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運用機関: OriDB.org

生物種: Schizosaccharomyces pombe

説明: パン酵母 (Schizosaccharomyces pombe) の複製起点 (ori) に関して確定および予測されたマッピング情報を公開しているサイトです。各複製起点の染色体上の位置、塩基配列、複製時間などが収... 詳細へ

一括ダウンロード可

S. cerevisiae OriDB

運用機関: OriDB.org

生物種: Saccharomyces cerevisiae

説明: 出芽酵母 (Saccharomyces cerevisiae) の複製起点 (ori) に関して確定および予測されたマッピング情報を公開しているサイトです。各複製起点の染色体上の位置、塩基配列、複製時間、配列保全... 詳細へ

和漢薬Wikiデータベース

運用機関: 富山大学　和漢医薬学総合研究所

生物種:

説明: 和漢薬に関する総合的な情報や共同利用・共同研究拠点における研究成果などを公開するデータベースです。和漢薬に関する総説、和漢医薬学総合研究所で単離・構造決定した天然化合物のデータ... 詳細へ

休止
(14日以上)

極地生物多様性画像データベース: Database of Polar Biodiversity

運用機関: 情報・システム研究機構国立極地研究所

説明: 国立極地研究所生物圏研究グループが、厳しい自然環境や地球規模の環境変動に対する、極域生物群集の応答機構の調査研究を推進するために資料、データを共有化したデータベースのポータルサ... 詳細へ

休止
(14日以上)

Transcriptional Regulation Portal

運用機関: 九州工業大学

生物種: Bacteria | Archaea | Eukaryota

説明: 転写調節に関するデータベースとツールの情報を収録したポータルデータベースです。情報は「カテゴリー」や、「生物種」、「データベースのアルファベット順」により絞り込めます。また、キ... 詳細へ

Zoological Collection Database @ Stazione Zoologica 'Anton Dohrn' di Napoli

運用機関: Hosei Science Center, Italian-Japanese Biological Society and Stazione Zoologica di Napoli

生物種: Metazoa | Dinophyceae | Rhizaria

説明: このデータベースはナポリのアントン・ドーン臨海実験所 (SZN) における動物標本コレクションのデータベースです。コレクションについて、4,373のVRムービー、18,212の静止画像および7,771の... 詳細へ

ガラパゴス諸島画像データベース

運用機関: 長崎大学附属図書館

説明: 長崎大学名誉教授伊藤秀三博士が収集したガラパゴス諸島写真をもとに開発、構築されたデータベースで、ガラパゴス諸島全般における植生や自然、人文景観の情報や変遷をみることができます。... 詳細へ

世界の高山・極地の植生データベース

運用機関: 静岡大学理学部, 静岡自然環境研究会

説明: 高山や極地の植生をデータベース化し、公開しているサイトで、静岡自然環境研究会と静岡大学理学部生物学教室が運営しています。植物群落の分布、植物画像などを解説とともに掲載しており、... 詳細へ

運用終了

日本産魚類耳石大図鑑

運用機関: 愛媛県立宇和島水産高等学校

生物種: Actinopterygii

説明: 日本産硬骨魚類の耳石形態を体系的にまとめたデータベースです。種名、学名と耳石の写真、サイズ、採集地の情報が収録されています。データは目（もく）による一覧から閲覧できます。詳細へ

無脊椎動物の感覚・脳・行動データベース

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所脳科学総合研究センター神経情報基盤センター

説明: 無脊椎動物における神経生理学、神経行動学に関する実験データ、数理モデル及び研究ソフトウェアツールを収録したポータルサイトです。昆虫の脳と神経の染色画像、触角葉糸球体の３次元像、... 詳細へ

新・理科教材データベース

運用機関: 岐阜聖徳学園大学

生物種: Metazoa | Viridiplantae | Fungi | Cyanobacteria

説明: 学校で学ぶ「生活科」や「理科」の学習に関連した画像・動画教材と関連情報を集めたサイトです。学年別、分野別に絞り込みが可能です。また岐阜ＣＳＴ事業（岐阜大学・岐阜県教育委員会によ... 詳細へ

休止
(14日以上)

Epigenome project portal site

運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所

生物種: Homo sapiens

説明: エピゲノム解析の国際標準化を進めるEpigenome Projectのポータルサイトです。プロジェクトにより得られたヒト遺伝子に関するエピゲノムデータベース、がんに特異的なメチル化異常のデータベ... 詳細へ

休止
(14日以上)

PHDB: PH Database

運用機関: physiome.jp

生物種: Homo sapiens

説明: PHDBは、ヒトの生体機能とシステム生物学研究に関する統合データベースです。生物学的、生体的機能に関するモジュールを収録したPHMLモデルデータベース、生体組織の形態計測モデルを収録し... 詳細へ

一括ダウンロード可

OryzaPG-DB: Rice Proteogenomics Database

運用機関: 慶應義塾大学

生物種: Oryza sativa

説明: コメ (Oryza sativa) のプロテオームに関するデータベースです。未分化の培養細胞から得られたコメのプロテオーム結果、対応するcDNAや転写物、ゲノムの配列などを収録しています。データは... 詳細へ

公開停止中

有孔虫研究会Database

運用機関: 茨城工業高等専門学校

生物種: Foraminifera

説明: 日本産有孔虫種の文献と模式標本画像のデータベースです。著者、表題、年代、地域、発表年によって検索できます。また、標本画像は種名、属名、著者、発表年によって検索できます。詳細へ

GFP-fusion library of Schizosaccharomyces pombe

運用機関: 国立研究開発法人　情報通信研究機構未来ICT研究所

生物種: Schizosaccharomyces pombe

説明: 分裂酵母について、ゲノムDNAライブラリを用いた細胞内局在に関するデータベースです。ゲノムライブラリを用いてGFP との融合タンパク質を発現させ、そのGFP蛍光の細胞内局在画像と遺伝子情... 詳細へ

日本の亜熱帯海域における海草藻場・サンゴ礁閲覧システム

運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所

生物種: Chlorophyta | Alismataceae | Phaeophyceae | Anthozoa | Alcyonacea

説明: 沖縄県石垣島沿岸で見られる、海草類、褐藻類、サンゴ類、ソフトコーラル類の生息映像を収録したデータベースです。潜水撮影した各動植物のビデオを撮影地の範囲を示す航空写真と共に表示し... 詳細へ

休止
(14日以上)

統合センシングデータベース

運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構

生物種:

説明: 自然災害や人為的作用など社会の安全・安心を脅かす危険や脅威を早期かつ的確に検知し、その情報を迅速に伝達する統合センシング技術の創出を目指した研究を対象とする科学技術振興機構の研... 詳細へ

東京都医学研・脳神経病理データベース

運用機関: 公益財団法人東京都医学総合研究所

生物種: Homo sapiens

説明: 脳神経疾患の病理診断に役立つ研究成果を収集したデータベースです。中枢神経系に関わる用語や細胞の見え方、脳神経疾患の病理に関する解説、標本作成方法の情報や、病理標本の高精度スキャ... 詳細へ

休止
(14日以上)

MacroArray Analysis Page of Mesorhizobium loti MAFF303099

運用機関: 大阪大学

生物種: Mesorhizobium loti

説明: ミヤコグサ根粒菌MAFF303099株のマクロアレイ解析に関するデータベースです。共生・微好気・飢餓条件下における解析結果を提供しています。発現量の比較データはイメージマップと相関プロッ... 詳細へ

在日本脊椎動物化石標本データベース (JAFOV)

運用機関: 東京大学総合研究博物館, 産業技術総合研究所地質標本館

生物種: Vertebrata

説明: 日本に所在する脊椎動物化石標本のデータベースです。京都大学や国立科学博物館など、全国に分散して所蔵されている脊椎動物化石標本の情報を収集・登録して検索できるようにしています。化... 詳細へ

琵琶湖博物館地学・生物資料データベース

運用機関: 滋賀県立琵琶湖博物館

生物種:

説明: 琵琶湖博物館が収蔵する地学・生物標本のデータベースです。昆虫（液浸、乾燥）、貝類、魚類、両生爬虫類、鳥類、哺乳類、化石、岩石・鉱物、堆積物の資料について、学名、採集地、採集者、... 詳細へ

琵琶湖博物館 WEB図鑑

運用機関: 滋賀県立琵琶湖博物館

生物種: Bacillariophyta | Adephaga

説明: 琵琶湖博物館が収集整理した資料を、一般の方の学習活動に役立つような形に整理しなおした資料集です。「珪藻」「里山のゴミムシ」「琵琶湖地域の火山灰」「気象観測データ（琵琶湖博物館... 詳細へ

病理剖検輯報とデータベース

運用機関: 一般社団法人日本病理学会

生物種: Homo sapiens

説明: 日本の大学病院や認定病院、一般病院における病理解剖の記録を集めた「日本病理剖検輯報」の内容を収録したデータベースです。各レコードには患者の年齢、性別などの基本情報と、悪性腫瘍に... 詳細へ

日本核医学会学会誌

運用機関: 一般社団法人日本核医学会

生物種: Homo sapiens

説明: 日本核医学会の刊行物に関するポータルサイトです。和文機関誌「核医学」、英文誌「Annals of Nuclear Medicine」、関連刊行物のオンラインサイトへのリンクや投稿規定が掲載されています。... 詳細へ

全国大学演習林LTFHRデータベース

運用機関: 全国大学演習林協議会LTFHRデータベース運営委員会

生物種:

説明: 全国大学演習林において観測された、気象、水や物質循環に関する長期モニタリングデータを収めたデータベースです。気象、水文、水質の各データベースで構成されています。気象データベース... 詳細へ

生理学実験技術データベース

運用機関: 自然科学研究機構生理学研究所

生物種:

説明: 生理学研究所の様々な研究活動を支援してきた技術情報を公開しているデータベースです。実験動物情報、生物試料、標本画像、プロトコール、実習関連ビデオ、実習テキスト、装置、ソフトウェ... 詳細へ

水産食品の寄生虫検索データベース（D-PAF）

運用機関: DPAF事務局

説明: 魚介類に寄生する寄生虫や異物、およびそれに関連する水産食品の異常について、蓄積された最新データを公開し、一般消費者から水産研究者までが利用可能な正確な専門的知識を提供するデータ... 詳細へ

休止
(14日以上)

社団法人日本医学放射線学会　画像データベース（MIRC）

運用機関: 公益社団法人日本医学放射線学会

生物種: Homo sapiens

説明: 日本医学放射線学会が運営する放射線画像症例データベースです。症例画像、画像の所見、診断、参考文献などが登録できます。画像の登録、閲覧には会員登録が必要です。詳細へ

IDMPD-BJ: 骨・関節の遺伝病の疾患遺伝子の遺伝子変異と遺伝子多型の統合データベース

運用機関: 骨系統疾患コンソーシウム

生物種: Homo sapiens

説明: 骨、関節の単一遺伝病の遺伝子診断を行なうために不可欠な、疾患遺伝子の遺伝子変異と遺伝子多型のデータ、表現型との対応データを収集したデータベースです。骨系統疾患コンソーシウムが大... 詳細へ

休止
(14日以上)

一括ダウンロード可

効能・効果　用語データベース

運用機関: 大学病院医療情報ネットワーク薬剤小委員会　薬剤データベース作業部会

生物種:

説明: 医療用医薬品添付文書情報に記載されている効能、効果欄の用語のデータベースです。薬剤情報に使用される用語の標準化を目的としています。平成16年度から22年度のデータがそれぞれFile Make... 詳細へ

NIMG-PF: NeuroImaging-platform

運用機関: ニューロイメージング・プラットフォーム委員会, 国立研究開発法人理化学研究所脳科学総合研究センター神経情報基盤センター

生物種: Homo sapiens | Macaca fuscata

説明: 脳イメージングに関する様々なデータの共有を可能にするために構築されたデータベースシステムです。XooNIpsモードからは、文献情報、成果発表資料、データ、ツール情報等を容易に閲覧、活用... 詳細へ

博物図譜データベース

運用機関: 独立行政法人国立文化財機構東京国立博物館

生物種:

説明: 東京国立博物館が所蔵する本格的な博物図譜を電子化したデータベースです。江戸時代に編纂された岩崎灌園著「本草図譜」、「本草図説」、堀田正敦編「禽譜」、武蔵石壽編「目八譜」、馬場大... 詳細へ

京都大学総合博物館自然史収蔵資料

運用機関: 京都大学総合博物館

生物種:

説明: 京都大学総合博物館が収蔵する自然史関係の標本資料を対象としたデータベースです。動物、植物、菌類などの標本のうち、魚類、貝類、昆虫類、さく葉標本、パケット標本、化石標本について、... 詳細へ

休止
(14日以上)

一括ダウンロード可

RAISE Data Base: モンゴル国および周辺地域の自然環境データベース

運用機関: 筑波大学

生物種:

説明: RAISEデータベースは特にモンゴルに焦点を置いた、北東アジアの自然環境に関するデータベースです。水文気象学、航空機観察、地下水、土壌環境等の様々なデータセットを含んでいます。データ... 詳細へ

貝類データベース: SHELLS DATABASE

運用機関: 調査中

生物種: Mollusca

説明: 貝類のデータベースです。貝類の画像（主に貝殻）と和名、学名、採集地、分布範囲、参考文献などが収録されています。データは画像を使って形から、もしくは学名や和名から検索できます。詳細へ

脳ドック標準データベース

運用機関: 日本脳ドック学会

生物種: Homo sapiens

説明: 脳ドックによって得られる検査結果を、統一された書式で保存するための、標準フォーマットデータベースです。日本で初めての日本脳ドック学会公認の脳ドックガイドライン2008に準拠していま... 詳細へ

UMIN-CTR: UMIN臨床試験登録システム

運用機関: 大学病院医療情報ネットワーク

生物種: Homo sapiens

説明: 臨床試験情報のデータベースです。臨床試験名、対象疾患名、試験の評価、試験実施機関などが登録、閲覧できます。閲覧にアクセス制限はありませんが、登録にはIDとパスワードが必要です。こ... 詳細へ

TUFC菌株カタログ

運用機関: 鳥取大学農学部附属菌類きのこ遺伝資源研究センター

生物種: Fungi

説明: 菌類きのこ遺伝資源研究センター（FMRC）が保有するきのこ類を中心とした真菌類培養株（TUFC株）のカタログです。標本の形態情報とＤＮＡ塩基配列に基づいて種同定がなされたTUFC株につ... 詳細へ

THz database

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所, 国立研究開発法人情報通信研究機構

生物種:

説明: アミノ酸、高分子ポリマー、農薬、医薬品などの各種有機材料と、半導体、誘電体、カーボンナノチューブ、シリコンなどの無機材料等、様々な物質に対するテラヘルツ帯の透過スペクトルを掲載... 詳細へ

UniBio Press パッケージ

運用機関: UniBio Press

生物種:

説明: 日本国内で発刊される生物系ジャーナルのポータルサイトです。「Current Herpetology」「Journal of Mammalian Ova Research」「Mammal Study」「Ornithological Science」「Paleonotologica... 詳細へ

休止
(14日以上)

RTCGD: Retrovirous and Transposon tagged Cancer Gene Database

運用機関: オハイオ州立大学

生物種: Mus musculus

説明: レトロウイルスとトランスポゾンによる挿入変異を目印としたマウス腫瘍遺伝子のデータベースです。各遺伝子について、NCBIやMGI (Mouse Genome Database) へのリンクや、レトロウイルス、ト... 詳細へ

休止
(14日以上)

VSPECIMENS: A database for voucher specimens

運用機関: 証拠標本データベース作成委員会

生物種: Coleoptera | Hymenopter | Dryopteridaceaer

説明: 生物学研究において使用された材料の標本（証拠標本）を電子化し、標本のラベル情報、画像、標本が記載または引用されている文献情報を収録したデータベースです。国立科学博物館シダ類コレ... 詳細へ

The RAS/MAPK Syndromes Homepage

運用機関: 東北大学大学院医学系研究科・医学部

生物種: Homo sapiens

説明: RAS/MAPKパスウェイが阻害されることによって引き起こされる疾患のデータベースです。Costello症候群、CFC (cardio-facio-cutaneous) 症候群、Noonan症候群などの疾患を含むRAS/MAPK syndrom... 詳細へ

休止
(14日以上)

SYMPHONIE: SYMPtomics Hamamatsu Ontology for New Investigative Etiology

運用機関: 浜松医科大学

生物種: Homo sapiens

説明: 遺伝的要因がある疾患の症状オントロジーデータベースです。患者が示す症状や、診断所見、検査データ等を体系的に収集、分類し、それらのデータを疾患名、原因遺伝子、関連遺伝子と結びつけ... 詳細へ

休止
(14日以上)

SCCmec

運用機関: 順天堂大学

生物種: Staphylococcus aureus

説明: ブドウ球菌に広く存在するStaphylococcal cassette chromosome (SCC)と呼ばれるゲノムアイランドの中で、メチシリン耐性に関与する遺伝子mecAを持つSCCmecについての情報を提供するサイトで... 詳細へ

運用終了

Radiation Oncology Database （仮称：旧ROGAD）

運用機関: 公益社団法人　日本放射線腫瘍学会

生物種: Homo sapiens

説明: 日本放射線腫瘍学会が運用する放射線治療に関する病暦記録調査のデータベースです。日本全国の放射線治療を行う登録施設から、通院情報、検査情報、診察情報、投薬情報などが登録できます。... 詳細へ

休止
(14日以上)

一括ダウンロード可

Striga hermonthica EST Database

運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所

生物種: Striga hermonthica

説明: 寄生植物ストライガ (Striga hermonthica) のEST情報を収録したデータベースです。独自に収集した完全長cDNAクローンからシーケンスを読み取り、フリーのEST解析ツールEST2uniを使用してアノ... 詳細へ

JCVSD - 先天性部門: 日本心臓血管外科手術データベース - 先天性部門

運用機関: 日本心臓血管外科手術データベース機構

生物種: Homo sapiens

説明: 先天性心臓血管外科手術を受ける患者の術前後の医学的身体状況と手術内容・結果を登録するデータベースです。情報を登録、閲覧するには施設による参加登録が必要です。また、2013年以降の情... 詳細へ

休止
(14日以上)

一括ダウンロード可

IRView

運用機関: 東京大学医科学研究所

生物種: Homo sapiens | Mus musculus

説明: タンパク質の配列における相互作用領域 (IR) のデータベースです。ヒトとマウスから得られたタンパク質について、InterPro領域、非同義SNP、多型など他の機能領域のデータと合わせて収録し... 詳細へ

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