細へ

休止
(14日以上)

PBDB: Pathogenic Bacteria Data Base

運用機関: 京都大学　大学院医学研究科

生物種: Bacteria

説明: 病原細菌データベース（PBDB)は、病原細菌の研究情報をネットワークを通じて一般に公開し、研究者の相互協力を促し、研究者の教育及び研究を目的としたデータベースです。各細菌の画像、分布... 詳細へ

運用終了

組織画像データベース

運用機関: 関西医科大学

生物種: Homo sapiens

説明: 関西医科大学の組織学実習の画像を公開しています。画像は器官・組織ごとに階層型にまとめられています。詳細へ

休止
(14日以上)

The European ribosomal RNA Database

運用機関: University of Gent/Department of Plant System Biology

生物種: Archaea | Bacteria | Eukaryota

説明: 小サブユニットおよび大サブユニットのリボソームRNA配列を収録したデータベースです。配列はアライメント形式で提供され、比較解析によって導かれた二次構造情報が表示されます。その他、参... 詳細へ

一括ダウンロード可

COXPRESdb

運用機関: 東京大学　医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター

説明: 1000以上の公共のマイクロアレイデータから計算したヒト・マウス・ラット、他4 種の共発現遺伝子データベースです。各生物種について約20000 遺伝子の共発現情報を参照でき、任意の遺伝子群... 詳細へ

休止
(14日以上)

水生生物情報データーベース

運用機関: 国立研究開発法人水産研究・教育機構

生物種:

説明: 水生生物各種の概要、NCBIの分類に基づいた分類情報、近縁種情報、文献情報、DNA情報、系統保存情報などが閲覧できます。詳細へ

休止
(14日以上)

生活習慣病ナレッジデータベース

運用機関: 山梨県中央市役所

生物種: Homo sapiens

説明: 糖尿病、虚血性心疾患、高血圧症、高脂血症、高尿酸血症について、概要、症状、対処療法、医療機関への目安などの情報を提供しています。データベースの他に「FAQ」「健康チェック」「リンク... 詳細へ

WFCC: World Federation for Culture Collections

運用機関: World Federation for Culture Collections

生物種: Bacteria | Archaea | Eukaryota | Viruses

説明: 微生物の培養株を収集・保存し、研究や教育などのために菌株の分与と情報の提供を行う国際機関のホームページです。詳細へ

一括ダウンロード可

worm UTRome: C.elegans 3'UTR Database

運用機関: Arizona State University

生物種: Caenorhabditis elegans

説明: 3'UTR（3'非翻訳領域）は、タンパク質やマイクロRNAのような非コードRNAとの相互作用によって転写後発現調節を行うための重要な部位です。このデータベースは、線虫の3'UTR生物学の包括的リ... 詳細へ

データベースのレコード一覧 (件数: )

一覧内を検索する

一覧を絞り込む

生物種

タグ＜対象＞

タグ＜データの種類＞

稼動状況

地域

その他の条件

メニュー

新着情報

本カタログの使い方