データベースのレコード一覧

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運用機関: 明​治​大​学​ ​農​学​部
生物種: Solanum lycopersicum
説明: トマトの統合オミックスデータベースです。全てのトマトのEST配列、マイクロトムの完全長cDNA配列、ITAG2.4遺伝子モデルの配列を収録しています。各配列は予測されたゲノム上の位置に基づい... 詳細へ
運用機関: 東京大学 大気海洋研究所
生物種: Copepoda | Appendicularia | Mysidacea | Chaetognatha
説明: CMarZ (Census of Marine Zooplankton)が提供する動物プランクトンに関する情報の統合検索システムです。プランクトンの写真、スケッチ、文献の情報や生息分布図、採集地などの情報、解析... 詳細へ
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運用機関: 北海道大学
生物種: Synechocystis sp. PCC 6803 | Arabidopsis thaliana
説明: 光合成を行う生物のためのタンパク質複合体解析のデータベースです。シロイヌナズナのチラコイドとSynechocystis PCC6803の細胞全体のタンパク質複合体について、Blue-Native PAGE後に切り出... 詳細へ
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運用機関: 株式会社情報数理バイオ, 明治大学
生物種: Bos taurus | Mus musculus | Homo sapiens
説明: ヒト、ウシ、マウスのゲノムから新規GPIアンカー型タンパク質の遺伝子を予測した結果のデータベースです。N末端、C末端からの30残基以内の平均疎水性値、C末端から30残基以内で最も平均疎水... 詳細へ
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運用機関: 九州大学 大学院医学研究院, 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans | Saccharomyces cerevisiae
説明: 論文などで報告された ChIP-seq データの可視化と解析を行うサイトです。公開 NGS データレポジトリ (NCBI, EMBL-EBI, DDBJ) に登録されたほぼ全ての ChIP-seq データをデータソースとしてい... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa
説明: The Rice Expression Database II INAHO(RED II INAHO)は、イネのアブシジン酸とジベレリンの応答性遺伝子の転写プロファイリングを調べるために、60-merのオリゴヌクレオチドマイクロアレ... 詳細へ
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運用機関: 一般社団法人SSCI-Net
生物種: Homo sapiens
説明: 化粧品などによる皮膚の健康被害や安全性についての症例を登録し調査解析するためのデータベースです。皮膚科関連学会会員の医療施設,日本皮膚科学会専門医主研修施設より症例情報を登録す... 詳細へ
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運用機関: 国立保健医療科学院
生物種: Homo sapiens
説明: 臨床研究情報ポータルサイトでは、国内の3つの臨床情報登録センター(大学病院医療情報ネットワーク研究センター〔UMIN-CTR〕、日本医薬情報センター〔JAPIC〕、日本医師会治験促進センター... 詳細へ
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運用機関: 東京大学 医科学研究所
生物種: Homo sapiens
説明: OpenTeinは幹細胞由来テラトーマのデジタル化したホールスライドイメージのデータベースです。個々のデータには実験情報が付けられており、画像は高解像度で拡大できる他、ダウンロードも可... 詳細へ
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運用機関: 公益社団法人 日本放射線腫瘍学会
生物種: Homo sapiens
説明: JRODは、日本全国の放射線治療情報の基本的部分を登録し、集計・分析することで医療の質向上に役立て、治療成績の改善を目指すことを目的としたデータベースです。 情報の登録は本事業への参... 詳細へ
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運用機関: 東北大学総合学術博物館
生物種: Foraminifera
説明: 浮遊性有孔虫電子標本のデータベースです。東北大学総合学術博物館が所有する浮遊性有孔虫の電子標本について実標本(r-specimen)の詳細な情報と3次元コンピュータ・グラフィックスでの標本... 詳細へ
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運用機関: 京都大学生存圏研究所
生物種: Basidiomycota
説明: 京都大学生存圏研究所が保有する木材腐朽性担子菌類の乾燥子実体標本および生体菌株のデータベースです。乾燥子実体標本については標本情報と書誌情報を、生体菌株については遺伝子情報に関... 詳細へ
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運用機関: 京都大学生存圏研究所
生物種: Acacia
説明: インドネシア南スマトラ島のアカシア大規模造林地における地上気象観測のデータベースです。林地内の8地点における降水量、気温、日射量の観測データを10分および1時間間隔のデータにまとめ... 詳細へ
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運用機関: 京都大学生存圏研究所
生物種: Tracheophyta
説明: 北海道大学、東北大学、森林総合研究所、東京大学、名古屋大学、京都大学、九州大学の関連機関で進める木材標本データベースのネットワークです。それぞれの木材標本データベースについてキ... 詳細へ
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運用機関: 公益財団法人日本モンキーセンター
生物種: Primates
説明: 日本モンキーセンターが所蔵する霊長類の標本のデータベースです。センターが運営するサル類動物園で飼育されていた個体から作製した数多くの標本の中から、骨格標本の情報が公開されていま... 詳細へ
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運用機関: 株式会社 生命誌研究館
生物種: Parasteatoda tepidariorum
説明: モデル節足動物であるオオヒメグモ (Parasteatoda tepidariorum) のESTのデータベースです。ESTシーケンスの情報閲覧、BLAST検索ができます。他生物の配列に対するEST配列のBLASTX結果も閲覧... 詳細へ
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運用機関: 慶應義塾大学
生物種: Mus musculus
説明: マウスの単一の個体由来の複数の組織から得られる代謝物質に関するメタボロミクスデータベースです。大脳、小脳、胸腺、脾臓、肺、肝臓、腎臓、心臓、すい臓、精巣、血清から得られた代謝物... 詳細へ
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運用機関: 公益財団法人東京都医学総合研究所
生物種: Callithrix jacchus
説明: コモンマーモセットの脳および脊髄の組織画像のデータベースです。 成体の脳と脊髄、生後0日の脳に加え,補足的にフクロモモンガ脳,アカゲザルとニホンザルの脊髄の組織画像が収録されてい... 詳細へ
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運用機関: 京都大学生存圏研究所
生物種: Sophora flavescens | Lithospermum erythrorhizon
説明: 二次代謝成分やバイオマスが利用される有用植物の Expressed sequence tags (EST)配列を収録したデータベースです。マメ科のクララ、ムラサキ科のムラサキ、マンギウム(Acacia mangium)のEST... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種: Mus musculus
説明: SDOP-DBはマウス表現型解析プロトコールのデータベースです。マウス表現型解析プロトコル情報の国際的共有・統合を目的として開発されました。 マウス表現型解析の標準作業手順書(Standard ... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種: Mus musculus
説明: マウス表現型解析情報のデータベースです。国際的に標準化された操作手順(Standard Operating Procedures:SOPs)に基づいて日本マウスクリニックが実施するマウス表現型の解析実験結果を収... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種:
説明: 生命科学分野のデータベースをRDF形式で一箇所に集約したポータルサイトです。JSTバイオサイエンスデータベースセンター (NBDC) と情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベース... 詳細へ
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運用機関: 東海大学医学部
生物種: Homo sapiens
説明: 学術文献より抽出した疾患、体質、薬剤応答性に関わるゲノム多型情報のデータベースです。それぞれの多型について、オッズ比やβ値、研究対象の集団、P値を収録し、また複数の独立な研究にお... 詳細へ
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運用機関: 愛媛大学沿岸環境科学研究センター
生物種: Metazoa
説明: 愛媛大学沿岸環境科学研究センターが冷凍保存している生物試料のデータベースです。主に動物の冷凍保存試料について、分類、採取地、部位、野生か飼育かなどの情報を収録しています。また、... 詳細へ
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運用機関: 自然科学研究機構 基礎生物学研究所
生物種: Bacteria | Archaea | Apicomplexa | Fungi | Chordata | ...
説明: MBGD (http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00130) のRDF版をSPARQLで検索するためのウェブサイトです。MBGDのRDFはセマンテックウェブでオルソログ情報を統合するために構築されたOrth... 詳細へ
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運用機関: 大阪大学 蛋白質研究所
生物種:
説明: PDBのデータをRDF (Resource Description Framework) 形式で提供するサービスです。一般的なブラウザであれば、PDB/RDF の各URLにアクセスするだけで、RDF/XML形式のファイル内容がHTML形... 詳細へ
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運用機関: The National Center for Biomedical Ontology
生物種: Bacteria
説明: JCMやNBRCなどの,菌株保存機関に蓄積されている菌株情報を記述するための統制語彙MCCV (Microbial Culture Collection Vocabulary)をOWLファイルで提供するDBです。 詳細へ
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運用機関: GlyTouCan Project Team
生物種:
説明: 糖鎖構造データを収録した国際糖鎖構造リポジトリです。単糖類組成からグリコシド結合形状などの明確な構造まで、構造に不一致がない限り世界的にユニークなアクセッション番号を付けて登録... 詳細へ
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運用機関: 公益財団法人野口研究所, 国立研究開発法人理化学研究所, 国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
説明: 糖質のNMR スペクトルを解析し、化学構造、化学シフト、カップリング定数、スペクトル、測定条件などを収録したデータベースです。物質名、炭素や水素の数、ケミカルシフトの有無などからデ... 詳細へ
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運用機関: 九州大学, 国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種: Caenorhabditis elegans
説明: 線虫の糖鎖に関連する遺伝子のデータベースです。各遺伝子のRNAiスクリーニングによるフェノタイプ情報や写真、ヒト遺伝子オーソログの情報を収録しています。遺伝子名、発現、フェノタイプ... 詳細へ
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運用機関: 東北大学東北メディカル・メガバンク機構
生物種: Homo sapiens
説明: 日本人健常者のゲノム配列を解析したデータベースです。東北メディカルメガバンクの行うゲノムコホート調査に参加した日本人の全ゲノム解析より得られた1塩基バリエーション (SNV) とその頻... 詳細へ
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運用機関: 東北大学東北メディカル・メガバンク機構
生物種: Homo sapiens
説明: 宮城県および岩手県を中心とした東北大震災の被災地を含む地域に住む健常者を対象として健康調査を実施するとともに、協力者の生体試料、健康情報、医療情報等を収集したバイオバンクの情報... 詳細へ
運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構
生物種:
説明: 国立研究開発法人科学技術振興機構(JST)が作成する有機化合物辞書データベース「日本化学物質辞書(日化辞)」のWeb版サイトです。有機化合物およびその混合物を対象とし、日本語名、英語... 詳細へ
運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所
生物種: Brachypodium distachyon
説明: ブラキオポディイウム(ミナトカモジグサ)の生育スケールを写真で示すデータベースです。乾燥種子から発芽、開花、結実など生育段階それぞれの写真と生育日数、葉、分蘖、節の数、生育条件... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種: Embryophyta
説明: 林木の遺伝資源に関するデータベースです。配布可能な遺伝資源の目録、生息域内保存林の情報、林木遺伝資源特性評価報告書などを収録しています。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
説明: 森林土壌博物館では森林土壌の各土壌群について、特徴や性質、断面の画像を掲載しています。また、森林土壌の調査方法について写真付きで解説している他、日本の森林土壌の研究や調査、分析... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
説明: 「酸性雨モニタリング」プロジェクトにおいて森林総合研究所の各支所で採取された降水および渓流水の水質データを公開しています。データベースを利用の際には、利用申請が必要です。 詳細へ
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運用機関: Macquarie University
生物種:
説明: UniCarbKBは糖タンパク質の糖鎖構造に関する情報を収集したデータベースです。 GlycoSuiteDBやEUROCarbDBという確立されたデータベースを基に糖鎖構造と報告されている糖タンパク質情報に関... 詳細へ
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運用機関: 慶應義塾大学 医学部 臨床遺伝学センター 幹細胞情報室
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: ヒト由来のiPS細胞や疾患iPS細胞、ES細胞などの幹細胞を中心に、細胞の基本情報を収録したデータベースです。由来組織、ベクター、PubMed、キーワード等、様々な項目から検索でき、誰もが簡... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所
生物種: Brachypodium distachyon
説明: ブラキオポディイウム(ミナトカモジグサ)のfull-length cDNAのデータベースです。解読したシークエンスとアノテーション情報を提供しています。各配列について、塩基配列、遺伝子構造の情... 詳細へ
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運用機関: 日本放線菌学会
生物種: Actinobacteria
説明: 日本放線菌学会が刊行した 『放線菌図鑑、"Atlas of Actinomycetes"』を元に編集した放線菌のデジタル図鑑です。顕微鏡写真と英語の説明、文献情報を収録しています。 レコードはセクション... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種: Homo sapiens
説明: 高齢者・障害者など、のべ3,000人以上を対象に資格・聴覚・触覚等の感覚特性を測定したデータベースです。年齢や障害の有無などの検索条件に応じて結果が表示されます。これらの特性データは... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
説明: インターネットを通じて、30,000以上の有機化合物のNMR、IR、MS、ESR、Ramanスペクトル画像を無料で公開するデータベースです。化合物名、分子式、分子量、CAS番号などのほか、元素数やスペ... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所
生物種: Arabidopsis thaliana
説明: シロイヌナズナのゲノムについて予測された遺伝子構造と機能の情報にフェノタイプや文献情報を加えたデータベースです。新規に予測された遺伝子の情報、タイリングアレイ、発現プロファイル... 詳細へ
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運用機関: 東北大学東北メディカル・メガバンク機構
生物種: Homo sapiens
説明: 東北メディカル・メガバンクの行うコホート調査に参加した日本人500人分の血漿についての多層オミックスデータベースです。被験者の基本情報、血漿に含まれる代謝物やタンパク質の組成・分布... 詳細へ
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運用機関: 東海大学医学部
生物種: Mammaliia
説明: 哺乳類の標準ゲノム配列に存在する内在性レトロウイルスなどウイルス由来の配列 (endogenous viral elements, EVE) のデータベースです。ヒトを含めた19種の哺乳類について、配列の位置、ア... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明: ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材向けの教材を提供するサイトです。科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンターが主催する統合データベース講習会の内容と資料... 詳細へ
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運用機関: RCSB PDB
生物種:
説明: RCSBのDavid S. Goodsell博士が社会で話題となっている事象に関わる分子を蛋白質構造データバンク(PDB)から選び、短く解説するサイトです。分子の機能と構造の紹介、健康や福祉への関わり... 詳細へ
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運用機関: National Center for Biotechnology Information
生物種: Homo sapiens
説明: ヒトゲノムの多様性と関連する疾患についての情報を収集し、自由に利用できるアーカイブとして提供しているデータベースです。多型の位置、遺伝子名、疾患との関わりなどを収録しています。... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所 播磨研究所
生物種: Thermus thermopiles HB8
説明: 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8の生体分子の高次構造および機能の解析データを収録したデータベースです。 ターゲット検索、文献検索が可能で、ゲノムマップ(ゲノム (TTHA)、メガプラ... 詳細へ